Výsledky vyhledávání
- 1.0468157 - MBÚ 2017 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Degtjarik, Oksana - Brynda, Jiří - Ettrichová, Olga - Kutý, Michal - Sinha, Dhiraj - Kutá Smatanová, Ivana - Carey, Jannette - Ettrich, Rüdiger - Řeha, David
Quantum Calculations Indicate Effective Electron Transfer between FMN and Benzoquinone in a New Crystal Structure of Escherichia coli WrbA.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 120, č. 22 (2016), s. 4867-4877. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015055; GA ČR GAP207/10/1934
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: MACROMOLECULAR CRYSTALLOGRAPHY * NONCOVALENT INTERACTIONS * MOLECULAR-REPLACEMENT
Kód oboru RIV: EE - Mikrobiologie, virologie
Impakt faktor: 3.177, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0266157Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 190_Quantum Calculations Indicate Effective Electron Transfer.pdf 3 3.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 2.0437116 - ÚVGZ 2015 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Řeha, David - Balasubramanian, H. - Sinha, Dhiraj - Kukačka, Zdeněk - McSally, J. - Ettrichová, Olga - Novák, Petr - Carey, J. - Ettrich, Rüdiger
Molecular dynamics comparison of E. coli WrbA apoprotein and holoprotein.
Journal of Molecular Modeling. Roč. 20, č. 9 (2014), s. 2400. ISSN 1610-2940. E-ISSN 0948-5023
Grant CEP: GA ČR GAP207/10/1934
Institucionální podpora: RVO:67179843 ; RVO:61388971
Klíčová slova: global motions * force field parametrization * binding site volume * electrostatic potential surface * NAD(P)H:quinone oxidoreductase
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Impakt faktor: 1.736, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0240703 - 3.0420972 - MBÚ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rozbeský, Daniel - Sovová, Žofie - Marcoux, J. - Man, Petr - Ettrich, Rüdiger - Robinson, C. V. - Novák, Petr
Structural Model of Lymphocyte Receptor NKR-P1C Revealed by Mass Spectrometry and Molecular Modeling.
Analytical Chemistry. Roč. 85, č. 3 (2013), s. 1597-1604. ISSN 0003-2700. E-ISSN 1520-6882
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP207/10/1040; GA ČR GAP207/10/1934; GA ČR GA303/09/0477
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: CHEMICAL CROSS-LINKING * NATURAL-KILLER-CELL * ION MOBILITY
Kód oboru RIV: CB - Analytická chemie, separace
Impakt faktor: 5.825, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0227583 - 4.0399208 - ÚVGZ 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kishko, Iryna - Carey, J. - Řeha, David - Brynda, Jiří - Winkler, R. - Harish, B. - Guerra, R. - Ettrichová, Olga - Kukačka, Zdeněk - Sheryemyetyeva, O. - Novák, Petr - Kutý, Michal - Kutá-Smatanová, Ivana - Ettrich, Rüdiger - Lapkouski, Mikalai
1.2 °A resolution crystal structure of Escherichia coli WrbA holoprotein.
Acta Crystallographica Section D-Biological Crystallography. Roč. 69, č. 9 (2013), s. 1748-1757. ISSN 0907-4449
Grant CEP: GA ČR GAP207/10/1934
Institucionální podpora: RVO:67179843 ; RVO:68378050 ; RVO:61388971
Klíčová slova: HPLC * Nqo1 * diaphorase * flavodoxin * methionine sulfoxide * thin-layer chromatography
Kód oboru RIV: CE - Biochemie; CE - Biochemie (MBU-M); EB - Genetika a molekulární biologie (UMG-J)
Impakt faktor: 7.232, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0226529 - 5.0382149 - ÚVGZ 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kishko, Iryna - Harish, B. - Zayats, Vasilina - Řeha, David - Tenner, B. - Beri, D. - Gustavsson, T. - Ettrich, Rüdiger - Carey, J.
Biphasic Kinetic Behavior of E. coli WrbA, an FMNDependent NAD(P)H. Quinone Oxidoreductase.
PLoS ONE. Roč. 7, č. 8 (2012), s. 1-10. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA ČR GAP207/10/1934
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Klíčová slova: Escheria-coli * DT-diaphorase * dehydrogense * mechanism * enzyme * flavoprotein * flavodoxin * reduction
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.730, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0212454 - 6.0381621 - ÚVGZ 2014 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Zayats, Vasilina - Samad, Abdul - Minofar, Babak - Roelofs, K. E. - Stockner, T. - Ettrich, Rüdiger
Regulation of the transient receptor potential channel TRPA1 by its N-terminal ankyrin repeat domain.
Journal of Molecular Modeling. Roč. 19, č. 11 (2012), s. 4689-4700. ISSN 1610-2940. E-ISSN 0948-5023
Grant CEP: GA ČR GAP207/10/1934
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Klíčová slova: ankyrin repeat * EF-hand * familial episodic pain syndrom * TRPA1
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 1.984, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0212049 - 7.0381609 - ÚVGZ 2014 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Khabiri, Morteza - Minofar, Babak - Březovský, J. - Damborský, J. - Ettrich, Rüdiger
Interaction of organic solvents with protein structures at protein-solvent interface.
Journal of Molecular Modeling. Roč. 19, č. 11 (2013), s. 4701-4711. ISSN 1610-2940. E-ISSN 0948-5023
Grant CEP: GA ČR GAP207/10/1934
Institucionální podpora: RVO:67179843
Klíčová slova: molecular dynamics * non-aqueous media * organic solvents * solvent orientation
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 1.867, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0212039 - 8.0373140 - ÚVGZ 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Strawn, R. - Stockner, T. - Melicherčík, Milan - Jin, L. - Xue,, W. F. - Carey, J. - Ettrich, Rüdiger
Synergy of molecular dynamics and isothermal titration calorimetry in studies of Allostery.
Methods in Enzymology. Roč. 492, - (2011), s. 151-188. ISSN 0076-6879
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06010; GA ČR GAP207/10/1934
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Klíčová slova: hexameric arginine repressor * DNA-binding domain * escherichia-coli * ligand-binding * bacillus-stearothhermophilus * proteins * systems * model * simulations * operator
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Impakt faktor: 2.042, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0206295 - 9.0359496 - ÚVGZ 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Strawn, R. - Melicherčík, Milan - Green, M. - Stockner, T. - Carey, J. - Ettrich, Rüdiger
Symmetric Allosteric Mechanism of Hexameric Escherichia coli Arginine Repressor Exploits Competition between L-Arginine Ligands and Resident Arginine Residues.
PLoS Computational Biology. Roč. 6, č. 6 (2010), s. 1-12. ISSN 1553-734X. E-ISSN 1553-7358
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06010; GA ČR GAP207/10/1934
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520
Klíčová slova: molecular-dynamics simulations * free-energy calculations * structural basis * DNA-binding domain * bacillus-stearothermophilus * T4 lysozyme * proteins * hemoglobin * model * affinity
Kód oboru RIV: EH - Ekologie - společenstva
Impakt faktor: 5.515, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0197277 - 10.0355844 - ÚVGZ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kulik, Natallia - Weignerová, L. - Filipi, Tomáš - Pompach, Petr - Novák, Petr - Mrázek, H. - Slámová, Kristýna - Bezouška, K. - Křen, Vladimír - Ettrich, Rüdiger
The alpha-galactosidase type A gene aglA from Aspergillus niger encodes a fully functional alpha-N-acetylgalactosaminidase.
Glycobiology. Roč. 20, č. 11 (2010), s. 1410-1419. ISSN 0959-6658. E-ISSN 1460-2423
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06010; GA ČR GAP207/10/1934; GA ČR GAP207/10/1040; GA ČR GA303/09/0477; GA ČR GAP207/10/0321
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z60870520; CEZ:AV0Z50200510; CEZ:AV0Z10750506
Klíčová slova: α-N-acetylgalactosaminidase * α-galactosidase * Aspergillus niger * substrate binding * molecular modeling
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.791, rok: 2010
http://arl-repository.lib.cas.cz/uloziste_av/UEK-B/cav_un_epca-0355844_01.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0194522