Výsledky vyhledávání
- 1.0583805 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kavagutti, Vinicius Silva - Bulzu, Paul-Adrian - Chiriac, Maria-Cecilia - Salcher, Michaela M. - Mukherjee, Indranil - Shabarova, Tatiana - Grujčič, Vesna - Mehrshad, Maliheh - Kasalický, Vojtěch - Andrei, A.S. - Jezberová, Jitka - Seďa, Jaromír - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Šimek, Karel - Ghai, Rohit
High-resolution metagenomic reconstruction of the freshwater spring bloom.
Microbiome. Roč. 11, č. 1 (2023), č. článku 15. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA21-21990S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR GA22-03662S; GA ČR(CZ) GA19-23261S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: bacterioplankton populations * seasonal succession * giant virus * chrysochromulina
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-022-01451-4
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351803 - 2.0538633 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Mukherjee, Indranil - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Posch, T. - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M.
Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 96, č. 10 (2020), č. článku fiaa121. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ciliates * bacterivorous and predatory flagellates * Cercozoa * Cryptophyceae * freshwater microbial food webs * Katablepharidacea
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.194, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa121
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316400Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SIMEK FEMS Microbiol Ecol 2020.pdf 0 3.9 MB Autorský preprint povolen - 3.0510169 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kavagutti, Vinicius Silva - Andrei, Adrian-Stefan - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M. - Ghai, Rohit
Phage-centric ecological interactions in aquatic ecosystems revealed through ultra-deep metagenomics.
Microbiome. Roč. 7, č. 1 (2019), č. článku 135. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GA17-04828S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: FRESH-WATER ACTINOBACTERIA * RIBOSOMAL-RNA GENES * COMMUNITY COMPOSITIO
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11.607, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://microbiomejournal.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s40168-019-0752-0
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300830 - 4.0509916 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bulzu, P.A. - Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Inoue, K. - Kandori, H. - Béja, O. - Ghai, Rohit - Banciu, H.L.
Casting light on Asgardarchaeota metabolism in a sunlit microoxic niche.
Nature Microbiology. Roč. 4, č. 7 (2019), s. 1129-1137. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * archaea * origin * prediction * evolution
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 15.540, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41564-019-0404-y
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300521 - 5.0509912 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vavourakis, C. D. - Mehrshad, Maliheh - Balkema, C. - van Hall, R. - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit - Sorokin, D. Y. - Muyzer, G.
Metagenomes and metatranscriptomes shed new light on the microbial-mediated sulfur cycle in a Siberian soda lake.
BMC BIOLOGY. Roč. 17, č. 1 (2019), č. článku 69. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) L200961651; AV ČR(CZ) MSM200961801
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů; Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Soda lake * Haloalkaliphiles * Metagenomics * Metatranscriptomics * Thiosulfate
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.765, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12915-019-0688-7
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300506 - 6.0504973 - BC 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Andrei, Adrian-Stefan - Salcher, Michaela M. - Mehrshad, Maliheh - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Ghai, Rohit
Niche-directed evolution modulates genome architecture in freshwater Planctomycetes.
The ISME Journal. Roč. 13, č. 4 (2019), s. 1056-1071. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200961801; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: multiple sequence alignment * bacterioplankton community * oxygenated hypolimnion
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.180, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41396-018-0332-5.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297231 - 7.0495167 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vavourakis, C. D. - Andrei, Adrian-Stefan - Mehrshad, Maliheh - Ghai, Rohit - Sorokin, D. Y. - Muyzer, G.
A metagenomics roadmap to the uncultured genome diversity in hypersaline soda lake sediments.
Microbiome. Roč. 6, SEP (2018), č. článku 168. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: soda lake sediments * metagenomics * Haloalkaliphilic extremophiles * Candidate Phyla Radiation
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 10.465, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288293 - 8.0495155 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mehrshad, Maliheh - Rodriguez-Valera, F. - Amoozegar, M.A. - López-García, P. - Ghai, Rohit
The enigmatic SAR202 cluster up close: shedding light on a globally distributed dark ocean lineage involved in sulfur cycling.
The ISME Journal. Roč. 12, č. 3 (2018), s. 655-668. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: sulfate-reducing prokaryotes * nitrite-oxidizing bacterium * ribosomal-rna genes * phylum chloroflexi
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.493, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288295 - 9.0495144 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mehrshad, Maliheh - Salcher, M.M. - Okazaki, Y. - Nakano, S. - Šimek, Karel - Andrei, Adrian-Stefan - Ghai, Rohit
Hidden in plain sight-highly abundant and diverse planktonic freshwater Chloroflexi.
Microbiome. Roč. 6, OCT (2018), č. článku 176. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR GA17-04828S; GA ČR(CZ) GA13-00243S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) JSPS-17-17; AV ČR(CZ) L200961651
Program: Bilaterální spolupráce; Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Chloroflexi * freshwater ecology * metagenomics * CARD-FISH
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 10.465, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288294 - 10.0481807 - BC 2018 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Cabello-Yeves, P.J. - Ghai, Rohit - Mehrshad, Maliheh - Picazo, A. - Camacho, A. - Rodriguez-Valera, F.
Reconstruction of diverse verrucomicrobial genomes from metagenome datasets of freshwater reservoirs.
Frontiers in Microbiology. Roč. 8, Nov (2017), č. článku 2131. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: freshwater Verrucomicrobia * metagenomics * rhodopsin * nitrogen fixation * genome streamlining
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.019, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0277284