Výsledky vyhledávání
- 1.0439691 - FZÚ 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kaprálová-Žďánská, Petra Ruth - Trachta, Michal - Bludský, Ota - Špirko, Vladimír
Localised quantum states of atomic and molecular particles physisorbed on carbon-based nanoparticles.
Journal of Chemical Physics. Roč. 141, č. 11 (2014), "114702-1"-"114702-10". ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR GAP205/11/0571; GA ČR GAP208/11/0436; GA ČR GAP208/10/0725
Institucionální podpora: RVO:68378271 ; RVO:61388963
Klíčová slova: periodic structure * carbon nanostructures * graphene * quantum mechanics * physisorbed
Kód oboru RIV: BG - Jaderná, atomová a mol. fyzika, urychlovače
Impakt faktor: 2.952, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0242885 - 2.0396329 - ÚOCHB 2014 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kysilka, Jiří - Vondrášek, Jiří
A systematic method for analysing the protein hydration structure of T4 lysozyme.
Journal of Molecular Recognition. Roč. 26, č. 10 (2013), s. 479-487. ISSN 0952-3499. E-ISSN 1099-1352
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT(CZ) LH11020
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GAP302/10/0427
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: protein hydration structure * water * X-ray crystallography * cluster algorithm * interaction enthalpy
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 2.337, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0224147 - 3.0394879 - ÚOCHB 2014 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hermann, Jan - Bludský, Ota
A novel correction scheme for DFT: A combined vdW-DF/CCSD(T) approach.
Journal of Chemical Physics. Roč. 139, č. 3 (2013), 034115/1-034115/6. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: long-range * adsorption * zeolites * DFT
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.122, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0223113 - 4.0385763 - ÚOCHB 2013 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kysilka, Jiří - Vondrášek, Jiří
Towards a better understanding of the specificity of protein-protein interaction.
Journal of Molecular Recognition. Roč. 25, č. 11 (2012), s. 604-615. ISSN 0952-3499. E-ISSN 1099-1352
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA ČR GAP302/10/0427; GA MŠMT(CZ) LH11020
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: protein-protein interaction * molecular recognition * x-ray structure analysis * empirical potentials * side chain-side chain interaction * interaction energy * bioinformatics
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 3.006, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0156114 - 5.0384278 - ÚOCHB 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fačkovec, Boris - Vondrášek, Jiří
Optimal Definition of Inter-Residual Contact in Globular Proteins Based on Pairwise Interaction Energy Calculations, Its Robustness, and Applications.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 116, č. 42 (2012), s. 12651-12660. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT(CZ) LH11020
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: egg-white lysozyme * force-field * 3-dimensional structure * thermophilic proteins * thermal-stability * mutant
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.607, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0007248 - 6.0369287 - ÚOCHB 2012 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Vymětal, Jiří - Vondrášek, Jiří
The DF-LCCSD(T0) correction of the .fi./.psi. force field dihedral parameters significantly influences the free energy profile of the alanine dipeptide.
Chemical Physics Letters. Roč. 503, 4/6 (2011), s. 301-304. ISSN 0009-2614. E-ISSN 1873-4448
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT LC512; GA MŠMT(CZ) LH11020
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: conformational preferences * quantum-mechanics * gas-phase * simulations * peptides
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.337, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006738 - 7.0369237 - ÚOCHB 2012 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Klusák, Vojtěch - Dobeš, P. - Černý, Jiří - Vondrášek, Jiří
How to fragment a polypeptide? An ab initio computational study of pair interactions between amino acida and ligand-amino acids in proteins.
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 76, č. 5 (2011), s. 605-618. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT(CZ) LH11020; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50520701
Klíčová slova: pair interactions * amino acids * protein stabilisation * peptides * correlated ab initio methods
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 1.283, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0203354 - 8.0368061 - ÚOCHB 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kysilka, Jiří - Rubeš, Miroslav - Grajciar, L. - Nachtigall, P. - Bludský, Ota
Accurate Description of Argon and Water Adsorption on Surfaces of Graphene-Based Carbon Allotropes.
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 115, č. 41 (2011), s. 11387-11393. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: density-functional-theory * coronene * potential-energy surfaces * basis-set convergence * physical adsorption * complexes
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.946, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006698 - 9.0351835 - ÚOCHB 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Rubeš, Miroslav - Kysilka, Jiří - Nachtigall, P. - Bludský, Ota
DFT/CC investigation of physical adsorption on a graphite (0001) surface.
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 12, č. 24 (2010), s. 6438-6444. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: potential-energy surfaces * long-range * water * benzene * desorption
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.454, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0191494 - 10.0351546 - ÚOCHB 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Špirko, Vladimír - Rubeš, Miroslav - Bludský, Ota
Ab initio vibrational dynamics of molecular hydrogen on graphene: An effective interaction potential.
Journal of Chemical Physics. Roč. 132, č. 19 (2010), 194708/1-194708/7. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR GAP208/10/0725; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: carbon nanostructures * adsorption * nanotubes
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.920, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0191276