Výsledky vyhledávání
- 1.0517124 - ÚFCH JH 2020 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Poojari, C. - Wilkosz, N. - Lira, R. B. - Dimova, R. - Jurkiewicz, Piotr - Petka, R. - Kepczynski, M. - Róg, T.
Behavior of the DPH fluorescence probe in membranes perturbed by drugs.
Chemistry and Physics of Lipids. Roč. 223, SEP 2019 (2019), č. článku 104784. ISSN 0009-3084. E-ISSN 1873-2941
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: particle mesh ewald * aa force-field * biophysical properties * model membranes * lipid-membranes * staphylococcus-aureus * unilamellar vesicles * cholesterol * dynamics * dppc * 1,6-diphenyl-1,3,5-hexatriene * Lipid bilayers * Molecular dynamics simulations * Fluorescence anisotropy
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.094, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0302414Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0517124.pdf 0 1.8 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 2.0503022 - ÚOCHB 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Enkavi, G. - Javanainen, Matti - Kulig, W. - Róg, T. - Vattulainen, I.
Multiscale Simulations of Biological Membranes: The Challenge To Understand Biological Phenomena in a Living Substance.
Chemical Reviews. Roč. 119, č. 9 (2019), s. 5607-5774. ISSN 0009-2665. E-ISSN 1520-6890
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * cellular functions * membrane complexity
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 52.760, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.chemrev.8b00538
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296595 - 3.0490133 - ÚOCHB 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Magarkar, Aniket - Parkkila, P. - Viitala, T. - Lajunen, T. - Mobarak, E. - Licari, G. - Cramariuc, O. - Vauthey, E. - Róg, T. - Bunker, A.
Membrane bound COMT isoform is an interfacial enzyme: general mechanism and new drug design paradigm.
Chemical Communications. Roč. 54, č. 28 (2018), s. 3440-3443. ISSN 1359-7345. E-ISSN 1364-548X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: catechol-O-methyltransferase * molecular dynamics simulations * Parkinson's disease
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 6.164, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0284422 - 4.0481749 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Danne, R. - Poojari, C. - Martinez-Seara, Hector - Rissanen, S. - Lolicato, F. - Róg, T. - Vattulainen, I.
doGlycans-Tools for Preparing Carbohydrate Structures for Atomistic Simulations of Glycoproteins, Glycolipids, and Carbohydrate Polymers for GROMACS.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 57, č. 10 (2017), s. 2401-2406. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * GROMOS force field * cellulose nanofibrils
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.804, rok: 2017
http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acs.jcim.7b00237
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0277434 - 5.0475933 - ÚOCHB 2018 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Magarkar, Aniket - Róg, T. - Bunker, A.
A computational study suggests that replacing PEG with PMOZ may increase exposure of hydrophobic targeting moiety.
European Journal of Pharmaceutical Sciences. Roč. 103, SI (2017), s. 128-135. ISSN 0928-0987. E-ISSN 1879-0720
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: polyoxazolines * targeted delivery * PEGylation * liposome * nanomedicine * molecular dynamics
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 3.466, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0272513 - 6.0475201 - ÚEB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bilkova, E. - Pleskot, Roman - Rissanen, S. - Sun, S. - Czogalla, A. - Cwiklik, Lukasz - Róg, T. - Vattulainen, I. - Cremer, P. S. - Jungwirth, P. - Coskun, U.
Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 11 (2017), s. 4019-4024. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA ČR GA13-19073S
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:61388955
Klíčová slova: membrane * calcium ions * PIP2 * molecular dynamics
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 14.357, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0272052Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0475201 .pdf 5 1.8 MB open access Vydavatelský postprint povolen 2017_Bilkova_JOURNAL OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY_4019.pdf 4 1.8 MB Jiná povolen - 7.0475174 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bilkova, E. - Pleskot, Roman - Rissanen, S. - Sun, S. - Czogalla, A. - Cwiklik, Lukasz - Róg, T. - Vattulainen, I. - Cremer, P. S. - Jungwirth, Pavel - Coskun, U.
Calcium Directly Regulates Phosphatidylinositol 4,5-Bisphosphate Headgroup Conformation and Recognition.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 139, č. 11 (2017), s. 4019-4024. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-01074S
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: membrane * calcium ions * PIP2 * molecular dynamics
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 14.357, rok: 2017
http://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/jacs.6b11760
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0272021Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0475174.pdf 9 1.8 MB Vydavatelský postprint povolen - 8.0469474 - ÚOCHB 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Dhawan, V. - Magarkar, Aniket - Joshi, G. - Makhija, D. - Jain, A. - Shah, J. - Reddy, B. V. V. - Krishnapriya, M. - Róg, T. - Bunker, A. - Jagtap, A. - Nagarsenker, M.
Stearylated cycloarginine nanosystems for intracellular delivery - simulations, formulation and proof of concept.
RSC Advances. Roč. 6, č. 114 (2016), s. 113538-113550. E-ISSN 2046-2069
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cell-penetrating peptides * anti-angiogenic therapy * molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.108, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0267264