Výsledky vyhledávání
- 1.0505423 - ÚOCHB 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan
Description of halogen bonding in semiempirical quantum-mechanical and self-consistent charge density-functional tight-binding methods.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 40, č. 17 (2019), s. 1633-1642. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: halogen bond * sigma-hole * electrostatic potential surface * semiempirical methods * DFTB
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.976, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1002/jcc.25816
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296929 - 2.0501585 - ÚOCHB 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kříž, Kristian - Řezáč, Jan
Reparametrization of the COSMO Solvent Model for Semiempirical Methods PM6 and PM7.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 59, č. 1 (2019), s. 229-235. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: solvation free energies * electronic structure * NDDO approximations
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.549, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.8b00681
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296379 - 3.0490170 - ÚOCHB 2019 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Pecina, Adam - Brynda, Jiří - Vrzal, Lukáš - Gnanasekaran, Ramachandran - Hořejší, M. - Eyrilmez, Saltuk M. - Řezáč, Jan - Lepšík, Martin - Řezáčová, Pavlína - Hobza, Pavel - Majer, Pavel - Veverka, Václav - Fanfrlík, Jindřich
Ranking Power of the SQM/COSMO Scoring Function on Carbonic Anhydrase II-Inhibitor Complexes.
ChemPhysChem. Roč. 19, č. 7 (2018), s. 873-879. ISSN 1439-4235. E-ISSN 1439-7641
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y; GA MŠMT(CZ) LO1304; GA MŠMT(CZ) LK11205; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: binding affinities * crystallography * lead optimization * quantum mechanics * scoring function
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.077, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0284458 - 4.0489840 - ÚOCHB 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Miriyala, Vijay Madhav - Řezáč, Jan
Testing Semiempirical Quantum Mechanical Methods on a Data Set of Interaction Energies Mapping Repulsive Contacts in Organic Molecules.
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 122, č. 10 (2018), s. 2801-2808. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: noncovalent interactions * NDDO approximations * parameters
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.641, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0284172 - 5.0489837 - ÚOCHB 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Bím, Daniel - Gutten, Ondrej - Rulíšek, Lubomír
Toward Accurate Conformational Energies of Smaller Peptides and Medium-Sized Macrocycles: MPCONF196 Benchmark Energy Data Set.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 14, č. 3 (2018), s. 1254-1266. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-24155S; GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: density functional theory * main group thermochemistry * generalized gradient approximation
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.313, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0284170 - 6.0487122 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ajani, Haresh - Pecina, Adam - Eyrilmez, Saltuk M. - Fanfrlík, Jindřich - Haldar, Susanta - Řezáč, Jan - Hobza, Pavel - Lepšík, Martin
Superior Performance of the SQM/COSMO Scoring Functions in Native Pose Recognition of Diverse Protein-Ligand Complexes in Cognate Docking.
ACS Omega. Roč. 2, č. 7 (2017), s. 4022-4029. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016; GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: aldose reductase inhibition * biological applications * mechanical calculations
Obor OECD: Physical chemistry
https://pubs.acs.org/doi/full/10.1021/acsomega.7b00503
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0281802 - 7.0480913 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan
Empirical Self-Consistent Correction for the Description of Hydrogen Bonds in DFTB3.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 13, č. 10 (2017), s. 4804-4817. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: density functional theory * tight-binding method * including dispersion corrections
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.399, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0276579 - 8.0477880 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hostaš, Jiří - Řezáč, Jan
Accurate DFT-D3 Calculations in a Small Basis Set.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 13, č. 8 (2017), s. 3575-3585. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: density functional theory * molecular orbital methods * quantum chemical methods
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.399, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0274099 - 9.0475333 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sedlák, Robert - Řezáč, Jan
Empirical D3 Dispersion as a Replacement for ab lnitio Dispersion Terms in Density Functional Theory-Based Symmetry-Adapted Perturbation Theory.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 13, č. 4 (2017), s. 1638-1646. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: intermolecular interaction energies * der Waals interactions * basis set convergence
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.399, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0272161 - 10.0475259 - ÚOCHB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Miriyala, Vijay Madhav - Řezáč, Jan
Description of Non-Covalent Interactions in SCC-DFTB Methods.
Journal of Computational Chemistry. Roč. 38, č. 10 (2017), s. 688-697. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ16-11321Y
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: density functional tight binding * DFTB3 * non-covalent interactions * dispersion correction * hydrogen bonding correction
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.221, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0272103