Výsledky vyhledávání
- 1.0582379 - BTÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Baselious, F. - Hilscher, S. - Robaa, D. - Bařinka, Cyril - Schutkowski, M. - Sippl, W.
Comparative Structure-Based Virtual Screening Utilizing Optimized AlphaFold Model Identifies Selective HDAC11 Inhibitor.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 25, č. 2 (2024), č. článku 1358. ISSN 1661-6596
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: AlphaFold * virtual screening * modelling * HDAC11
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/25/2/1358
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350507 - 2.0579099 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Z. - Mikešová, J. - Zessin, M. - Meleshin, M. - Nováková, Z. - Alquicer, Glenda - Kozikowski, A. - Sippl, W. - Bařinka, C. - Schutkowski, M.
Continuous Activity Assay for HDAC11 Enabling Reevaluation of HDAC Inhibitors.
ACS Omega. Roč. 4, č. 22 (2019), s. 19895-19904. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: histone deacetylase inhibitors * sir2 family * posttranslational modifications * fluorescent-probe * peptide arrays * in-vitro * substrate-specificity * metabolic-regulation * fluorogenic probe * activity profiles
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.870, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.9b02808
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347965 - 3.0574532 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Motlová, Lucia - Šnajdr, Ivan - Kutil, Zsofia - Andris, Erik - Ptáček, Jakub - Novotná, Adéla - Nováková, Zora - Havlínová, Barbora - Tueckmantel, W. - Dráberová, Helena - Majer, Pavel - Schutkowski, M. - Kozikowski, A. - Rulíšek, Lubomír - Bařinka, Cyril
Comprehensive Mechanistic View of the Hydrolysis of Oxadiazole-Based Inhibitors by Histone Deacetylase 6 (HDAC6).
ACS Chemical Biology. Roč. 18, č. 7 (2023), s. 1594-1610. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S; GA ČR(CZ) GA23-05940S; GA MŠMT(CZ) LUAUS23247
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242; EATRIS-CZ IV - 90253
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: BASIS-SETS * COSMO * ENERGY * REFINEMENT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.3c00212
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347139 - 4.0571923 - BTÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Zessin, M. - Meleshin, M. - Hilscher, S. - Schiene-Fischer, C. - Bařinka, Cyril - Jung, M. - Schutkowski, M.
Continuous Fluorescent Sirtuin Activity Assay Based on Fatty Acylated Lysines.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 24, č. 8 (2023), č. článku 7416. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: histone deacetylases * sirtuins * fluorescence quenching * sirtuin inhibitors
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/24/8/7416
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342895 - 5.0558797 - BTÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zessin, M. - Meleshin, M. - Praetorius, L. - Sippl, W. - Bařinka, Cyril - Schutkowski, M.
Uncovering Robust Delactoylase and Depyruvoylase Activities of HDAC Isoforms.
ACS Chemical Biology. Roč. 17, č. 6 (2022), s. 1364-1375. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: histone crotonylation * lysine * inhibitor * substrate
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschembio.1c00863
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0332584 - 6.0556614 - BTÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Zsofia - Meleshin, M. - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Schutkowski, M. - Bařinka, Cyril
Characterization of the class IIa histone deacetylases substrate specificity.
FASEB Journal. Roč. 36, č. 5 (2022), č. článku e22287. ISSN 0892-6638. E-ISSN 1530-6860
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: controls chondrocyte hypertrophy * catalytic-activity * acetylation * phosphorylation
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://faseb.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1096/fj.202101663R
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0332031 - 7.0555060 - BTÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Ibrahim, H. - Abdelsalam, M. - Zeyn, Y. - Zessin, M. - Mustafa, A. - Fischer, M. - Zeyen, P. - Sun, P. - Buelbuel, E. - Vecchio, A. - Erdmann, F. - Schmidt, M. - Robaa, D. - Bařinka, Cyril - Romier, C. - Schutkowski, M. - Kraemer, O. - Sippl, W.
Synthesis, Molecular Docking and Biological Characterization of Pyrazine Linked 2-Aminobenzamides as New Class I Selective Histone Deacetylase (HDAC) Inhibitors with Anti-Leukemic Activity.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 1 (2022), č. článku 369. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-31806S
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: EFFICIENT GENERATION * EPIGENETIC THERAPY * AM1-BCC MODEL
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/1/369
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0332121 - 8.0548916 - BTÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Zessin, M. - Meleshin, M. - Simic, Z. - Kalbas, D. - Arbach, M. - Gebhardt, P. - Melesina, J. - Liebscher, S. - Bordusa, F. - Sippl, W. - Bařinka, Cyril - Schutkowski, M.
Continuous Sirtuin/HDAC (histone deacetylase) activity assay using thioamides as PET (Photoinduced Electron Transfer)-based fluorescence quencher.
Bioorganic Chemistry. Roč. 117, DEC 2021 (2021). ISSN 0045-2068. E-ISSN 1090-2120
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: Sirtuin assay * HDAC11 assay * Thioamide
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.307, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0045206821008026?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0324965 - 9.0524504 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ustinova, Kseniya - Nováková, Zora - Saito, M. - Meleshin, M. - Mikesova, Jana - Kutil, Zsofia - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Schutkowski, M. - Matthias, P. - Bařinka, Cyril
The disordered N-terminus of HDAC6 is a microtubule-binding domain critical for efficient tubulin deacetylation.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 295, č. 9 (2020), s. 2614-2628. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: structure-function * protein-protein interaction * substrate specificity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.157, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.jbc.org/content/295/9/2614.full#ack-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0308861 - 10.0519605 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Zsofia - Mikesova, Jana - Zessin, M. - Meleshin, M. - Nováková, Zora - Alquicer, Glenda - Kozikowski, A. - Sippl, W. - Bařinka, Cyril - Schutkowski, M.
Continuous Activity Assay for HDAC11 Enabling Reevaluation of HDAC Inhibitors.
ACS Omega. Roč. 4, č. 22 (2019), s. 19895-19904. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: histone deacetylase inhibitors * sir2 family * POSTTRANSLATIONAL MODIFICATIONS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.870, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.9b02808
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305194