Výsledky vyhledávání
- 1.0373427 - BFÚ 2012 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Kašpárková, Jana - Vojtíšková, Marie - Natile, G. - Brabec, Viktor
Unique properties of DNA interstrand cross-links of antitumor oxaliplatin and the effect of chirality of the carrier ligand.
Chemistry - A European Journal. Roč. 14, č. 4 (2008), s. 1330-1341. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA305/05/2030; GA MZd(CZ) NR8562; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LC06030; GA AV ČR(CZ) KAN200200651
Program: LC; KA
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: antitumor agents * DNA * platinum
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.454, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0206528 - 2.0350506 - BFÚ 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Beššeová, Ivana - Réblová, Kamila - Leontis, N.B. - Šponer, Jiří
Molecular dynamics simulations suggest that RNA three-way junctions can act as flexible RNA structural elements in the ribosome.
Nucleic Acids Research. Roč. 38, č. 18 (2010), s. 6247-6264. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA400040802; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA AV ČR(CZ) KJB400040901; GA ČR(CZ) GD203/09/H046; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA MŠMT(CZ) LC06030
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: RNA * molecular dynamics * three-way junction
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 7.836, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0190497 - 3.0347709 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Banáš, P. - Walter, N.G. - Šponer, Jiří - Otyepka, M.
Protonation states of the key active site residues and structural dynamics of the glmS riboswitch as revealed by molecular dynamics.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 114, č. 26 (2010), s. 8701-8712. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA MŠMT(CZ) GD203/09/H046; GA AV ČR(CZ) IAA400040802; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LC512
Program: LC
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: riboswitch * ribozyme * RNA structure * molecular dynamics simulations
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.603, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006029 - 4.0347184 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kašpárková, Jana - Suchánková, T. - Halámiková, Anna - Zerzánková, Lenka - Vrána, Oldřich - Margiotta, N. - Natile, G. - Brabec, Viktor
Cytotoxicity, cellular uptake, glutathione and DNA interactions of an antitumor large-ring PtII chelate complex incorporating the cis-1,4-diaminocyclohexane carrier ligand.
Biochemical Pharmacology. Roč. 79, č. 4 (2010), s. 552-564. ISSN 0006-2952. E-ISSN 1873-2968
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA MŠMT(CZ) ME08017; GA MŠMT(CZ) OC08003; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA AV ČR(CZ) KAN200200651; GA AV ČR(CZ) IAA400040803; GA AV ČR(CZ) GD301/09/H004
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) OC09018
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: DNA * platinum * cancer
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.889, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0188017 - 5.0345370 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zerzánková, Lenka - Suchánková, T. - Vrána, Oldřich - Farrell, N.P. - Brabec, Viktor
Conformation and recognition of DNA modified by a new antitumor dinuclear PtII complex resistant to decomposition by sulfur nucleophiles.
Biochemical Pharmacology. Roč. 79, č. 2 (2010), s. 112-121. ISSN 0006-2952. E-ISSN 1873-2968
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA MŠMT(CZ) ME08017; GA MŠMT(CZ) OC08003; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA AV ČR(CZ) KAN200200651
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) OC09018
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: antitumor * dinuclear platinum complex * DNA damage
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.889, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0186655 - 6.0345276 - BFÚ 2011 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Kašpárková, Jana - Vojtíšková, Marie - Natile, G. - Brabec, Viktor
Unique properties of DNA interstrand cross-links of antitumor oxaliplatin and the effect of chirality of the carrier ligand.
Chemistry - A European Journal. Roč. 14, č. 4 (2008), s. 1330-1341. ISSN 0947-6539. E-ISSN 1521-3765
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA305/05/2030; GA MZd(CZ) NR8562; GA MŠMT(CZ) LC06030; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA AV ČR(CZ) KAN200200651
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: antitumor agents * DNA * platinum
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.454, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0186590 - 7.0345270 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mackay, F.S. - Woods, J.A. - Heringová, Pavla - Kašpárková, Jana - Pizarro, A.M. - Moggach, S.A. - Parsons, S. - Brabec, Viktor - Sadler, P.J.
A potent cytotoxic photoactivated platinum complex.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 104, č. 52 (2007), s. 20743-20748. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA305/05/2030; GA ČR(CZ) GD204/03/H016; GA MZd(CZ) NR8562; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Grant ostatní: GA AV ČR(CZ) KAN200200651
Program: KA
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: cytotoxicity * DNA binding * photochemistry
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 9.598, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0186584 - 8.0345100 - BFÚ 2011 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Němcová, Kateřina - Havran, Luděk - Šebest, Peter - Brázdová, Marie - Pivoňková, Hana - Fojta, Miroslav
A label-free electrochemical test for DNA-binding activities of tumor suppressor protein p53 using immunoprecipitation at magnetic beads.
Analytica Chimica Acta. Roč. 668, č. 2 (2010), s. 166-170. ISSN 0003-2670. E-ISSN 1873-4324
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA500040701; GA ČR(CZ) GP204/07/P476; GA ČR(CZ) GA204/08/1560; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA MŠMT(CZ) LC06035
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: electrochemical analysis * label-free detection * tumor suppressor protein p53
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.310, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0186445 - 9.0345016 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mlýnský, V. - Banáš, P. - Hollas, D. - Réblová, Kamila - Walter, N.G. - Šponer, Jiří - Otyepka, M.
Extensive molecular dynamics simulations showing that canonical G8 and protonated A38H+ forms are most consistent with crystal structures of hairpin ribozyme.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 114, č. 19 (2010), s. 6642-6652. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA MŠMT(CZ) GD203/09/H046; GA AV ČR(CZ) IAA400040802; GA AV ČR(CZ) KJB400040901; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LC512
Program: LC
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * hairpin ribozyme
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.603, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0005937 - 10.0344070 - BFÚ 2011 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Réblová, Kamila - Rázga, Filip - Li, W. - Gao, H. - Frank, J. - Šponer, Jiří
Dynamics of the base of ribosomal A-site finger revealed by molecular dynamics simulations and Cryo-EM.
Nucleic Acids Research. Roč. 38, č. 4 (2010), s. 1325-1340. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA AV ČR(CZ) KJB400040901; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581; GA AV ČR(CZ) IAA400040802; GA ČR(CZ) GA203/09/1476
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: molecular dynamics * Cryo-electron microscopy * RNA
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 7.836, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0186380