Výsledky vyhledávání
- 1.0583248 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Husťáková, Blanka - Trundová, Mária - Adámková, Kristýna - Koval, Tomáš - Dušková, Jarmila - Dohnálek, Jan
A highly active S1-P1 nuclease from the opportunistic pathogen iStenotrophomonas maltophilia/i cleaves c-di-GMP.
FEBS Letters. Roč. 597, č. 16 (2023), s. 2103-2118. ISSN 0014-5793. E-ISSN 1873-3468
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA MŠMT EF15_003/0000447
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: n-glycosylation * phosphodiesterase * mechanism * enzyme * S1-P1 nuclease
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/1873-3468.14683
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351252 - 2.0575356 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sudzinová, Petra - Šanderová, Hana - Koval, Tomáš - Skálová, Tereza - Borah, Nabajyoti - Hnilicová, Jarmila - Kouba, Tomáš - Dohnálek, Jan - Krásný, Libor
What the Hel: recent advances in understanding rifampicin resistance in bacteria.
FEMS Microbiology Reviews. Roč. 47, č. 6 (2023), č. článku fuac051. ISSN 0168-6445. E-ISSN 1574-6976
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT EF15_003/0000447
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: rifampicin * antibiotics * resistance * bacteria * RNA polymerase * HelD * HelR
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BTO-N); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 11.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsre/advance-article/doi/10.1093/femsre/fuac051/6957393?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345143Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Sudzinova_FEMS Microbiol Rev_HelD.pdf 1 3.7 MB Autorský preprint vyžádat - 3.0574533 - BTÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Malý, Martin - Kolenko, Petr - Stránský, Jan - Švecová, Leona - Dušková, Jarmila - Koval, Tomáš - Skálová, Tereza - Trundová, Mária - Adámková, Kristýna - Černý, Jiří - Božíková, Paulina - Dohnálek, Jan
Tetracycline-modifying enzyme SmTetX from Stenotrophomonas maltophilia.
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. Roč. 79, JUL 2023 (2023), s. 180-192. ISSN 1744-3091. E-ISSN 2053-230X
Grant CEP: GA MŠMT EF16_019/0000778; GA MŠMT EF15_003/0000447; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974
Výzkumná infrastruktura: CIISB III - 90242
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: FAD-dependent monooxygenases * tetracycline * antibiotic resistance
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 0.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2053230X23005381
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346203 - 4.0562970 - BTÚ 2023 RIV DK eng J - Článek v odborném periodiku
Adámková, Kristýna - Koval, Tomáš - Ostergaard, L. H. - Dušková, Jarmila - Malý, Martin - Švecová, Leona - Skálová, Tereza - Kolenko, Petr - Dohnálek, Jan
Atomic resolution studies of S1 nuclease complexes reveal details of RNA interaction with the enzyme despite multiple lattice-translocation defects.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 78, OCT 1 2022 (2022), s. 1194-1209. ISSN 1399-0047. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA MŠMT EF15_003/0000447
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: S1 nuclease * Aspergillus oryzae * lattice-translocation defects * nucleotides * nucleosides * complexes
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798322008397
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340705 - 5.0561062 - BTÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Blaha, J. - Skálová, Tereza - Kalousková, B. - Skořepa, O. - Cmunt, D. - Grobárová, V. - Pažický, S. - Polachova, E. - Abreu, C. - Stránský, Jan - Koval, Tomáš - Dušková, Jarmila - Zhao, Y. - Harlos, K. - Hašek, Jindřich - Dohnálek, Jan - Vaněk, O.
Structure of the human NK cell NKR-P1:LLT1 receptor:ligand complex reveals clustering in the immune synapse.
Nature Communications. Roč. 13, č. 1 (2022), č. článku 5022. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA15-15181S; GA ČR(CZ) GA18-10687S; GA MŠMT EF15_003/0000447; GA MŠMT(CZ) LM2018127
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: HIGH-LEVEL EXPRESSION * TRANSCRIPT 1 LLT1 * T-CELLS
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-022-32577-6
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340821 - 6.0560263 - BTÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Koval'ová, Terezia - Koval, Tomáš - Stránský, Jan - Kolenko, Petr - Dušková, Jarmila - Švecová, Leona - Vodickova, P. - Spiwok, V. - Benešová, E. - Lipovová, P. - Dohnálek, Jan
The first structure-function study of GH151 alpha-l-fucosidase uncovers new oligomerization pattern, active site complementation, and selective substrate specificity.
FEBS Journal. Roč. 289, č. 16 (2022), č. článku 16387. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT EF15_003/0000447; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) LM2018127
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: active site complementation * crystal structure * gh151 * alpha-l-fucosidase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/febs.16387
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340729 - 7.0558380 - BTÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dohnálek, Jan - Skálová, Tereza
C-type lectin-(like) fold-Protein-protein interaction patterns and utilization.
Biotechnology Advances. Roč. 58, SEP 2022 (2022), č. článku 107944. ISSN 0734-9750. E-ISSN 1873-1899
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-10687S; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776; GA MŠMT EF15_003/0000447
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: C-type lectin * C-type lectin-like * Protein-protein interaction
Obor OECD: Environmental biotechnology
Impakt faktor: 16, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0734975022000404?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340739 - 8.0550734 - BTÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Dohnálek, Jan - Dušková, Jarmila - Tishchenko, Galina - Kolenko, Petr - Skálová, Tereza - Novák, Petr - Fejfarová, Karla - Šimůnek, Jiří
Chitinase Chit62J4 essential for chitin processing by human microbiome bacterium clostridium paraputrificum J4.
Molecules. Roč. 26, č. 19 (2021), č. článku 5978. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA ČR(CZ) GA20-12109S
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043; CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61389013 ; RVO:61388971 ; RVO:67985904
Klíčová slova: Adaptation to the environment * Chitinase * Exochitinase * Glycosyl hydrolase family 18 * Human commensal bacterium
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Polymer science (UMCH-V)
Impakt faktor: 4.927, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1420-3049/26/19/5978
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0326061 - 9.0550569 - BTÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Malý, Martin - Diederichs, K. - Dohnálek, Jan - Kolenko, Petr
PAIREF: paired refinement also for Phenix users.
Acta Crystallographica Section F-Structural Biology and Crystallization Communications. Roč. 77, JUL 2021 (2021), s. 226-229. ISSN 1744-3091. E-ISSN 2053-230X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-10687S
Grant ostatní: OP VVV - ELIBIO(XE) CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447; GA MŠk(CZ) CZ.1.05/1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: x-ray-diffraction * refmac5 * macromolecular crystallography * paired refinement
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 1.072, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2053230X21006129
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328911 - 10.0550566 - BTÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kolenko, Petr - Stránský, Jan - Koval, Tomáš - Malý, Martin - Dohnálek, Jan
SHELIXIR: automation of experimental phasing procedures using SHELXC/D/E.
Journal of Applied Crystallography. Roč. 54, č. 3 (2021), s. 996-1005. ISSN 0021-8898. E-ISSN 1600-5767
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018127
Grant ostatní: Ministerstvo průmyslu a obchodu - GA MPO(CZ) CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000778; OP VVV - ELIBIO(XE) CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447; GA MŠk(CZ) CZ.1.05/1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: x-ray * crystal-structure * data processing * experimental phasing
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 4.868, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S1600576721002454
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328936