Výsledky vyhledávání
- 1.0585901 - ÚOCHB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Benoni, Barbora - Potužník, Jiří František - Škríba, Anton - Benoni, Roberto - Trylčová, Jana - Tulpa, Matouš - Spustová, Kristina - Grab, K. - Mititelu, Maria Bianca - Pačes, Jan - Weber, Jan - Staněk, David - Kowalska, J. - Bednárová, Lucie - Kečkéšová, Zuzana - Vopálenský, Pavel - Gahurová, Lenka - Cahová, Hana
HIV-1 Infection Reduces NAD Capping of Host Cell snRNA and snoRNA.
ACS Chemical Biology. Roč. 19, č. 6 (2024), s. 1243-1249. ISSN 1554-8929. E-ISSN 1554-8937
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1603; GA MŠMT(CZ) EH22_008/0004575
GRANT EU: European Commission(XE) 101041374 - StressRNaction
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: messenger-RNA * nicotinamide * identification
Impakt faktor: 4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acschembio.4c00151
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353546Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1021acschembio.4c00151.pdf 1 3 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0583694 - ÚMG 2025 GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kvapilová, K. - Misenko, P. - Radvanszky, J. - Brzon, O. - Budis, J. - Gazdarica, J. - Pos, O. - Korabecna, M. - Kašný, M. - Szemes, T. - Kvapil, P. - Pačes, Jan - Kozmik, Zbyněk
Validated WGS and WES protocols proved saliva-derived gDNA as an equivalent to blood-derived gDNA for clinical and population genomic analyses.
BMC Genomics. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 187. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Genomics variant analysis * Saliva-derived gDNA * Whole genome sequencing * Whole exome sequencing * Validation guideline
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-024-10080-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352871 - 3.0574713 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Schlebusch, S. A. - Rídl, Jakub - Poignet, M. - Ruiz-Ruano, F. J. - Reif, J. - Pajer, P. - Pačes, Jan - Albrecht, Tomáš - Suh, A. - Reifová, R.
Rapid gene content turnover on the germline-restricted chromosome in songbirds.
Nature Communications. Roč. 14, č. 1 (2023), č. článku 4579. E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055; GA ČR(CZ) GA20-23794S; GA ČR(CZ) GA23-07287S
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:68081766
Klíčová slova: germline-restricted chromosome (GRC) * songbirds * genetic composition
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Zoology (UBO-W)
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-023-40308-8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346859Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0574713.pdf 0 1.4 MB Vydavatelský postprint povolen - 4.0571759 - ÚMG 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Kuželová, Andrea - Dupačová, Naoko - Antošová, Barbora - Sunny, Sweetu Susan - Kozmik Jr, Zbyněk - Pačes, Jan - Skoultchi, A. - Stopka, T. - Kozmik, Zbyněk
Chromatin Remodeling Enzyme Snf2h Is Essential for Retinal Cell Proliferation and Photoreceptor Maintenance.
Cells. Roč. 12, č. 7 (2023), č. článku 1035. E-ISSN 2073-4409
Grant CEP: GA ČR GA21-27364S; GA MZd NU22-05-00374; GA MŠMT LX22NPO5102
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Snf2h * Smarca5 * retina * photoreceptors * cell cycle * apoptosis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4409/12/7/1035
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343046Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup cells-kuzelova-23.pdf 0 21.9 MB Vydavatelský postprint povolen - 5.0559536 - ÚOCHB 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Šimonová, Anna - Romanská, Veronika - Benoni, Barbora - Škubník, K. - Šmerdová, L. - Procházková, M. - Spustová, Kristina - Moravčík, Ondřej - Gahurová, Lenka - Pačes, Jan - Plevka, P. - Cahová, Hana
Honeybee Iflaviruses Pack Specific tRNA Fragments from Host Cells in Their Virions.
Chembiochem. Roč. 23, č. 17 (2022), č. článku e202200281. ISSN 1439-4227. E-ISSN 1439-7633
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1603; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68378050
Klíčová slova: human Rhinovirus type 2 * human Echovirus 18 * LC-MS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1002/cbic.202200281
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0332804
Vědecká data: ENA - 6.0555440 - ÚMG 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Žárský, V. - Klimeš, V. - Pačes, Jan - Vlček, Čestmír - Hradilová, Miluše - Benes, V. - Nývltová, E. - Hrdý, I. - Pyrih, J. - Mach, J. - Barlow, L. - Stairs, C.W. - Eme, L. - Hall, N. - Eliáš, M. - Dacks, Joel Bryan - Roger, A. - Tachezy, J.
The Mastigamoeba balamuthi Genome and the Nature of the Free-Living Ancestor of Entamoeba.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 38, č. 6 (2021), s. 2240-2259. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ II - 90131
Institucionální podpora: RVO:68378050 ; RVO:60077344
Klíčová slova: evolution of parasitism * lateral gene transfer * pathway complexity * Archamoebae * chitinous cysts * Mastigamoeba
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 8.800, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/38/6/2240/6126414?login=false
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329973 - 7.0544817 - ÚMG 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dupačová, Naoko - Antošová, Barbora - Pačes, Jan - Kozmik, Zbyněk
Meis homeobox genes control progenitor competence in the retina.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 118, č. 12 (2021), č. článku e2013136118. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-20759S; GA MŠMT(CZ) LQ1604; GA MŠMT(CZ) LM2018126; GA MŠMT ED2.1.00/19.0395; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: retina * Meis * development
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 12.779, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.pnas.org/content/118/12/e2013136118
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321624 - 8.0531934 - ÚMG 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kočí, J. - Roslein, J. - Pačes, Jan - Kotusz, J. - Halacka, K. - Koščo, J. - Fedorčák, J. - Iakovenko, N. - Janko, K.
No evidence for accumulation of deleterious mutations and fitness degradation in clonal fish hybrids: Abandoning sex without regrets.
Molecular Ecology. Roč. 29, č. 16 (2020), s. 3038-3055. ISSN 0962-1083. E-ISSN 1365-294X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: asexuality * clonal decay * exome capture * fitness * Muller's ratchet * mutation load
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 6.185, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1111/mec.15539
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310565 - 9.0522861 - ÚMG 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Simonova, A. - Svojanovska, B. - Trylcová, J. - Hubálek, M. - Moravčík, Ondřej - Zavrel, M. - Pavova, M. - Hodek, J. - Weber, J. - Cvacka, J. - Pačes, Jan - Cahova, H.
LC/MS analysis and deep sequencing reveal the accurate RNA composition in the HIV-1 virion.
Scientific Reports. Roč. 9, June (2019), č. článku 8697. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: messenger-rna * noncoding rnas * 7sl rna * n-1-methyladenosine * pseudouridylation * identification * trna(lys) * protein
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.998, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-019-45079-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307281 - 10.0522700 - ÚMG 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bartoš, O. - Roslein, J. - Kotusz, J. - Pačes, Jan - Pekárik, L. - Petrtýl, M. - Halacka, K. - Kašparová, E. - Mendel, J. - Boron, A. - Juchno, D. - Leska, A. - Jablonska, O. - Benes, V. - Sidova, M. - Janko, K.
The Legacy of Sexual Ancestors in Phenotypic Variability, Gene Expression, and Homoeolog Regulation of Asexual Hybrids and Polyploids.
Molecular Biology and Evolution. Roč. 36, č. 9 (2019), s. 1902-1920. ISSN 0737-4038. E-ISSN 1537-1719
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: asexuality * polyploidy * hybridization * tissue-specific gene expression * expression-level dominance * cis-/trans-regulation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 11.062, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/mbe/article/36/9/1902/5488194
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307150