Výsledky vyhledávání
- 1.0384771 - BFÚ 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zgarbová, M. - Luque, F.J. - Šponer, Jiří - Otyepka, M. - Jurečka, P.
A novel approach for deriving force field torsion angle parameters accounting for conformation-dependent solvation effects.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 8, č. 9 (2012), s. 3232-3242. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GD203/09/H046; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA ČR(CZ) GAP208/11/1822; GA ČR(CZ) GAP208/12/1878; GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GAP208/10/1742
Program: GA
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * guanine quadruplex * DNA ligand binding
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.389, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0214301 - 2.0310366 - BFÚ 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Svozil, Daniel - Šponer, Judit E. - Marchan, I. - Pérez, A. - Cheatham III., T.E. - Forti, F. - Luque, F.J. - Orözcö, M. - Šponer, Jiří
Geometrical and electronic structure variability of the sugar-phosphate backbone in nucleic acids.
[Geometrická a elektronická strukturní variabilita cukr-fosfátové páteře v nukleových kyselinách.]
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 112, č. 27 (2008), s. 8188-8197. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC512; GA AV ČR(CZ) IAA400550701; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Grant ostatní: GA AV ČR(CZ) IAA400040802
Program: IA
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: molecular dynamics * force field * quantum chemistry
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.189, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004693 - 3.0039038 - BFÚ 2007 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Jiří - Jurečka, Petr - Marchan, I. - Luque, F.J. - Orozco, M. - Hobza, Pavel
Nature of base stacking: Reference quantum-chemical stacking energies in ten unique B-DNA base-pair steps.
[Povaha base-stackingu: Referenční kvantově-chemická stacking energie v deseti jedinečných B-DNA base-pair stepech.]
Chemistry - A European Journal. Roč. 12, č. 10 (2006), s. 2854-2865. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0388; GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA MŠMT(CZ) LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: ab initio calculations * DNA structures * nucleobases
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.015, rok: 2006
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0133218