Výsledky vyhledávání
- 1.0582831 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková Hausnerová, Viola - Shoman, Mahmoud - Kumar, Dilip - Schwarz, Marek - Modrák, Martin - Jirát Matějčková, Jitka - Mikesková, Eliška - Neva, Silva - Herrmannová, Anna - Šiková, Michaela - Halada, Petr - Novotná, I. - Pajer, J. - Valášek, Leoš Shivaya - Převorovský, M. - Krásný, Libor - Hnilicová, Jarmila
RIP-seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase and primary sigma factors in bacteria.
Nucleic Acids Research. Roč. 52, May 8 (2024), s. 4604-4626. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0015974; GA ČR(CZ) GA23-05622S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) Premium Academiae of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Program: Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: RIP-seq reveals * RNA polymerase * 6S RNA * Ms1 RNA
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/advance-article/doi/10.1093/nar/gkae081/7606967?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350882Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Vankova Hausnerova --seq reveals RNAs that interact with RNA polymerase... .pdf 0 5.9 MB Autorský preprint povolen - 2.0575356 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sudzinová, Petra - Šanderová, Hana - Koval, Tomáš - Skálová, Tereza - Borah, Nabajyoti - Hnilicová, Jarmila - Kouba, Tomáš - Dohnálek, Jan - Krásný, Libor
What the Hel: recent advances in understanding rifampicin resistance in bacteria.
FEMS Microbiology Reviews. Roč. 47, č. 6 (2023), č. článku fuac051. ISSN 0168-6445. E-ISSN 1574-6976
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT EF15_003/0000447
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: rifampicin * antibiotics * resistance * bacteria * RNA polymerase * HelD * HelR
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BTO-N); Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 11.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsre/advance-article/doi/10.1093/femsre/fuac051/6957393?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345143Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Sudzinova_FEMS Microbiol Rev_HelD.pdf 1 3.7 MB Autorský preprint vyžádat - 3.0558580 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Vaňková Hausnerová, Viola - Marvalová, Olga - Šiková, Michaela - Shoman, Mahmoud - Havelková, Jarmila - Kambová, Milada - Janoušková, Martina - Kumar, Dilip - Halada, Petr - Schwarz, Marek - Krásný, Libor - Hnilicová, Jarmila - Pánek, Josef
Ms1 RNA Interacts With the RNA Polymerase Core in Streptomyces coelicolor and Was Identified in Majority of Actinobacteria Using a Linguistic Gene Synteny Search.
Frontiers in Microbiology. Roč. 13, MAY 11 2022 (2022), č. článku 848536. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: 6s rna * escherichia-coli * sp-nov. * short transcripts * noncoding rnas * glycomyces * release * growth * sequence * requires * sRNA * Actinobacteria * Ms1 RNA * Streptomyces * gene synteny * Mycobacterium * 6s rna
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2022.848536/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0332218 - 4.0538228 - BTÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kouba, T. - Koval, Tomáš - Sudzinová, Petra - Pospíšil, Jiří - Brezovská, Barbora - Hnilicová, Jarmila - Šanderová, Hana - Janoušková, Martina - Šiková, Michaela - Halada, Petr - Sýkora, Michal - Barvík, I. - Nováček, J. - Trundová, Mária - Dušková, Jarmila - Skálová, Tereza - Chon, U. R. - Murakami, K. S. - Dohnálek, Jan - Krásný, Libor
Mycobacterial HelD is a nucleic acids-clearing factor for RNA polymerase.
Nature Communications. Roč. 11, č. 1 (2020), č. článku 6419. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA ČR(CZ) GA20-12109S; GA ČR(CZ) GA20-07473S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776
Grant ostatní: OP VVV - ELIBIO(XE) CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: DNA-directed RNA Polymerase * Bacterial RNA * Sigma Factors
Obor OECD: Biophysics; Microbiology (MBU-M); Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 14.919, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC7749160/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316062 - 5.0504361 - MBÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šiková, Michaela - Janoušková, Martina - Ramaniuk, Olga - Páleníková, Petra - Pospíšil, Jiří - Bartl, P. - Suder, Agnieszka - Pajer, P. - Kubičková, P. - Pavliš, O. - Hradilová, Miluše - Vítovská, Dragana - Šanderová, Hana - Převorovský, M. - Hnilicová, Jarmila - Krásný, Libor
Ms1 RNA increases the amount of RNA polymerase in Mycobacterium smegmatis.
Molecular Microbiology. Roč. 111, č. 2 (2019), s. 354-372. ISSN 0950-382X. E-ISSN 1365-2958
Grant CEP: GA ČR GP13-27150P; GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: 6s rna * escherichia-coli * polynucleotide phosphorylase
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.418, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/mmi.14159
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296014 - 6.0504290 - MBÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kouba, T. - Pospíšil, Jiří - Hnilicová, Jarmila - Šanderová, Hana - Barvík, I. - Krásný, Libor
The Core and Holoenzyme Forms of RNA Polymerase from Mycobacterium smegmatis.
Journal of Bacteriology. Roč. 201, č. 4 (2019), č. článku e00583. ISSN 0021-9193. E-ISSN 1098-5530
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-03419S; GA ČR GP13-27150P
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: RNA polymerase * bacterial transcription * cryo-electron microscopy
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.006, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://jb.asm.org/content/201/4/e00583-18
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0295955 - 7.0493283 - MBÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ramaniuk, Olga - Převorovský, M. - Pospíšil, Jiří - Vítovská, Dragana - Kofroňová, Olga - Benada, Oldřich - Schwarz, Marek - Šanderová, Hana - Hnilicová, Jarmila - Krásný, Libor
sigma(I) from Bacillus subtilis: Impact on Gene Expression and Characterization of sigma(I)-Dependent Transcription That Requires New Types of Promoters with Extended-35 and-10 Elements.
Journal of Bacteriology. Roč. 200, č. 17 (2018), č. článku e00251-18. ISSN 0021-9193. E-ISSN 1098-5530
Grant CEP: GA MZd(CZ) NV17-29680A; GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA MŠMT(CZ) LO1509
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: RNAP * RNA-seq * iron metabolism
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.234, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0286673 - 8.0439950 - MBÚ 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hnilicová, Jarmila - Jirát-Matějčková, Jitka - Šiková, Michaela - Pospíšil, Jiří - Halada, Petr - Pánek, Josef - Krásný, Libor
Ms1, a novel sRNA interacting with the RNA polymerase core in mycobacteria.
Nucleic Acids Research. Roč. 42, č. 18 (2014), s. 11763-11776. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034; GA ČR GP13-27150P
Grant ostatní: Magistrát hl. m. P.(CZ) CZ.2.16/3.1.00/24023
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: ESCHERICHIA-COLI * 6S RNA * NONCODING RNA
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 9.112, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0243161 - 9.0439939 - MBÚ 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dušková, E. - Hnilicová, Jarmila - Staněk, D.
CRE promoter sites modulate alternative splicing via p300-mediated histone acetylation.
RNA biology. Roč. 11, č. 7 (2014), s. 1-10. ISSN 1547-6286. E-ISSN 1555-8584
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: alternative splicing * fibronectin * p300
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 4.974, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0243115 - 10.0424234 - MBÚ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hnilicová, Jarmila - Hozeifi, S. - Stejskalová, E. - Dušková, E. - Poser, I. - Humpolíčková, J. - Hof, M. - Staněk, D.
The C-terminal domain of Brd2 is important for chromatin interaction and regulation of transcription and alternative splicing.
Molecular Biology of the Cell. Roč. 24, č. 22 (2013), s. 3557-3568. ISSN 1059-1524. E-ISSN 1939-4586
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: DOUBLE-BROMODOMAIN PROTEIN * JUVENILE MYOCLONIC EPILEPSY * LIVING CELLS
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 4.548, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0230307