Výsledky vyhledávání
- 1.0586626 - ÚEB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Pavlů, Šimon - Nikumbh, S. - Kováčik, Martin - An, T. - Lenhard, B. - Šimková, Hana - Navrátilová, Pavla
Core promoterome of barley embryo.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 23, DEC (2024), s. 264-277. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-18794S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Cap Analysis of Gene Expression * Core promoter * Hordeum vulgare * Initiator * Morex * TOR-signaling * Transcription regulation
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.12.003
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0354071Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2024_Pavlu_Computational and Structural Biotechnology Journal_264.pdf 1 12.7 MB Jiná povolen - 2.0586144 - ÚEB 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Brabham, H. J. - Gomez De La Cruz, D. - Were, V. - Shimizu, M. - Saitoh, N. - Hernández-Pinzón, I. - Green, P.R. - Lorang, J. - Fujisaki, K. - Sato, K. - Molnár, István - Šimková, Hana - Doležel, Jaroslav - Russell, J. M. - Taylor, J. - Smoker, M. - Gupta, Y. K. - Wolpert, T. - Talbot, N. J. - Terauchi, R. - Moscou, M. J.
Barley MLA3 recognizes the host-specificity effector Pwl2 from Magnaporthe oryzae.
Plant Cell. Roč. 36, č. 2 (2024), s. 447-470. ISSN 1040-4651. E-ISSN 1532-298X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: powdery-mildew-resistance * leucine-rich repeat * nbs-lrr gene * f-sp hordei * disease-resistance * blast fungus * conferring resistance * convergent evolution * pathogen effector * arabidopsis
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 12.0, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/plcell/koad266
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353729Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2024_Brabham_PLANT CELL_447.pdf 1 57.2 MB Jiná povolen - 3.0572698 - ÚEB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Boden, S. A. - McIntosh, R.A. - Uauy, C. - Krattinger, S.G. - Dubcovsky, J. - Rogers, W. J. - Xia, X. C. - Badaeva, E.D. - Bentley, A. R. - Brown-Guedira, G. - Caccamo, M. - Cattivelli, L. - Chhuneja, P. - Cockram, J. - Contreras-Moreira, B. - Dreisigacker, S. - Edwards, D. - González, F. G. - Guzmán, C. - Ikeda, T. M. - Karsai, I. - Nasuda, S. - Pozniak, C. - Prins, R. - Sen, T. Z. - Silva, P. J. - Šimková, Hana - Zhang, Y.
Updated guidelines for gene nomenclature in wheat.
Theoretical and Applied Genetics. Roč. 136, č. 4 (2023), č. článku 72. ISSN 0040-5752. E-ISSN 1432-2242
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Abiotic stress tolerances * Gene annotation * Genetic information
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1007/s00122-023-04253-w
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343305Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Boden_Theoretical and Applied Genetics_72.pdf 3 1.2 MB Jiná povolen - 4.0572694 - ÚEB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kubalová, I. - Câmara, A. S. - Cápal, Petr - Beseda, Tomáš - Rouillard, J.-M. - Krause, G. M. - Holušová, Kateřina - Toegelová, Helena - Himmelbach, A. - Stein, N. - Houben, A. - Doležel, Jaroslav - Mascher, M. - Šimková, Hana - Schubert, V.
Helical coiling of metaphase chromatids.
Nucleic Acids Research. Roč. 51, č. 6 (2023), s. 2641-2654. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC18-14450J; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: MITOTIC CHROMOSOME STRUCTURE * SPIRAL STRUCTURE * TRADESCANTIA-REFLEXA
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 14.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1093/nar/gkad028
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343302Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2023_Kubalova_NUCLEIC ACIDS RESEARCH_2641_____@@@.pdf 2 12.3 MB Jiná povolen - 5.0568618 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Hofstatter, P. G. - Thangavel, G. - Lux, T. - Neumann, Pavel - Vondrak, Tihana - Novák, Petr - Zhang, M. - Costa, L. - Castellani, M. - Scott, A. - Toegelová, Helena - Fuchs, J. - Mata-Sucre, Y. - Dias, Y. - Vanzela, A.L.L. - Huettel, B. - Almeida, C. C. S. - Šimková, Hana - Souza, G. - Pedrosa-Harand, A. - Macas, Jiří - Mayer, K. F. X. - Houben, A. - Marques, A.
Repeat-based holocentromeres influence genome architecture and karyotype evolution.
Cell. Roč. 185, č. 17 (2022), s. 3153-3168. ISSN 0092-8674. E-ISSN 1097-4172
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-24252S; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61389030
Klíčová slova: spatial genome organization * holocentric chromosomes * genome regulation * centromere * Rhynchospora * transposable elements * whole-genome duplication
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3); Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (UEB-Q)
Impakt faktor: 64.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0092867422007978?via%3Dihub#kwrds0010
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339891 - 6.0562062 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Holden, S. - Bergum, M. - Green, P.R. - Bettgenhaeuser, J. - Hernández-Pinzón, I. - Thind, A. - Clare, S. - Russell, J. M. - Hubbard, A. - Taylor, J. - Smoker, M. - Gardiner, M. - Civolani, L. - Cosenza, F. - Rosignoli, S. - Strugala, R. - Molnár, István - Šimková, Hana - Doležel, Jaroslav - Schaffrath, U. - Barrett, M. - Salvi, S. - Moscou, M. J.
A lineage-specific Exo70 is required for receptor kinase-mediated immunity in barley.
Science Advances. Roč. 8, č. 27 (2022), č. článku eabn7258. ISSN 2375-2548. E-ISSN 2375-2548
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: LEUCINE-RICH REPEAT * DISEASE RESISTANCE * EXOCYST
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 13.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1126/sciadv.abn7258
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334478Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Holden_SCIENCE ADVANCES_eabn7258.pdf 1 2 MB Jiná povolen - 7.0561822 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Navrátilová, Pavla - Toegelová, Helena - Tulpová, Zuzana - Kuo, Y. T. - Stein, N. - Doležel, Jaroslav - Houben, A. - Šimková, Hana - Mascher, M.
Prospects of telomere-to-telomere assembly in barley: Analysis of sequence gaps in the MorexV3 reference genome.
Plant Biotechnology Journal. Roč. 20, č. 7 (2022), s. 1373-1386. ISSN 1467-7644. E-ISSN 1467-7652
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827; GA MŠMT(CZ) LM2018131; GA ČR(CZ) GA17-17564S; GA ČR(CZ) GC18-14450J
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: CenH3 * Cereba * ChIP-seq * flow cytometry * nanopore * PacBio HiFi reads * ribosomal DNA * satellite * telomeric repeats
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 13.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1111/pbi.13816
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334316Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Navratilova_Plant Biotechnology Journal_1373.pdf 1 3.9 MB Jiná povolen - 8.0558708 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tulpová, Zuzana - Kovařík, Aleš - Toegelová, Helena - Navrátilová, Pavla - Kapustová, Veronika - Hřibová, Eva - Vrána, Jan - Macas, Jiří - Doležel, Jaroslav - Šimková, Hana
Fine structure and transcription dynamics of bread wheat ribosomal DNA loci deciphered by a multi-omics approach.
Plant Genome. Roč. 15, č. 1 (2022), č. článku e20191. E-ISSN 1940-3372
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-17564S; GA ČR(CZ) GA19-03442S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827; GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68081707 ; RVO:60077344
Klíčová slova: RNA GENES * CYTOSINE METHYLATION * GENOME
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Genetics and heredity (medical genetics to be 3) (BC-A)
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1002/tpg2.20191
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0332273Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Tulpova_PLANT GENOME_e20191.pdf 1 1.9 MB Jiná povolen - 9.0549408 - ÚEB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mascher, M. - Wicker, T. - Jenkins, J. - Plott, C. - Lux, T. - Koh, C. S. - Ens, J. - Gundlach, H. - Boston, L. B. - Tulpová, Zuzana - Holden, S. - Hernández-Pinzón, I. - Scholz, U. - Mayer, K. F. X. - Spannagl, M. - Pozniak, C. - Sharpe, A. J. - Šimková, Hana - Moscou, M. J. - Grimwood, J. - Schmutz, J. - Stein, N.
Long-read sequence assembly: A technical evaluation in barley.
Plant Cell. Roč. 33, č. 6 (2021), s. 1888-1906. ISSN 1040-4651. E-ISSN 1532-298X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA17-17564S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827; GA MŠMT(CZ) LM2015047
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: DISEASE RESISTANCE * GENOME * ALIGNMENT
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 12.085, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1093/plcell/koab077
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325425Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2021_Mascher_PLANT CELL_1888.pdf 1 3.7 MB Jiná povolen - 10.0548808 - ÚEB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Blavet, Nicolas - Yang, H. - Su, H. Y. - Solanský, Pavel - Douglas, R. N. - Karafiátová, Miroslava - Šimková, Lucie - Zhang, J. - Liu, Y. - Hou, J. - Shi, X. - Chen, C. - El-Walid, M. - McCaw, M. E. - Albert, P. S. - Gao, Z. - Zhao, C. - Ben-Zvi, G. - Glick, L. - Kol, G. - Shi, J. - Vrána, Jan - Šimková, Hana - Lamb, J. H. - Newton, K. - Dawe, R. K. - Doležel, Jaroslav - Ji, T. - Baruch, K. - Cheng, J. - Han, F. Z. - Birchler, J. A. - Bartoš, Jan
Sequence of the supernumerary B chromosome of maize provides insight into its drive mechanism and evolution.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America. Roč. 118, č. 23 (2021), č. článku e2104254118. ISSN 0027-8424. E-ISSN 1091-6490
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-12338Y; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: B chromosome * Genetic drive * Nondisjunction * Preferential fertilization
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 12.779, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.1073/PNAS.2104254118
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0324856Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2021_Blavet_PNAS_e2104254118.pdf 1 1.9 MB Jiná povolen