Výsledky vyhledávání
- 1.0488938 - ÚVGZ 2019 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Faizi, M. - Zavřel, Tomáš - Loureiro, C. - Červený, Jan - Steuer, Ralf
A model of optimal protein allocation during phototrophic growth.
Biosystems. Roč. 166, apr (2018), s. 26-36. ISSN 0303-2647. E-ISSN 1872-8324
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1415; GA ČR(CZ) GA15-17367S; GA MŠMT(CZ) LM2015055
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: Cellular protein economy * Cyanobacteria * Microbial growth laws * Photosynthesis * Resource allocation * Systems biology
Obor OECD: Environmental biotechnology
Impakt faktor: 1.623, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0283449 - 2.0442760 - ÚVGZ 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Murabito, E. - Verma, M. - Bekker, M. - Bellomo, D. - Westerhoff, H. V. - Teusink, B. - Steuer, Ralf
Monte-Carlo Modeling of the Central Carbon Metabolism of Lactococcus lactis: Insights into Metabolic Regulation.
PLoS ONE. Roč. 9, č. 9 (2014), e106453. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: systems biology * aced bacteria * Escherichia-coli * framework development * rate laws * dehydrogenase
Kód oboru RIV: EI - Biotechnologie a bionika
Impakt faktor: 3.234, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0245608 - 3.0442496 - ÚVGZ 2015 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Gottstein, W. - Müller, Stefan - Herzel, H. - Steuer, Ralf
Elucidating the adaptation and temporal coordination of metabolic pathways using in-silico evolution.
Biosystems. Roč. 117, mar (2014), s. 68-76. ISSN 0303-2647. E-ISSN 1872-8324
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: evolutionary algorithms * flux-balance analysis * metabolic oscillations * metabolism * systems biology
Kód oboru RIV: EI - Biotechnologie a bionika
Impakt faktor: 1.548, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0245322 - 4.0441169 - ÚVGZ 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Müller, Stefan - Regensburger, G. - Steuer, Ralf
Enzyme allocation problems in kinetic metabolic networks: Optimal solutions are elementary flux modes.
Journal of Theoretical Biology. Roč. 347, APR 2014 (2014), s. 182-190. ISSN 0022-5193. E-ISSN 1095-8541
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: metabolic optimization * enzyme kinetics * oriented matroid * elementary vector * conformal sum
Kód oboru RIV: EI - Biotechnologie a bionika
Impakt faktor: 2.116, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0244223 - 5.0438527 - ÚVGZ 2015 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Klement, M. - Děd, T. - Šafránek, D. - Červený, Jan - Müller, Stefan - Steuer, Ralf
Biochemical Space: A Framework for Systemic Annotation of Biological Models.
Electronic Notes in Theoretical Computer Science. Roč. 306, JUL (2014), s. 31-44. ISSN 1571-0661
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: biological models * model annotation * systems biology * cyanobacteria
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0241896 - 6.0426649 - ÚVGZ 2014 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Klement, M. - Šafránek, D. - Děd, J. - Pejznoch, A. - Nedbal, Ladislav - Steuer, Ralf - Červený, Jan - Müller, Stefan
A Comprehensive Web-based Platform For Domain-Specific Biological Models.
Electronic Notes in Theoretical Computer Science. Roč. 299, 25 Dec (2013), s. 61-67. ISSN 1571-0661
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: biological models * model annotation * systems biology * simulation * database
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0232382 - 7.0422707 - ÚVGZ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Knoop, H. - Gründel, M. - Zilliges, Y. - Lehmann, R. - Hoffmann, S. - Lockau, W. - Steuer, Ralf
Flux Balance Analysis of Cyanobacterial Metabolism.The Metabolic Network of Synechocystis sp. PCC 6803.
PLoS Computational Biology. Roč. 9, č. 6 (2013), e1003081-e1003081. ISSN 1553-734X. E-ISSN 1553-7358
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: SP STRAIN PCC-6803 * SP ATCC 51142 * photoautotrophic metabolism * anacystis-nidulans * reconstructions * pathway * plants * models * growth
Kód oboru RIV: EI - Biotechnologie a bionika
Impakt faktor: 4.829, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0228851 - 8.0422660 - ÚVGZ 2014 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lehmann, R. - Machné, R. - Georg, J. - Benary, M. - Axman, I. M. - Steuer, Ralf
How cyanobacteria pose new problems to old methods: challenges in microarray time series analysis.
BMC Bioinformatics. Roč. 14, č. 133 (2013). ISSN 1471-2105. E-ISSN 1471-2105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EE2.3.20.0256
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: gene-expression data * growing neural-network * Scycle-regulated genes * cell-cycle * cluster-analysis * normalization * patterns * identification * calibration * intensities
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Impakt faktor: 2.672, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0228891 - 9.0388798 - ÚVGZ 2013 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kamarainen, J. - Knoop, H. - Stanford, N. - Guerrero, F. - Akhtar, M. K. - Aro, E. M. - Steuer, Ralf - Jones, P. R.
Physiological tolerance and stoichiometric potential of cyanobacteria for hydrocarbon fuel production.
Journal of Biotechnology. Roč. 162, č. 1 (2012), s. 67-74. ISSN 0168-1656. E-ISSN 1873-4863
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: Cyanobacteria * Hydrocarbon * Fuel * Toxicity * Stoichiometric potential
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Impakt faktor: 3.183, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0217701