Výsledky vyhledávání
- 1.0540647 - BTÚ 2021 RIV SE eng J - Článek v odborném periodiku
Naraine, Ravindra - Abaffy, Pavel - Šídová, Monika - Tománková, Silvie - Pocherniaieva, K. - Smolík, Ondřej - Kubista, Mikael - Pšenička, M. - Šindelka, Radek
NormQ: RNASeq normalization based on RT-qPCR derived size factors.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 18, č. 2020 (2020), s. 1173-1181. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR GA17-24441S; GA ČR(CZ) GA19-11313S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: seq * tomography * Transcriptomics * RNASeq * Normalization * TOMOSeq * DESeq * Median-of-ratios
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 7.271, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2001037020302737?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318266 - 2.0523050 - BTÚ 2020 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Šídová, Monika - Tománková, Silvie - Abaffy, Pavel - Kubista, Mikael - Šindelka, Radek
Effects of post-mortem and physical degradation on RNA integrity and quality.
Biomolecular Detection and Quantification. Roč. 5, September 2015 (2015), s. 3-9. ISSN 2214-7535
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: Degradation * RNA integrity * RNA quality * rqi
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2214753515300048?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307459 - 3.0510908 - ÚŽFG 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bartoš, Oldřich - Röslein, Jan - Kotusz, J. - Pačes, Jan - Pekárik, L. - Petrtýl, Miloslav - Halačka, Karel - Štefková Kašparová, Eva - Mendel, Jan - Boron, A. - Juchno, D. - Leska, A. - Jablonska, O. - Beneš, V. - Šídová, Monika - Janko, Karel
The Legacy of Sexual Ancestors in Phenotypic Variability, Gene Expression, and Homoeolog Regulation of Asexual Hybrids and Polyploids.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 36, č. 9 (2019), s. 1902-1920. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000460; GA ČR GA13-12580S; GA ČR(CZ) GA17-09807S
Institucionální podpora: RVO:67985904 ; RVO:68081766 ; RVO:86652036
Klíčová slova: asexuality * polyploidy * hybridization * tissue-specific gene expression * expression-level dominance * cis-trans-regulation
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology; Zoology (UBO-W); Biochemistry and molecular biology (BTO-N)
Impakt faktor: 11.062, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/36/9/1902/5488194
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0301276 - 4.0508015 - BTÚ 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pocherniaieva, K. - Šídová, Monika - Havelka, M. - Saito, T. - Pšenička, M. - Šindelka, Radek - Kašpar, V.
Comparison of oocyte mRNA localization patterns in sterlet Acipenser ruthenus and African clawed frog Xenopus laevis.
Journal of Experimental Zoology Part B: Molecular and Developmental Evolution Additional Title Information. Roč. 330, č. 3 (2018), s. 181-187. ISSN 1552-5007. E-ISSN 1552-5015
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: acipenser ruthenus * primordial Germ Cells * qPCR * RNA localization
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 1.716, rok: 2018
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jez.b.22802
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0298991 - 5.0496977 - BTÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šindelka, Radek - Abaffy, Pavel - Qu, Y. - Tománková, Silvie - Šídová, Monika - Naraine, Ravindra - Kolář, Michal - Peuchen, E. - Sun, L. - Dovichi, N. - Kubista, Mikael
Asymmetric distribution of biomolecules of maternal origin in the Xenopus laevis egg and their impact on the developmental plan.
Scientific Reports. Roč. 8, MAY 29 2018 (2018), č. článku 8315. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-07500S; GA MŠMT(CZ) LH15074; GA MŠMT(CZ) LM2015047; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036 ; RVO:68378050
Klíčová slova: CELL MASS-SPECTROMETRY * BICOID MESSENGER-RNA * SAMPLE PREPARATION
Obor OECD: Other biological topics; Other biological topics (UMG-J)
Impakt faktor: 4.011, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0289597 - 6.0472500 - BTÚ 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Tlapáková, T. - Nguyen, T.M.X. - Vegrichtova, M. - Šídová, Monika - Strnadova, K. - Bláhová, M. - Krylov, V.
Identification and characterization of Xenopus tropicalis common progenitors of Sertoli and peritubular myoid cell lineages.
Biology Open. Roč. 5, č. 9 (2016), s. 1275-1282. ISSN 2046-6390. E-ISSN 2046-6390
Grant CEP: GA MŠMT LK21305; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: Testicular somatic cells * Xenopus tropicalis * Migration potential
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.095, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0269803 - 7.0457855 - BTÚ 2016 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Korenková, Vlasta - Scott, J. - Novosadová, Vendula - Jindřichová, Marie - Langerová, Lucie - Švec, David - Šídová, Monika - Sjoback, R.
Pre-amplification in the context of high-throughput qPCR gene expression experiment.
B M C Molecular Biology. Roč. 16, č. 5 (2015). ISSN 1471-2199. E-ISSN 1471-2199
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP304/12/1585; GA ČR(CZ) GA15-08239S; GA ČR GA13-02154S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: High-throughput qPCR * Gene expression * Exponential pre-amplification
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 2.500, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0258216 - 8.0446657 - BTÚ 2016 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šídová, Monika - Šindelka, Radek - Castoldi, M. - Benes, V. - Kubista, Mikael
Intracellular microRNA profiles form in the Xenopus laevis oocyte that may contribute to asymmetric cell division.
Scientific Reports. Roč. 5, č. 11157 (2015). ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: VG1 MESSENGER-RNA * VEGETAL CORTEX * FROG OOCYTE
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 5.228, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0248637 - 9.0396452 - BTÚ 2014 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Flachsová, Monika - Šindelka, Radek - Kubista, Mikael
Single blastomere expression profiling of Xenopus laevis embryos of 8 to 32-cells reveals developmental asymmetry.
Scientific Reports. Roč. 3, č. 2278 (2013). ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT ED1.1.00/02.0109; GA ČR GA301/09/1752
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: DORSAL-VENTRAL AXIS * CORTICAL ROTATION * PROSPECTIVE AREAS
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 5.078, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0224411Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Single blastomere expression.pdf 7 1.8 MB Vydavatelský postprint vyžádat Single blastomere expression.pdf 1 1.8 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 10.0346483 - BTÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šindelka, R. - Šídová, Monika - Švec, David - Kubista, Mikael
Spatial expression profiles in the Xenopus laevis oocytes measured with qPCR tomography.
Methods. Roč. 51, - (2010), s. 87-91. ISSN 1046-2023. E-ISSN 1095-9130
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA500970904; GA ČR GA301/09/1752
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: Xenopus * Oocyte * qPCR tomography
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.527, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0187504