Výsledky vyhledávání
- 1.0572381 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Valach, M. - Moreira, S. - Petitjean, C. - Benz, Corinna - Butenko, Anzhelika - Flegontova, Olga - Nenarokova, Anna - Prokopchuk, Galina - Batstone, T. - Lapébie, P. - Lemogo, L. - Sarrasin, M. - Stretenowich, P. - Tripathi, Pragya - Yazaki, E. - Nara, T. - Henrissat, B. - Lang, B.F. - Gray, M.W. - Williams, T.A. - Lukeš, Julius - Burger, G.
Recent expansion of metabolic versatility in Diplonema papillatum, the model species of a highly speciose group of marine eukaryotes.
BMC BIOLOGY. Roč. 21, č. 1 (2023), č. článku 99. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA ČR(CZ) GX23-06479X; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) #9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Paradiplonema papillatum * Protists * Genome * Transcriptome * Proteome * Gene-family evolution * Lateral gene transfer * CAZymes * Feeding strategy * Geographical distribution * Ecological distribution
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-023-01563-9
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344455 - 2.0571500 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kachale, Ambar - Pavlíková, Z. - Nenarokova, Anna - Roithova, A. - Durante, Ignacio Miguel - Miletinova, P. - Záhonová, Kristýna - Nenarokov, Serafim - Votýpka, Jan - Horáková, Eva - Ross, R.L. - Yurchenko, V. - Beznosková, P. - Paris, Zdeněk - Valášek, L. S. - Lukeš, Julius
Short tRNA anticodon stem and mutant eRF1 allow stop codon reassignment.
Nature. Roč. 613, č. 7945 (2023), s. 751-+. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA20-11585S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GBMF9354
Program: Science
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: tRNA * eRF1 * codon
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 64.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41586-022-05584-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343713 - 3.0555255 - BC 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zakharova, A. - Saura, A. - Butenko, Anzhelika - Podešvová, L. - Warmusova, S. - Kostygov, A.Y. - Nenarokova, Anna - Lukeš, Julius - Opperdoes, F. R. - Yurchenko, V.
A New Model Trypanosomatid, Novymonas esmeraldas: Genomic Perception of Its Candidatus Pandoraea novymonadis Endosymbiont.
mBio. Roč. 12, č. 4 (2021), č. článku e01606-21. ISSN 2161-2129. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-07186S; GA ČR(CZ) GA21-09283S; GA MŠMT(CZ) LL1601
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: insect trypanosomatids * symbiotic bacterium * strigomonas-culicis * crithidia-deanei * evolution * leishmania * metabolism * parasite * expression * alignment * Trypanosomatidae * Leishmaniinae * bacterial endosymbiont * genomics * metabolism
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.786, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mBio.01606-21
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329779 - 4.0554452 - BC 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Paris, Zdeněk - Svobodová, Michaela - Kachale, Ambar - Horáková, Eva - Nenarokova, Anna - Lukeš, Julius
A mitochondrial cytidine deaminase is responsible for C to U editing of tRNA(Trp) to decode the UGA codon in Trypanosoma brucei.
RNA biology. Roč. 18, JUL 2021 (2021), s. 278-286. ISSN 1547-6286. E-ISSN 1555-8584
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-11585S; GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA20-07186S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: transfer-rna import * leishmania-tarentolae * adenosine-deaminase * protein-synthesis * anticodon * translation * identification * thiolation * stability * inosine * Mitochondrion * tryptophanyl tRNA * editing * cytidine deaminase * trypanosoma
Obor OECD: Parasitology
Impakt faktor: 4.766, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.tandfonline.com/doi/full/10.1080/15476286.2021.1940445
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329160 - 5.0537478 - BC 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hammond, Michael John - Nenarokova, Anna - Butenko, Anzhelika - Zoltner, M. - Dobáková, Eva - Field, Mark Christian - Lukeš, Julius
A Uniquely Complex Mitochondrial Proteome from Euglena gracilis.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 37, č. 8 (2020), s. 2173-2191. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1601; GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
GRANT EU: Wellcome Trust(GB) 204697/Z/16/Z
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: wax ester fermentation * trypanosoma-brucei * comprehensive analysis * alternative oxidase * micos complex * proteins * rna * biogenesis * genome * prediction * mitochondria * proteome * protist * Euglenozoa * Euglena gracilis
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 16.240, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/37/8/2173/5803078
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315270 - 6.0520373 - BC 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nenarokova, Anna - Záhonová, Kristýna - Krasilnikova, M. - Gahura, Ondřej - McCulloch, R. - Zíková, Alena - Yurchenko, V. - Lukeš, Julius
Causes and Effects of Loss of Classical Nonhomologous End Joining Pathway in Parasitic Eukaryotes.
mBio. Roč. 10, č. 4 (2019), č. článku e01541-19. ISSN 2161-2129. E-ISSN 2150-7511
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA ČR(CZ) GA18-17529S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LL1601
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: double-strand breaks * dna-repair * genome sequence * homologous recombination * telomere length * cell-cycle * ku * expression * genes * mechanism * DNA repair * genome size * parasite
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.784, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://mbio.asm.org/content/mbio/10/4/e01541-19.full.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305050 - 7.0519756 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kosakyan, Anush - Alama-Bermejo, Gema - Bartošová-Sojková, Pavla - Born-Torrijos, Ana - Šíma, Radek - Nenarokova, Anna - Eszterbauer, E. - Bartholomew, J. - Holzer, Astrid S.
Selection of suitable reference genes for gene expression studies in myxosporean (Myxozoa, Cnidaria) parasites.
Scientific Reports. Roč. 9, OCT 21 2019 (2019), č. článku 15073. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP505/12/G112; GA ČR(CZ) GP14-28784P; GA MŠMT(CZ) LTAUSA17201
GRANT EU: European Commission(XE) 634429 - ParaFishControl
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: real-time pcr * sphaerospora-molnari myxozoa * proliferative kidney-disease * ceratomyxa-shasta myxozoa * fresh-water polychaete * rainbow-trout * myxobolus-cerebralis * housekeeping genes * rt-pcr * differential expression
Obor OECD: Veterinary science
Impakt faktor: 3.998, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-019-51479-0.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304748 - 8.0519415 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ebenezer, N.D. - Zoltner, M. - Burrell, A. - Nenarokova, Anna - Vanclová-Novák, A.M.G. - Prasad, B. - Soukal, P. - Santana-Molina, C. - O'Neill, E. - Nankissoor, N.N. - Vadakedath, N. - Daiker, V. - Obado, S. - Silva-Pereira, S. - Jackson, A.P. - Devos, D.P. - Lukeš, Julius - Lebert, M. - Vaughan, S. - Hampl, V. - Carrington, M. - Ginger, M. L. - Dacks, J.B. - Kelly, S. - Field, Mark Christian
Transcriptome, proteome and draft genome of Euglena gracilis.
BMC BIOLOGY. Roč. 17, FEB 7 2019 (2019), č. článku 11. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: trypanosoma-brucei * gene-expression * signal-transduction * likely common * tubulin genes * beta-tubulin * sequence * evolution * biosynthesis * annotation * Euglena gracilis * Transcriptome * Cellular evolution * Plastid * Horizontal gene transfer * Gene architecture * Splicing * Secondary endosymbiosis * Excavata
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 6.765, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12915-019-0626-8
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304387 - 9.0498698 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Harmer, J. - Yurchenko, Vyacheslav - Nenarokova, Anna - Lukeš, Julius - Ginger, M. L.
Farming, slaving and enslavement: histories of endosymbioses during kinetoplastid evolution.
Parasitology. Roč. 145, č. 10 (2018), s. 1311-1323. ISSN 0031-1820. E-ISSN 1469-8161
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-18699S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Angomonas deanei * Candidatus Kinetoplastibacterium * cytostome * Kentomonas * Novymonas esmeraldas * Pandoraea
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.456, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0290981 - 10.0489780 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Schwelm, A. - Badstöber, J. - Bulman, S. - Desoignies, N. - Etemadi, M. - Falloon, R.E. - Gachon, C.M.M. - Legreve, A. - Lukeš, Julius - Merz, U. - Nenarokova, Anna - Strittmatter, M. - Sullivan, B.K. - Neuhauser, S.
Not in your usual Top 10: protists that infect plants and algae.
Molecular Plant Pathology. Roč. 19, č. 4 (2018), s. 1029-1044. ISSN 1464-6722. E-ISSN 1364-3703
Grant CEP: GA ČR GA15-21974S; GA MŠMT LL1601
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: algae * protist * plant pathogens * plasmodiophorids * stramenopiles * phytomonas * phytomyxae
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.379, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0291084