Výsledky vyhledávání
- 1.0586786 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šoltysová, Markéta - Škerlová, Jana - Pachl, Petr - Škubník, K. - Fábry, Milan - Sieglová, Irena - Farolfi, Martina - Grishkovskaya, I. - Babiak, M. - Nováček, J. - Krásný, Libor - Řezáčová, Pavlína
Structural characterization of two prototypical repressors of SorC family reveals tetrameric assemblies on DNA and mechanism of function.
Nucleic Acids Research. (2024), č. článku gkae434. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkae434
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0354179Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1093nargkae434.pdf 0 2.3 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0572565 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Skácel, Jan - Djukic, Stefan - Baszczyňski, Ondřej - Kalčic, Filip - Bílek, Tadeáš - Chalupský, Karel - Kozák, Jaroslav - Dvořáková, Alexandra - Tloušťová, Eva - Kráľová, Zuzana - Šmídková, Markéta - Voldřich, Jan - Rumlová, M. - Pachl, Petr - Brynda, Jiří - Vučková, Tereza - Fábry, Milan - Snášel, Jan - Pichová, Iva - Řezáčová, Pavlína - Mertlíková-Kaiserová, Helena - Janeba, Zlatko
Design, Synthesis, Biological Evaluation, and Crystallographic Study of Novel Purine Nucleoside Phosphorylase Inhibitors.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 66, č. 10 (2023), s. 6652-6681. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TN01000013; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: multisubstrate analog inhibitors * transition-state analog * human erythrocytes
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 7.3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jmedchem.2c02097
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343213Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1021acs.jmedchem.2c02097.pdf 1 5.7 MB Vydavatelský postprint povolen - 3.0570585 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Buša, Michal - Matoušková, Zuzana - Bartošová-Sojková, Pavla - Pachl, Petr - Řezáčová, Pavlína - Eichenberger, R. M. - Deplazes, P. - Horn, Martin - Štefanić, S. - Mareš, Michael
An evolutionary molecular adaptation of an unusual stefin from the liver fluke Fasciola hepatica redefines the cystatin superfamily.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 299, č. 3 (2023), č. článku 102970. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA ČR(CZ) GA19-17269S; GA ČR(CZ) GA21-16565S; GA MŠMT(CZ) LTAUSA19109
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: cystatin * stefin * protease inhibitor * cysteine cathepsin * protein structure * protein evolution * helminth parasite
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.jbc.2023.102970
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0341888
Vědecká data: RCSB PDB - 4.0545555 - ÚOCHB 2022 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Kalčic, Filip - Frydrych, Jan - Doleželová, Eva - Slapničková, Martina - Pachl, Petr - Poštová Slavětínská, Lenka - Dračínský, Martin - Hocková, Dana - Zíková, Alena - Janeba, Zlatko
C1′-Branched acyclic nucleoside phosphonates mimicking adenosine monophosphate: Potent inhibitors of Trypanosoma brucei adenine phosphoribosyltransferase.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 225, Dec 5 (2021), č. článku 113798. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA19-07707S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:60077344
Klíčová slova: trypanosomiasis * purine salvage pathway * APRT * nucleotide analogues * phosphonates * enzyme inhibitors
Obor OECD: Organic chemistry; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 7.088, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2021.113798
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0322237 - 5.0543649 - ÚOCHB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brewster, J. L. - Pachl, Petr - McKellar, J. L. O. - Selmer, M. - Squire, C. J. - Patrick, W. M.
Structures and kinetics of Thermotoga maritima MetY reveal new insights into the predominant sulfurylation enzyme of bacterial methionine biosynthesis.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 296, Jan (2021), č. článku 100797. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: enzyme kinetics * enzyme mechanism * methionine * protein structure * X-ray crystallography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.485, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.jbc.2021.100797
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0320836 - 6.0541414 - ÚOCHB 2022 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
Jansa, J. - Jorda, R. - Škerlová, Jana - Pachl, Petr - Peřina, M. - Řezníčková, E. - Heger, T. - Gucký, T. - Řezáčová, Pavlína - Lyčka, A. - Kryštof, V.
Imidazo[1,2-c]pyrimidin-5(6H)-one inhibitors of CDK2: Synthesis, kinase inhibition and co-crystal structure.
European Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 216, Apr 15 (2021), č. článku 113309. ISSN 0223-5234. E-ISSN 1768-3254
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: activity assay * Co-crystal * cyclin-dependent kinase 2 * imidazo[1,2-c]pyrimidin-5(6H)-one * ITC * kinase inhibitor * X-ray crystallography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.088, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.ejmech.2021.113309
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318978 - 7.0538821 - ÚOCHB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jílková, Adéla - Horn, Martin - Fanfrlík, Jindřich - Küppers, J. - Pachl, Petr - Řezáčová, Pavlína - Lepšík, Martin - Fajtová, Pavla - Rubešová, Petra - Chanová, M. - Caffrey, C. R. - Gütschow, M. - Mareš, Michael
Azanitrile Inhibitors of the SmCB1 Protease Target Are Lethal to Schistosoma mansoni: Structural and Mechanistic Insights into Chemotype Reactivity.
ACS Infectious Diseases. Roč. 7, č. 1 (2021), s. 189-201. ISSN 2373-8227
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTAUSA19109; GA MZd(CZ) NV18-05-00345; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: azapeptide inhibitors * cysteine proteases * protein structures * structure-activity relationships * schistosomiasis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.578, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acsinfecdis.0c00644
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316970 - 8.0536615 - ÚOCHB 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hejdánek, Jakub - Radilová, Kateřina - Pachl, Petr - Hodek, Jan - Machara, Aleš - Weber, Jan - Řezáčová, Pavlína - Konvalinka, Jan - Kožíšek, Milan
Structural characterization of the interaction between the C-terminal domain of the influenza polymerase PA subunit and an optimized small peptide inhibitor.
Antiviral Research. Roč. 185, Jan (2021), č. článku 104971. ISSN 0166-3542. E-ISSN 1872-9096
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729; GA MŠMT(CZ) LM2018133
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: antiviral peptides * influenza a polymerase * protein-protein interaction * AlphaScreen
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 10.103, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.antiviral.2020.104971
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316256 - 9.0521889 - ÚOCHB 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pachl, Petr - Kapešová, Jana - Brynda, Jiří - Biedermannová, Lada - Pelantová, Helena - Bojarová, Pavla - Křen, Vladimír - Řezáčová, Pavlína - Kotík, Michael
Rutinosidase from Aspergillus niger: crystal structure and insight into the enzymatic activity.
FEBS Journal. Roč. 287, č. 15 (2020), s. 3315-3327. ISSN 1742-464X. E-ISSN 1742-4658
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-00091S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: catalytic mechanism * diglycosidase * rutin * SIRAS * X-ray crystallography
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Biophysics (MBU-M)
Impakt faktor: 5.542, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://febs.onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/febs.15208
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0306434 - 10.0511423 - ÚOCHB 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Grüner, B. - Brynda, Jiří - Das, V. - Šícha, V. - Štěpánková, J. - Nekvinda, J. - Holub, J. - Pospíšilová, Klára - Fábry, M. - Pachl, Petr - Král, V. - Kugler, Michael - Mašek, V. - Medvedíková, M. - Matějková, Stanislava - Nová, A. - Lišková, B. - Gurská, S. - Džubák, P. - Hajdúch, M. - Řezáčová, Pavlína
Metallacarborane Sulfamides: Unconventional, Specific, and Highly Selective Inhibitors of Carbonic Anhydrase IX.
Journal of Medicinal Chemistry. Roč. 62, č. 21 (2019), s. 9560-9575. ISSN 0022-2623. E-ISSN 1520-4804
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TE01020028; GA MŠMT(CZ) LM2015064
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: cobalt bis(1,2-dicarbollide) * carborane complexes * medicinal chemistry
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.205, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/acs.jmedchem.9b00945
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0301695