Výsledky vyhledávání
- 1.0557781 - BFÚ 2023 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Bohalova, Natalia - Dobrovolná, Michaela - Brázda, Václav - Bidula, S.
Conservation and over-representation of G-quadruplex sequences in regulatory regions of mitochondrial DNA across distinct taxonomic sub-groups.
Biochimie. Roč. 194, MAR 2022 (2022), s. 28-34. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: r-loops * rna * sites * Mitochondria * Genome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908421002947?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339565 - 2.0555649 - BFÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Goswami, Pratik - Lexa, M. - Cerven, J. - Volna, A. - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav - Pečinka, P.
Letter to the Editor: Significant mutation enrichment in inverted repeat sites of new SARS-CoV-2 strains.
Briefings in Bioinformatics. Roč. 22, č. 5 (2021), č. článku bbab129. ISSN 1467-5463. E-ISSN 1477-4054
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: SARS-CoV-2 * mutations * inverted repeats
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.994, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bib/article/22/5/bbab129/6219140
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330106 - 3.0555382 - BFÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Goswami, Pratik - Bartas, M. - Lexa, M. - Bohalova, Natalia - Volna, A. - Cerven, J. - Cervenova, V. - Pečinka, P. - Špunda, Vladimír - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav
SARS-CoV-2 hot-spot mutations are significantly enriched within inverted repeats and CpG island loci.
Briefings in Bioinformatics. Roč. 22, č. 2 (2021), s. 1338-1345. ISSN 1467-5463. E-ISSN 1477-4054
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna * rna * methylation * genotype * protein * search
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UEK-B)
Impakt faktor: 13.994, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bib/article/22/2/1338/6042389
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329900 - 4.0554894 - BFÚ 2022 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Bohalova, Natalia - Cantara, Alessio - Bartas, M. - Kaura, P. - Šťastný, J. - Pečinka, P. - Fojta, Miroslav - Mergny, Jean-Louis - Brázda, Václav
Analyses of viral genomes for G-quadruplex forming sequences reveal their correlation with the type of infection.
Biochimie. Roč. 186, JUL 2021 (2021), s. 13-27. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: rna * replication * promoter * viruses * binding * zika * G-quadruplex
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.372, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0300908421000961?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329513 - 5.0554786 - BFÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Brázda, Václav - Volna, A. - Cerven, J. - Pečinka, P. - Zawacka-Pankau, J.
The Changes in the p53 Protein across the Animal Kingdom Point to Its Involvement in Longevity.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 16 (2021), č. článku 8512. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: life-history * cancer * dna * tp53 * senescence
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/22/16/8512
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329435 - 6.0551529 - BFÚ 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Bohalova, Natalia - Bowater, R. P.
New telomere to telomere assembly of human chromosome 8 reveals a previous underestimation of G-quadruplex forming sequences and inverted repeats.
Gene. Roč. 810, FEB 5 2022 (2022), č. článku 146058. ISSN 0378-1119. E-ISSN 1879-0038
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: messenger-rna * dna * G-quadruplex * Inverted repeat * Genome sequence of human chromosome 8 * Non-B DNA structures
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378111921006533?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340615 - 7.0544549 - BFÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Bartas, M. - Bowater, R. P.
Evolution of Diverse Strategies for Promoter Regulation.
Trends in Genetics. Roč. 37, č. 8 (2021), s. 730-744. ISSN 0168-9525. E-ISSN 1362-4555
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: inverted repeat sequences * g-quadruplex structures * dna g-quadruplex * non-b dna * gene-regulation * transposable elements
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 11.821, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168952521000846
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321397 - 8.0542171 - BFÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bohalova, Natalia - Cantara, Alessio - Bartas, M. - Kaura, P. - Šťastný, J. - Pečinka, P. - Fojta, Miroslav - Brázda, Václav
Tracing dsDNA Virus-Host Coevolution through Correlation of Their G-Quadruplex-Forming Sequences.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 7 (2021), č. článku 3433. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G-quadruplex * virus * bioinformatics * coevolution * host * dsDNA * G4Hunter
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/22/7/3433
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319647 - 9.0541574 - BFÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Monti, P. - Brázda, Václav - Bohalova, Natalia - Porubiakova, Otilia - Menichini, P. - Speciale, A. - Bocciardi, R. - Inga, A. - Fronza, G.
Evaluating the Influence of a G-Quadruplex Prone Sequence on the Transactivation Potential by Wild-Type and/or Mutant P53 Family Proteins through a Yeast-Based Functional Assay.
Genes. Roč. 12, č. 2 (2021), č. článku 277. E-ISSN 2073-4425
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: P53 family * yeast * G-quadruplex (G4) prone sequence * wild-type and mutant P53 * P63 proteins * transactivation potential
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.141, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4425/12/2/277
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319117 - 10.0539893 - BFÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Brázda, Václav - Kolomaznik, J. - Mergny, Jean-Louis - Šťastný, J.
G4Killer web application: a tool to design G-quadruplex mutations.
Bioinformatics. Roč. 36, č. 10 (2020), s. 3246-3247. ISSN 1367-4803. E-ISSN 1460-2059
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15548S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: G4Killer * web application * G-quadruplex mutations
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.937, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/10/3246/5716328
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317588