Výsledky vyhledávání
- 1.0541383 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Noonepalle, S. - Shen, S. - Ptáček, Jakub - Tavares, M. T. - Zhang, G. - Stránský, Jan - Pavlíček, Jiří - Ferreira, G. M. - Hadley, M. - Pelaez, G. - Bařinka, Cyril - Kozikowski, A. P. - Villagra, A.
Rational Design of Suprastat: A Novel Selective Histone Deacetylase 6 Inhibitor with the Ability to Potentiate Immunotherapy in Melanoma Models.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 63, č. 18 (2020), s. 10246-10262. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: antitumor-activity * force-field * hdac6 * acetylation * gromacs * charmm * implementation * metabolism * discovery * maps
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 7.446, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.0c00567
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318945 - 2.0534650 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shen, S. - Svoboda, Michal - Zhang, G. - Cavasin, M. A. - Motlová, Lucia - McKinsey, T. A. - Eubanks, J. H. - Bařinka, Cyril - Kozikowski, A. P.
Structural and in Vivo Characterization of Tubastatin A, a Widely Used Histone Deacetylase 6 Inhibitor.
ACS Medicinal Chemistry Letters. Roč. 11, č. 5 (2020), s. 706-712. ISSN 1948-5875
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: mouse model * hdac6 * tubulin * acetylation
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 4.345, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acsmedchemlett.9b00560
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0312823 - 3.0524504 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ustinova, Kseniya - Nováková, Zora - Saito, M. - Meleshin, M. - Mikesova, Jana - Kutil, Zsofia - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Schutkowski, M. - Matthias, P. - Bařinka, Cyril
The disordered N-terminus of HDAC6 is a microtubule-binding domain critical for efficient tubulin deacetylation.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 295, č. 9 (2020), s. 2614-2628. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: structure-function * protein-protein interaction * substrate specificity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.157, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.jbc.org/content/295/9/2614.full#ack-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0308861 - 4.0520948 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kozikowski, A. P. - Shen, S. - Pardo, M. - Tayares, M. T. - Szarics, D. - Benoy, V. - Zimprich, Ch. A. - Kutil, Zsofia - Zhang, G. - Bařinka, Cyril - Robers, M. B. - Van den Bosch, L. - Eubanks, J. H. - Jope, R. S.
Brain Penetrable Histone Deacetylase 6 Inhibitor SW-100 Ameliorates Memory and Learning Impairments in a Mouse Model of Fragile X Syndrome.
ACS Chemical Neuroscience. Roč. 10, č. 3 (2019), s. 1679-1695. ISSN 1948-7193. E-ISSN 1948-7193
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: fmr1 knockout mice * mental-retardation protein * tubulin acetylation * metabotropic glutamate * negative regulator
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.486, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acschemneuro.8b00600
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305622 - 5.0519605 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Zsofia - Mikesova, Jana - Zessin, M. - Meleshin, M. - Nováková, Zora - Alquicer, Glenda - Kozikowski, A. - Sippl, W. - Bařinka, Cyril - Schutkowski, M.
Continuous Activity Assay for HDAC11 Enabling Reevaluation of HDAC Inhibitors.
ACS Omega. Roč. 4, č. 22 (2019), s. 19895-19904. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: histone deacetylase inhibitors * sir2 family * POSTTRANSLATIONAL MODIFICATIONS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.870, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.9b02808
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305194 - 6.0519596 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zessin, M. - Kutil, Zsofia - Meleshin, M. - Nováková, Zora - Ghazy, E. - Kalbas, D. - Marek, M. - Romier, Ch. - Sippl, W. - Bařinka, Cyril - Schutkowski, M.
One-Atom Substitution Enables Direct and Continuous Monitoring of Histone Deacylase Activity.
Biochemistry. Roč. 58, č. 48 (2019), s. 4777-4789. ISSN 0006-2960
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: fluorescence quenching probes * epsilon-thioacetyl-lysine * deacetylase assay * sir2 family
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.865, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.biochem.9b00786
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304590 - 7.0510407 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Wu, H. - Yang, K. - Zhang, Z. - Leisten, E.D. - Li, Z. - Xie, H. - Liu, J. - Smith, K. A. - Nováková, Zora - Bařinka, Cyril - Tang, W.
Development of Multifunctional Histone Deacetylase 6 Degraders with Potent Antimyeloma Activity.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 62, č. 15 (2019), s. 7042-7057. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: INDUCED PROTEIN-DEGRADATION * E3 UBIQUITIN LIGASE * MULTIPLE-MYELOMA
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 6.205, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.9b00516
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300924 - 8.0510398 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shen, S. - Hadley, M. - Ustinova, Kseniya - Pavlíček, Jiří - Knox, T. - Noonepalle, S. - Tavares, M. T. - Zimprich, Ch. A. - Zhang, A. - Robers, M. B. - Bařinka, Cyril - Kozikowski, A. P. - Villagra, A.
Discovery of a New Isoxazole-3-hydroxamate-Based Histone Deacetylase 6 Inhibitor SS-208 with Antitumor Activity in Syngeneic Melanoma Mouse Models.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 62, č. 18 (2019), s. 8557-8577. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: HDAC6-SELECTIVE INHIBITORS * ACQUIRED-RESISTANCE * HDAC6 INHIBITOR
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 6.205, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.9b00946
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300905 - 9.0505012 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Zsofia - Škultétyová, Ĺubica - Rauh, D. - Meleshin, M. - Šnajdr, Ivan - Nováková, Zora - Mikesova, Jana - Pavlíček, Jiří - Hadzima, Martin - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Majer, Pavel - Schutkowski, M. - Bařinka, Cyril
The unraveling of substrate specificity of histone deacetylase 6 domains using acetylome peptide microarrays and peptide libraries.
FASEB Journal. Roč. 33, č. 3 (2019), s. 4035-4045. ISSN 0892-6638. E-ISSN 1530-6860
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: human acetylome * deacylation * deformylation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 4.966, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://faseb.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1096/fj.201801680R
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296540 - 10.0499314 - BTÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Porter, N. J. - Shen, S. - Bařinka, Cyril - Kozikowski, A. P. - Christianson, D. W.
Molecular Basis for the Selective Inhibition of Histone Deacetylase 6 by a Mercaptoacetamide Inhibitor.
ACS Medicinal Chemistry Letters. Roč. 9, č. 12 (2018), s. 1301-1305. ISSN 1948-5875
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: Protein crystallography * enzyme inhibitor * zinc-binding group
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 3.737, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0291546