Výsledky vyhledávání
- 1.0543807 - MBÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Filandrová, Růžena - Vališ, Karel - Černý, Jiří - Chmelík, Josef - Slavata, Lukáš - Fiala, Jan - Rosůlek, Michal - Kavan, Daniel - Man, Petr - Chum, Tomáš - Cebecauer, Marek - Fabris, D. - Novák, Petr
Motif orientation matters: Structural characterization of TEAD1 recognition of genomic DNA.
Structure. Roč. 29, č. 4 (2021), s. 345-356. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LO1509; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015043
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388955
Klíčová slova: TEAD1 * genomic DNA * M-CAT motifs * ChIP-qPCR * presence of M-CAT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biophysics (BTO-N); Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 5.871, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0969212620304652?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320930Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0543807preprint.pdf 5 2.2 MB Autorský preprint povolen - 2.0533337 - ÚOCHB 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lux, Vanda - Brouns, T. - Čermáková, Kateřina - Srb, Pavel - Fábry, M. - Mádlíková, Marcela - Hořejší, M. - Kukačka, Zdeněk - Novák, Petr - Kugler, Michael - Brynda, Jiří - DeRijck, J. - Christ, F. - Debyser, Z. - Veverka, Václav
Molecular Mechanism of LEDGF/p75 Dimerization.
Structure. Roč. 28, č. 12 (2020), s. 1288-1299. ISSN 0969-2126. E-ISSN 1878-4186
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-06357S; GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LO1304; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 731077 - EU_FT-ICR_MS
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Klíčová slova: protein-protein interaction * mixed-lineage leukemia * epigenetics transcription * PSIP1 * domain swapping * eletrostatic stapling * paramagnetic NMR
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 5.006, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.str.2020.08.012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0311763 - 3.0519095 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Slavata, Lukáš - Chmelík, Josef - Kavan, Daniel - Filandrová, Růžena - Fiala, Jan - Rosůlek, Michal - Mrázek, Hynek - Kukačka, Zdeněk - Vališ, Karel - Man, Petr - Miller, M. - McIntyre, W. - Fabris, D. - Novák, Petr
MS-Based Approaches Enable the Structural Characterization of Transcription Factor/DNA Response Element Complex.
Biomolecules. Roč. 9, č. 10 (2019), č. článku 535. E-ISSN 2218-273X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LO1509
GRANT EU: European Commission(XE) 731077 - EU_FT-ICR_MS; European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS; European Commission(CZ) FP7WeNMR-261572; European Commission(CZ) H2020 West-Life 675858
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: transcription factor * protein * protein-nucleic acid cross-linking
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.082, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2218-273X/9/10/535
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304158Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 163_MS-Based Approaches Enable the Structural Characterization.pdf 5 4 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 4.0518684 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Rosůlek, Michal - Darebná, Petra - Pompach, Petr - Slavata, Lukáš - Novák, Petr
Proteases Immobilization for In Situ Time-Limited Proteolysis on MALDI Chips.
Catalysts. Roč. 9, č. 10 (2019), č. článku 833. E-ISSN 2073-4344
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: protease * enzyme * ambient ion landing
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.520, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4344/9/10/833
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303757 - 5.0510318 - MBÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zeman, Jakub - Itoh, Y. - Kukačka, Zdeněk - Rosůlek, Michal - Kavan, Daniel - Kouba, Tomáš - Jansen, Myrte Esmeralda - Mohammad, Mahabub Pasha - Novák, Petr - Valášek, Leoš Shivaya
Binding of eIF3 in complex with eIF5 and eIF1 to the 40S ribosomal subunit is accompanied by dramatic structural changes.
Nucleic Acids Research. Roč. 47, č. 15 (2019), s. 8282-8300. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-06238S; GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2015043
GRANT EU: European Commission(XE) 823839 - EPIC-XS; European Commission(CZ) EPIC-XS
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: initiation-factor 3 * rna recognition motif * start codon recognition
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 11.502, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/47/15/8282/5530675
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300829Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 128_Binding of eIF3 in complex with.pdf 5 15.8 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 6.0508013 - MBÚ 2020 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hernychová, Lucie - Rosůlek, Michal - Kádek, Alan - Mareška, V. - Chmelík, Josef (ed.) - Adámková, Ljubina - Grobárová, Valeria - Šebesta, O. - Kukačka, Zdeněk - Skála, Kristián - Spiwok, V. - Černý, J. - Novák, Petr
The C-type lectin-like receptor Nkrp1b: Structural proteomics reveals features affecting protein conformation and interactions.
Journal of Proteomics. Roč. 196, MAR 30 (2019), s. 162-172. ISSN 1874-3919. E-ISSN 1876-7737
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging - 90062
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Structural mass spectrometry * Chemical cross-linking * Ion mobility
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.509, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S187439191830397X?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0298974 - 7.0505686 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Adámková, Ljubina - Kvíčalová, Zuzana - Rozbeský, Daniel - Kukačka, Zdeněk - Adámek, David - Cebecauer, Marek - Novák, Petr
Oligomeric Architecture of Mouse Activating Nkrp1 Receptors on Living Cells.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 20, č. 8 (2019), č. článku 1884. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LD15089; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:61388955
Klíčová slova: Nkrp1 * dimerization * Forster resonance energy transfer
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 4.556, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/20/8/1884
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297120Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0505686.pdf 2 3 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 8.0505591 - MBÚ 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Nováková, Jana - Talacko, P. - Novák, Petr - Vališ, Karel
The MEK-ERK-MST1 Axis Potentiates the Activation of the Extrinsic Apoptotic Pathway during GDC-0941 Treatment in Jurkat T Cells.
Cells. Roč. 8, č. 2 (2019), č. článku 191. E-ISSN 2073-4409
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MPO(CZ) EG17_107/0011449
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Hippo/MST1 * caspase * apoptosis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.366, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4409/8/2/191
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297061Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 163_The MEK-ERK-MST1 Axis Potentiates the Activation.pdf 4 3.4 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 9.0491223 - ÚMG 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Škerlová, Jana - Bláha, J. - Pachl, Petr - Hofbauerová, Kateřina - Kukačka, Zdeněk - Man, Petr - Pompach, Petr - Novák, Petr - Otwinowski, Z. - Brynda, Jiří - Vaněk, O. - Řezáčová, Pavlína
Crystal structure of native beta-N-acetylhexosaminidase isolated from Aspergillus oryzae sheds light onto its substrate specificity, high stability, and regulation by propeptide.
FEBS Journal. Roč. 285, č. 3 (2018), s. 580-598. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LO1304; GA MŠMT(CZ) LO1509; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT LG14009; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) LD15089; GA ČR(CZ) GA15-05677S; GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA ČR(CZ) GA15-15181S
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:61388971
Klíčová slova: active pocket * carbohydrate biotechnology * glycosylation * mass spectrometry * propeptide * X-ray crystallography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (MBU-M)
Impakt faktor: 4.739, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0285263 - 10.0489608 - MBÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rozbeský, Daniel - Rosůlek, Michal - Kukačka, Zdeněk - Chmelík, Josef - Man, Petr - Novák, Petr
Impact of Chemical Cross-Linking on Protein Structure and Function.
Analytical Chemistry. Roč. 90, č. 2 (2018), s. 1104-1113. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-24309S; GA MŠMT(CZ) LH15010; GA MŠMT(CZ) LD15089; GA MŠMT(CZ) LO1509; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) BM1403
GRANT EU: European Commission(CZ) BM1403
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: TRANSFORM MASS-SPECTROMETRY * DISTANCE GEOMETRY METHOD * TOP-DOWN APPROACH
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.350, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0284071Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 163_Impact of Chemical Cross-Linking on Protein.pdf 3 5.5 MB Vydavatelský postprint vyžádat