Výsledky vyhledávání
- 1.0583323 - BTÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nováková, Zora - Tehrani, Zahra Aliakbar - Jurok, R. - Motlová, Lucia - Kutil, Zsofia - Pavlíček, Jiří - Shukla, Shivam - Choy, C. J. - Havlínová, Barbora - Baranová, Petra - Berkman, C. E. - Kuchař, M. - Černý, Jiří - Bařinka, Cyril
Structural, Biochemical, and Computational Characterization of Sulfamides as Bimetallic Peptidase Inhibitors.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 64, č. 3 (2024), s. 1030-1042. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA MŠMT LX22NPO5102; GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: glutamate-carboxypeptidase-ii * carbonic-anhydrase inhibitors * membrane antigen * siderophore biosynthesis
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c01542
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353346 - 2.0574529 - BTÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Svoboda, Jakub - Berdár, Daniel - Kolenko, Petr - Černý, Jiří - Nováková, Zora - Pavlíček, Jiří - Schneider, Bohdan
Conformation-based refinement of 18-mer DNA structures.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 79, JUL 2023 (2023), s. 655-665. ISSN 1399-0047. E-ISSN 2059-7983
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA18197; GA MŠMT EF16_019/0000778
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DNA structure * dnatco.datmos.org * structure validation * structure refinement * base pairing
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://scripts.iucr.org/cgi-bin/paper?S2059798323004679
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345411 - 3.0550576 - BTÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shen, S. - Picci, C. - Ustinova, Kseniya - Benoy, V. - Kutil, Zsofia - Zhang, G. - Tavares, M. T. - Pavlíček, Jiří - Zimprich, Ch. A. - Robers, M. B. - Van den Bosch, L. - Bařinka, Cyril - Langley, B. - Kozikowski, A. P.
Tetrahydroquinoline-Capped Histone Deacetylase 6 Inhibitor SW-101 Ameliorates Pathological Phenotypes in a Charcot-Marie-Tooth Type 2A Mouse Model.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 64, č. 8 (2021), s. 4810-4840. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: hdac6 inhibitors * acetylation * disease * neuropathy
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 8.039, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.0c02210
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329546 - 4.0542184 - BTÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Pham, Phuong Ngoc - Huličiak, Maroš - Biedermannová, Lada - Černý, Jiří - Charnavets, Tatsiana - Fuertes, Gustavo - Herynek, Štěpán - Kolářová, Lucie - Kolenko, Petr - Pavlíček, Jiří - Zahradník, Jiří - Mikulecký, Pavel - Schneider, Bohdan
Protein Binder (ProBi) as a New Class of Structurally Robust Non-Antibody Protein Scaffold for Directed Evolution.
Viruses. Roč. 13, č. 2 (2021), č. článku 190. E-ISSN 1999-4915
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-20507S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) LM2018127
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: directed evolution * protein scaffold * protein engineering * computational saturation * ribosome display * interleukin-10
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 5.818, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1999-4915/13/2/190
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319662 - 5.0541383 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Noonepalle, S. - Shen, S. - Ptáček, Jakub - Tavares, M. T. - Zhang, G. - Stránský, Jan - Pavlíček, Jiří - Ferreira, G. M. - Hadley, M. - Pelaez, G. - Bařinka, Cyril - Kozikowski, A. P. - Villagra, A.
Rational Design of Suprastat: A Novel Selective Histone Deacetylase 6 Inhibitor with the Ability to Potentiate Immunotherapy in Melanoma Models.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 63, č. 18 (2020), s. 10246-10262. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018127; GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: antitumor-activity * force-field * hdac6 * acetylation * gromacs * charmm * implementation * metabolism * discovery * maps
Obor OECD: Medicinal chemistry
Impakt faktor: 7.446, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.0c00567
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318945 - 6.0522048 - BTÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kanzari-Mnallah, D. - Efrit, M. L. - Pavlíček, Jiří - Vellieux, Frédéric - Boughzala, H. - Akacha, A. B.
Synthesis, Conformational Analysis and Crystal Structure of New Thioxo, Oxo, Seleno Diastereomeric Cyclophosphamides Containing 1,3,2-dioxaphosphorinane.
Current Organic Chemistry. Roč. 23, č. 2 (2019), s. 205-213. ISSN 1385-2728. E-ISSN 1875-5348
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015043
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: 6-MEMBERED-RING PHOSPHORUS-HETEROCYCLES * CHEMICAL-SHIFTS * CHEMICAL-SHIFTS
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 1.933, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0306562 - 7.0510398 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Shen, S. - Hadley, M. - Ustinova, Kseniya - Pavlíček, Jiří - Knox, T. - Noonepalle, S. - Tavares, M. T. - Zimprich, Ch. A. - Zhang, A. - Robers, M. B. - Bařinka, Cyril - Kozikowski, A. P. - Villagra, A.
Discovery of a New Isoxazole-3-hydroxamate-Based Histone Deacetylase 6 Inhibitor SS-208 with Antitumor Activity in Syngeneic Melanoma Mouse Models.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 62, č. 18 (2019), s. 8557-8577. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: HDAC6-SELECTIVE INHIBITORS * ACQUIRED-RESISTANCE * HDAC6 INHIBITOR
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 6.205, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jmedchem.9b00946
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0300905 - 8.0505012 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Zsofia - Škultétyová, Ĺubica - Rauh, D. - Meleshin, M. - Šnajdr, Ivan - Nováková, Zora - Mikesova, Jana - Pavlíček, Jiří - Hadzima, Martin - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Majer, Pavel - Schutkowski, M. - Bařinka, Cyril
The unraveling of substrate specificity of histone deacetylase 6 domains using acetylome peptide microarrays and peptide libraries.
FASEB Journal. Roč. 33, č. 3 (2019), s. 4035-4045. ISSN 0892-6638. E-ISSN 1530-6860
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: human acetylome * deacylation * deformylation
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 4.966, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://faseb.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1096/fj.201801680R
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0296540 - 9.0480758 - BTÚ 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Škultétyová, Ĺubica - Ustinova, Kseniya - Kutil, Zsofia - Nováková, Zora - Pavlíček, Jiří - Mikesova, Jana - Trapl, Dalibor - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Hubálek, Martin - Lánský, Zdeněk - Bařinka, Cyril
Human histone deacetylase 6 shows strong preference for tubulin dimers over assembled microtubules.
Scientific Reports. Roč. 7, 2017 Sep 14 (2017), č. článku 11547. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR GA15-19640S; GA ČR(CZ) GA15-17488S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: ALPHA-TUBULIN * IN-VIVO * MOLECULAR-BASIS * POSTTRANSLATIONAL MODIFICATION
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biochemistry and molecular biology (UOCHB-X)
Impakt faktor: 4.122, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0276482 - 10.0469171 - BTÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nováková, Zora - Wozniak, K. - Jančařík, Andrej - Rais, R. - Wu, Y. - Pavlíček, Jiří - Ferraris, D. - Havlínová, Barbora - Ptáček, Jakub - Vávra, Jan - Hin, N. - Rojas, C. - Majer, Pavel - Slusher, B. S. - Tsukamoto, T. - Bařinka, Cyril
Unprecedented Binding Mode of Hydroxamate-Based Inhibitors of Glutamate Carboxypeptidase II: Structural Characterization and Biological Activity.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 59, č. 10 (2016), s. 4539-4550. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA ČR GAP301/12/1513
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:61388963
Klíčová slova: LINKED ACIDIC DIPEPTIDASE * N-ACETYLASPARTYLGLUTAMATE NAAG * THIOL-BASED INHIBITORS
Kód oboru RIV: FR - Farmakologie a lékárnická chemie; CC - Organická chemie (UOCHB-X)
Impakt faktor: 6.259, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0267014