Výsledky vyhledávání
- 1.0585489 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Villena-Alemany, Cristian - Mujakić, Izabela - Fecskeová, L. K. - Woodhouse, J. - Auladell, A. - Dean, Jason Lawrence - Hanusová, Martina - Socha, M. - Gazulla, C. R. - Ruscheweyh, H. - Sunagawa, S. - Kavagutti, V. S. - Andrei, A. - Grossart, H. - Ghai, Rohit - Koblížek, Michal - Piwosz, Kasia
Phenology and ecological role of aerobic anoxygenic phototrophs in freshwaters.
Microbiome. Roč. 12, č. 1 (2024), č. článku 65. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28778X; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: semi-micro determination * peg-model * diversity * bacteria * gene * growth * populations * evolution * atlantic * database * Freshwaters * Aquatic microbial ecology * Microbial seasonal succession * Long-term sampling * Aerobic anoxygenic phototrophs * pufM gene * PEG model * Photoheterotrophs
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/articles/10.1186/s40168-024-01786-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353176 - 2.0583805 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kavagutti, Vinicius Silva - Bulzu, Paul-Adrian - Chiriac, Maria-Cecilia - Salcher, Michaela M. - Mukherjee, Indranil - Shabarova, Tatiana - Grujčič, Vesna - Mehrshad, Maliheh - Kasalický, Vojtěch - Andrei, A.S. - Jezberová, Jitka - Seďa, Jaromír - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 15. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR GA22-03662S; GA ČR(CZ) GA19-23261S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: bacterioplankton populations * seasonal succession * giant virus * chrysochromulina
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01451-4
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351803 - 3.0583794 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Park, Hongjae - Shabarova, Tatiana - Salcher, Michaela M. - Kosová, Lenka - Rychtecký, Pavel - Mukherjee, Indranil - Šimek, Karel - Porcal, Petr - Seďa, Jaromír - Znachor, Petr - Kasalický, Vojtěch
In the right place, at the right time: the integration of bacteria into the Plankton Ecology Group model.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 112. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR GA22-33245S; GA ČR GF22-35826K
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rna gene-sequences * niche separation * Freshwater reservoirs * Microbial communities * Spatiotemporal dynamics * Microdiversity * PEG model
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-023-01522-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351793 - 4.0583779 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Chiriac, Maria-Cecilia - Haber, Markus - Salcher, Michaela M.
Adaptive genetic traits in pelagic freshwater microbes.
Environmental Microbiology. Roč. 25, č. 3 (2023), s. 606-641. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR GA22-03662S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dissolved organic-matter * ribosomal-rna genes * polynucleobacter-necessarius * bacterial communities * planktonic flavobacteria * oxygenated hypolimnion * actinorhodopsin genes
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351781 - 5.0583665 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Mukherjee, Indranil - Szoke-Nagy, Tiberiu - Haber, Markus - Salcher, Michaela M. - Ghai, Rohit
Cryptic and ubiquitous aplastidic cryptophytes are key freshwater flagellated bacterivores.
The ISME Journal. Roč. 17, č. 1 (2023), s. 84-94. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR GF22-35826K; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protists * sequence * marine * cryptomonas * paramecium
Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impakt faktor: 11, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41396-022-01326-4
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351690 - 6.0569068 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vieira, Helena - Bagatini, I.L. - de Moraes, G.P. - Freitas, R.M. - Sarmento, H. - Bertilsson, S. - Vieira, A.A.H.
Regional factors as major drivers for microbial community turnover in tropical cascading reservoirs.
Frontiers in Microbiology. Roč. 13, Aug (2022), č. článku 831716. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ecological processes * microbial dispersion * microbial turnover * regional factors * tropical reservoirs
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.831716
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340760 - 7.0569062 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dirren-Pitsch, G. - Buhler, D. - Salcher, Michaela M. - Bassin, B. - Le Moigne, A. - Schuler, M. - Pernthaler, J. - Posch, T.
FISHing for ciliates: Catalyzed reporter deposition fluorescence in situ hybridization for the detection of planktonic freshwater ciliates.
Frontiers in Microbiology. Roč. 13, Dec (2022), č. článku 1070232. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: planktonic ciliates * card-fish * fluorescence in situ hybridization * lake water samples * quantitative protargol staining * ciliate quantification
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fmicb.2022.1070232
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340362 - 8.0563703 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bulzu, Paul-Adrian - Kavagutti, Vinicius Silva - Andrei, A.S. - Ghai, Rohit
The evolutionary kaleidoscope of Rhodopsins.
mSystems. Roč. 7, č. 5 (2022), č. článku 00405-22. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23261S; GA ČR(CZ) GA21-21990S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: rhodopsins * Alt-rhodopsins * AltRs * heliorhodopsins * optogenetics * metagenomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1128/msystems.00405-22
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340369 - 9.0561632 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Mukherjee, Indranil - Nedoma, Jiří - Paula, Caio César Pires de - Jezberová, Jitka - Sirová, Dagmara - Vrba, Jaroslav
CARD-FISH and prey tracer techniques reveal the role of overlooked flagellate groups as major bacterivores in freshwater hypertrophic shallow lakes.
Environmental Microbiology. Roč. 24, č. 9 (2022), s. 4256-4273. ISSN 1462-2912. E-ISSN 1462-2920
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-16554S; GA ČR(CZ) GA19-23261S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Protista * Bacteria * Flagellate
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1111/1462-2920.15846
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340269 - 10.0561249 - BFÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bartha, L. - Mandáková, T. - Kovařík, Aleš - Bulzu, Paul-Adrian - Rodde, N. - Mahelka, Václav - Lysák, M. A. - Fustier, M.-A. - Šafář, Jan - Cápal, Petr - Keresztes, L. - Banciu, H.L.
Intact ribosomal DNA arrays of Potentilla origin detected in Erythronium nucleus suggest recent eudicot-to-monocot horizontal transfer.
New Phytologist. Roč. 235, č. 3 (2022), s. 1246-1259. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA22-16826S
Institucionální podpora: RVO:68081707 ; RVO:60077344 ; RVO:67985939 ; RVO:61389030
Klíčová slova: Erythronium * horizontal gene transfer * internal transcribed spacer * lateral gene transfer
Obor OECD: Plant sciences, botany; Plant sciences, botany (BC-A); Plant sciences, botany (BU-J); Plant sciences, botany (UEB-Q)
Impakt faktor: 9.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/nph.18171
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0333946