Výsledky vyhledávání
- 1.0552451 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Shabarova, Tatiana - Salcher, Michaela M. - Porcal, Petr - Znachor, Petr - Nedoma, Jiří - Grossart, H.P. - Seďa, Jaromír - Hejzlar, Josef - Šimek, Karel
Recovery of freshwater microbial communities after extreme rain events is mediated by cyclic succession.
Nature Microbiology. Roč. 6, č. 4 (2021), s. 479-+. ISSN 2058-5276. E-ISSN 2058-5276
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: dissolved organic-matter * ribosomal-rna * peg-model * lake * assemblages * phosphorus * projections * reservoirs * emissions * silva
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 30.964, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1038/s41564-020-00852-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0327580Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SHABAROVA NatureMicrobiol 2021.pdf 0 13.8 MB Autorský preprint vyžádat - 2.0542712 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Mukherjee, Indranil - Salcher, Michaela M. - Grujcic, V. - Šimek, Karel
CARD-FISH in the Sequencing Era: Opening a New Universe of Protistan Ecology.
Frontiers in Microbiology. Roč. 12, MAR 4 2021 (2021), č. článku 640066. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y; GA ČR(CZ) GX20-12496X; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: aquatic microbial food webs * card-fish * grazing by protists * protists * unicellular eukaryotes * bacterivorous * omnivorous and predatory flagellates * heterotrophic and mixotrophic flagellates
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.frontiersin.org/articles/10.3389/fmicb.2021.640066/full
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320081 - 3.0538633 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Grujčič, Vesna - Mukherjee, Indranil - Kasalický, Vojtěch - Nedoma, Jiří - Posch, T. - Mehrshad, Maliheh - Salcher, Michaela M.
Cascading effects in freshwater microbial food webs by predatory Cercozoa, Katablepharidacea and ciliates feeding on aplastidic bacterivorous cryptophytes.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 96, č. 10 (2020), č. článku fiaa121. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: ciliates * bacterivorous and predatory flagellates * Cercozoa * Cryptophyceae * freshwater microbial food webs * Katablepharidacea
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 4.194, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/femsec/fiaa121
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316400Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup SIMEK FEMS Microbiol Ecol 2020.pdf 0 3.9 MB Autorský preprint povolen - 4.0531454 - MBÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Shabarova, Tatiana - Pernthaler, J. - Posch, T. - Šimek, Karel - Porcal, Petr - Salcher, Michaela M.
Bacterial and Eukaryotic Small-Subunit Amplicon Data Do Not Provide a Quantitative Picture of Microbial Communities, but They Are Reliable in the Context of Ecological Interpretations.
mSphere. Roč. 5, č. 2 (2020), č. článku e00052-20. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y; GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: CARD-FISH * amplicon sequencing * bacterial communities
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.389, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://msphere.asm.org/content/5/2/e00052-20
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310116 - 5.0517802 - BC 2021 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Weinbauer, M.G. - Suominen, S. - Jezbera, Jan - Kerros, M. E. - Marro, S. - Dolan, J. R. - Šimek, Karel
Shifts in cell size and community composition of bacterioplankton due to grazing by heterotrophic flagellates: evidence from a marine system.
Aquatic Microbial Ecology. Roč. 83, č. 3 (2019), s. 295-308. ISSN 0948-3055. E-ISSN 1616-1564
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: flagellates * bacteria * diversity * life strategies * grazing defense
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 1.841, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.int-res.com/abstracts/ame/v83/n3/p295-308/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303308 - 6.0510316 - BC 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šimek, Karel - Sirová, Dagmara
Fluorescently Labeled Bacteria as a Tracer to Reveal Novel Pathways of Organic Carbon Flow in Aquatic Ecosystems.
Jove-Journal of Visualized Experiments. Roč. 151, Sep (2019), č. článku e59903. ISSN 1940-087X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-16554S; GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: environmental sciences * aquatic microbial food webs * carbon
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 1.163, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.jove.com/video/59903/fluorescently-labeled-bacteria-as-tracer-to-reveal-novel-pathways
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0301298 - 7.0510122 - BC 2020 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Bednařík, A. - Blaser, M. - Matoušů, Anna - Tušer, Michal - Chaudhary, P. P. - Šimek, Karel - Rulík, M.
Sediment methane dynamics along the Elbe River.
Limnologica. Roč. 79, Nov (2019), č. článku 125716. ISSN 0075-9511. E-ISSN 1873-5851
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0204
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: methane * river sediments * stable carbon isotope
Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impakt faktor: 1.803, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0075951118301981?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300672 - 8.0504975 - BC 2020 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Matoušů, Anna - Rulík, M. - Tušer, Michal - Bednařík, A. - Šimek, Karel - Bussmann, I.
Methane dynamics in a large river: a case study of the Elbe River.
Aquatic Sciences. Roč. 81, č. 1 (2019), č. článku 12. ISSN 1015-1621. E-ISSN 1420-9055
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0204
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: diffusive flux * ebullition * Elbe river * methane concentration
Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
Impakt faktor: 2.402, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007%2Fs00027-018-0609-9
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297232 - 9.0495997 - MBÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Shabarova, Tatiana - Tomasch, J. - Šimek, Karel - Kopejtka, Karel - Kahl, S. - Pieper, D. H. - Koblížek, Michal
Determining lineage-specific bacterial growth curves with a novel approach based on amplicon reads normalization using internal standard (ARNIS).
The ISME Journal. Roč. 12, č. 11 (2018), s. 2640-2654. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR GA15-12197S; GA ČR GA13-11281S; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA MŠMT(CZ) LO1416; GA MŠMT(CZ) ED2.1.00/19.0392
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: FRESH-WATER RESERVOIR= * SPRING PHYTOPLANKTON BLOOM * IN-SITU HYBRIDIZATION
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.493, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288835Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 135 Determining lineage-specific bacterial growth curves.pdf 5 2.7 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 10.0495155 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mehrshad, Maliheh - Rodriguez-Valera, F. - Amoozegar, M.A. - López-García, P. - Ghai, Rohit
The enigmatic SAR202 cluster up close: shedding light on a globally distributed dark ocean lineage involved in sulfur cycling.
The ISME Journal. Roč. 12, č. 3 (2018), s. 655-668. ISSN 1751-7362. E-ISSN 1751-7370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR GA17-04828S
Grant ostatní: AV ČR(CZ) L200961651
Program: Program podpory perspektivních lidských zdrojů
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: sulfate-reducing prokaryotes * nitrite-oxidizing bacterium * ribosomal-rna genes * phylum chloroflexi
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 9.493, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288295