Výsledky vyhledávání
- 1.0315732 - ÚOCHB 2009 RIV CZ eng J - Článek v odborném periodiku
Řezáč, Jan - Jurečka, Petr - Riley, Kevin Eugene - Černý, Jiří - Valdes, Haydee - Pluháčková, Kristýna - Berka, Karel - Řezáč, Tomáš - Pitoňák, Michal - Vondrášek, Jiří - Hobza, Pavel
Quantum chemical benchmark energy and geometry database for molecular clusters and complex molecular systems (www.begdb.com): a users manual and examples.
[Kvantově-chemická databáze energií a geometrií molekulových klastrů a komplexních molekulových systémů (www.begdb.com): uživatelský manuál a příklady.]
Collection of Czechoslovak Chemical Communications. Roč. 73, č. 10 (2008), s. 1261-1270. ISSN 0010-0765
Grant CEP: GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: ab initio calculations * coupled cluster method * internet database
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 0.784, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165848 - 2.0315727 - ÚOCHB 2009 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pitoňák, Michal - Neogrady, P. - Řezáč, Jan - Jurečka, Petr - Urban, M. - Hobza, Pavel
Benzene dimer: High-level wave function and density functional theory calculations.
[Benzén dimér: vysoce přesné výpočty založené na teoriích s vlnovou funkcí a maticí hustoty.]
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 4, č. 11 (2008), s. 1829-1834. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT LC512
Grant ostatní: SRDA(SK) APVV-20-018405
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: benzene dimer * wave function calculations * density functional theory calculations
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.274, rok: 2008
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0165843 - 3.0092838 - ÚOCHB 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lee, E. Ch. - Kim, D. - Jurečka, Petr - Tarakeshwar, P. - Hobza, Pavel - Kim, K. S.
Understanding of assembly phenomena by aromatic-aromatic interactions: benzene dimer and the substituted systems.
[Porozumění fenoménu agregace – aromatické interakce: benzén dimer a substituované systémy.]
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 111, č. 18 (2007), s. 3446-3457. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: benzene-dimer * ab initio calculations * substituted benzene dimers
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.918, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004339 - 4.0092039 - ÚOCHB 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Černý, Jiří - Jurečka, Petr - Hobza, Pavel - Valdes, Haydee
Resolution of identity density functional theory augmented with an empirical dispersion term (RI-DFT-D): A promising tool for studying isolated small peptides.
[Metoda RI-DFT rozšířená o empirický disperzní člen: slibný nástroj pro studium izolovaných krátkých peptidů.]
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 111, č. 6 (2007), s. 1146-1154. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Grant CEP: GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Grant ostatní: NSF(US) CHE-0244341
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: DFT * empirical dispersion * small peptides
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Impakt faktor: 2.918, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004321 - 5.0090956 - ÚOCHB 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Sedlák, Robert - Jurečka, Petr - Hobza, Pavel
Density functional theory-symmetry adapted perturbation treatment energy decomposition of nucleic acid base pairs taken from DNA crystal geometry.
[DFT-SAPT energetická dekompozice pro báze nukleových kyselin z krystalových geometrií vzatých z DNA.]
Journal of Chemical Physics. Roč. 127, č. 7 (2007), 075104-1. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR GA203/05/0009; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: nucleic acid base pairs * interaction energy decomposition * dispersion interactions
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.044, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0151678 - 6.0090280 - ÚOCHB 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Bendová, Lada - Jurečka, Petr - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Model of peptide bond - aromatic ring interaction: correlated ab initio quantum chemical study.
[Model interakce peptidová vazba-aromatický kruh: korelovaná ab initio výpočetní studie.]
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 111, č. 33 (2007), s. 9975-9979. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA ČR GA203/05/0009; GA ČR GA203/06/1727
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: peptide bond * aromatic interaction * computional study
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.086, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004271 - 7.0090271 - ÚOCHB 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kubař, Tomáš - Jurečka, Petr - Černý, Jiří - Řezáč, Jan - Otyepka, M. - Valdes, Haydee - Hobza, Pavel
Density-functional, density-functional tight-binding, and wave-function calculations on biomolecular systems.
[Použití výpočetních metod založených na teorii funkcionálu hustoty pro studium biomolekulových soustav a srovnání s jinými kvantově-chemickými metodami.]
Journal of Physical Chemistry A. Roč. 111, č. 26 (2007), s. 5642-5647. ISSN 1089-5639. E-ISSN 1520-5215
Grant CEP: GA MŠMT LC512; GA AV ČR IAA400550510; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA ČR GA203/05/0009
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: density functional theory * empirical dispersion-energy term * non-covalent interactions
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.918, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0004270 - 8.0088717 - BFÚ 2008 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Meneni, S.R. - Shell, S.M. - Gao, L. - Jurečka, Petr - Lee, W. - Šponer, Jiří - Zou, Y. - Chiarelli, M.P. - Cho, B.P.
Spectroscopic and theoretical insights into sequence effects of aminofluorene-induced conformational heterogeneity and nucleotide excision repair.
[Spektroskopický a teoretický pohled do sekvenčních efektů aminufluorenů indukovaný konformační heterogenitou a opravou po vystřižení nukleotidů.]
Biochemistry. Roč. 46, č. 40 (2007), s. 11263-11278. ISSN 0006-2960
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA MŠMT(CZ) LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: nucleotide * HPLC * NMR
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.368, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0150150 - 9.0081213 - ÚOCHB 2007 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Jurečka, Petr - Černý, Jiří - Hobza, Pavel - Salahub, D. R.
Density functional theory augmented with an empirical dispersion term. Interaction energies and geometries of 80 non-covalent complexes compared with ab initio quantum mechanics calculations.
[Teorie funkcionálu hustoty doplněná empirickým diperzním členem. Interakční enrgie a geometrie 80 nekovalentních komplexů porovnány s ab initio kvantově mechanickými výpočty.]
Journal of Computational Chemistry. Roč. 28, č. 2 (2007), s. 555-569. ISSN 0192-8651. E-ISSN 1096-987X
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: dispersion interaction * density functional theory * empirical corrections
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 4.297, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0145159 - 10.0040299 - ÚOCHB 2007 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jurečka, Petr - Šponer, Jiří - Černý, Jiří - Hobza, Pavel
Benchmark database of accurate (MP2 and CCSD(T) complete basis set limit) interaction energies of small model complexes, DNA base pairs, and amino acid pairs.
[Databáze přesných interakčních energií malých modelových komplexů, párů bazí DNA a párů aminokyselin.]
Physical Chemistry Chemical Physics. Roč. 8, č. 17 (2006), s. 1985-1993. ISSN 1463-9076. E-ISSN 1463-9084
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA203/05/0009; GA AV ČR(CZ) IAA400550510; GA MŠMT(CZ) LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506; CEZ:AV0Z50040507
Klíčová slova: accurate interaction energies * DNA base pairs * amino acid pairs
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 2.892, rok: 2006
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0134063