Výsledky vyhledávání
- 1.0561693 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nguyen, Man Thi Hong - Biriukov, Denys - Tempra, Carmelo - Baxová, Katarína - Martinez-Seara, Hector - Evci, Huseyin - Singh, Vandana - Šachl, Radek - Hof, Martin - Jungwirth, Pavel - Javanainen, Matti - Vazdar, Mario
Ionic Strength and Solution Composition Dictate the Adsorption of Cell-Penetrating Peptides onto Phosphatidylcholine Membranes.
Langmuir. Roč. 38, č. 37 (2022), s. 11284-11295. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-26854X
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: linear constraint solver * particle mesh Ewald * molecular dynamics
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.langmuir.2c01435
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334213Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0561693.pdf 3 14.4 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 2.0544854 - ÚOCHB 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Žuna, K. - Jovanović, O. - Khailova, L. S. - Škulj, S. - Brkljača, Z. - Kreiter, J. - Kotova, E. A. - Vazdar, Mario - Antonenko, Y. N. - Pohl, E. E.
Mitochondrial Uncoupling Proteins (UCP1-UCP3) and Adenine Nucleotide Translocase (ANT1) Enhance the Protonophoric Action of 2,4-Dinitrophenol in Mitochondria and Planar Bilayer Membranes.
Biomolecules. Roč. 11, č. 8 (2021), č. článku 1178. E-ISSN 2218-273X
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: mitochondrial uncoupler * protonophore * membrane potential * proton conductance * artificial membranes * molecular dynamics simulations
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.064, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/biom11081178
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321656 - 3.0541497 - ÚOCHB 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Polák, J. - Morávek, P. - Brkljača, Z. - Vazdar, Mario - Cibulka, I. - Heyda, J.
Computation and volumetric insight into (p,T) effect on aqueous guanidinium chloride.
Journal of Chemical Thermodynamics. Roč. 158, Jul (2021), č. článku 106450. ISSN 0021-9614. E-ISSN 1096-3626
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: aqueous guanidinium chloride * molecular dynamics simulations * standard molar volume * Kirkwood-Buff theory * solution structure
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.269, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.jct.2021.106450
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319060 - 4.0541259 - ÚOCHB 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Kreiter, J. - Rupprecht, A. - Škulj, S. - Brkljača, Z. - Žuna, K. - Knyazev, D. G. - Bardakji, J. - Vazdar, Mario - Pohl, E. E.
ANT1 activation and inhibition patterns support the fatty acid cycling mechanism for proton transport.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 5 (2021), č. článku 2490. E-ISSN 1422-0067
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: fatty acid anion transport * proton transport * ADP/ATP carrier protein * arachidonic acid * mitochondrial transporter * long-chain fatty acids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms22052490
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318848 - 5.0539523 - ÚOCHB 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Škulj, S. - Brkljača, Z. - Kreiter, J. - Pohl, E. E. - Vazdar, Mario
Molecular dynamics simulations of mitochondrial uncoupling protein 2.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 3 (2021), č. článku 1214. E-ISSN 1422-0067
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: membrane protein * long-chain fatty acid * proton transfer * purine nucleotide * conductance measurements in model membranes * uncoupling
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3390/ijms22031214
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0317593 - 6.0399824 - ÚOCHB 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vazdar, Mario - Wernersson, Erik - Khabiri, Morteza - Cwiklik, Lukasz - Jurkiewicz, Piotr - Hof, Martin - Mann, E. - Kolusheva, S. - Jelinek, R. - Jungwirth, Pavel
Aggregation of Oligoarginines at Phospholipid Membranes: Molecular Dynamics Simulations, Time-Dependent Fluorescence Shift, and Biomimetic Colorimetric Assays.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 117, č. 39 (2013), s. 11530-11540. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT LH12001; GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: cell penetrating peptides * oligoarginine * molecular dynamics * membranes * fluorescence spectroscopy
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.377, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0227150 - 7.0391709 - ÚOCHB 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vazdar, Mario - Jungwirth, Pavel - Mason, Philip E.
Aqueous Guanidinium-Carbonate Interactions by Molecular Dynamics and Neutron Scattering: Relevance to Ion-Protein Interactions.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 117, č. 6 (2013), s. 1844-1848. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: guanidinium * neutron scattering * molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.377, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0220692 - 8.0388678 - ÚFCH JH 2014 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Pokorná, Šárka - Jurkiewicz, Piotr - Cwiklik, Lukasz - Vazdar, Mario - Hof, Martin
Interactions of monovalent salts with cationic lipid bilayers.
Faraday Discussions. Roč. 160, č. 2013 (2013), s. 341-358. ISSN 1359-6640. E-ISSN 1364-5498
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016; GA AV ČR GEMEM/09/E006
Institucionální podpora: RVO:61388955 ; RVO:61388963
Klíčová slova: FLUORESCENCE SOLVENT RELAXATION * MOLECULAR-DYNAMICS SIMULATIONS * PHOSPHOLIPID-BILAYERS
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.194, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0217593 - 9.0379006 - ÚOCHB 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vazdar, Mario - Uhlig, Frank - Jungwirth, Pavel
Like-Charge Ion Pairing in Water: An Ab Initio Molecular Dynamics Study of Aqueous Guanidinium Cations.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 3, č. 15 (2012), s. 2021-2024. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA ČR GA203/08/0114
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: guanidinium * ion pairing * ab initio molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.585, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0210294 - 10.0378990 - ÚOCHB 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vazdar, Mario - Pluhařová, Eva - Mason, Philip E. - Vácha, R. - Jungwirth, Pavel
Ions at Hydrophobic Aqueous Interfaces: Molecular Dynamics with Effective Polarization.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 3, č. 15 (2012), s. 2087-2091. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: 7th Framework Program(XE) 286154-SYLICA; European Regional Development Fund(XE) CZ.1.05/1.1.00/02.0068-CEITEC; GA MŠk(CZ) LM2010005
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: ions * water surface * molecular dynamics
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 6.585, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0210283