Výsledky vyhledávání
- 1.0332814 - BFÚ 2010 AT eng A - Abstrakt
Špačková, Naďa - Šponer, Jiří
Computer simulations on guanine quadruplexes - focused on loops.
[Počítačové simulace guaninových kvadruplexů - zaměřeno na smyčky.]
Abstracts. Ötz Valley, 2009. IL-04.
[Self-Assembly of Guanosine Derivatives: From Biological Systems to Nanotechnological Applications. 20.06.2009-25.06.2009, Ötz Valley]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: molecular dynamics * guanine quadruplex * quadruplex loop
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0177950 - 2.0127007 - BFU-R 20033090 DE eng A - Abstrakt
Špačková, Naďa - Réblová, K. - Leontis, N. B. - Šponer, Jiří
Structure and dynamics of RNA motifs: non-Watson-Crick base pairing, ordered hydration and cation binding.
European Biophysics Journal With Biophysics Letters. Roč. 32, č. 3 (2003), s. 211. ISSN 0175-7571. E-ISSN 1432-1017.
[European Biophysics Congress /4./. 05.07.2003-09.07.2003, Alicante]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: RNA motifs * Loop E * molecular dynamics
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025232 - 3.0127004 - BFU-R 20033087 US eng A - Abstrakt
Réblová, K. - Špačková, Naďa - Koča, J. - Leontis, N. B. - Šponer, Jiří
Non-Watson-Crick base pairing and hydration in RNA motifs: molecular dynamics of 5S rRNA loop E.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Taylor & Francis. Roč. 20, č. 6 (2003), s. 986. ISSN 0739-1102.
[Albany 2003: Conversation 13. 17.06.2003-21.06.2003, Albany]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: non-Watson-Crick base pairs * Loop E * RNA
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025229 - 4.0127002 - BFU-R 20033085 US eng A - Abstrakt
Špačková, Naďa - Štefl, R. - Berger, I. - Fadrná, E. - Koča, J. - Cheatham III, T. E. - Šponer, Jiří
Molecular dynamics of guanine quadruplex molecules.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Taylor & Francis. Roč. 20, č. 6 (2003), s. 889. ISSN 0739-1102.
[Albany 2003: Conversation 13. 17.06.2003-21.06.2003, Albany]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: molecular dynamics * guanine quadruplex * quadruplex formation
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025227 - 5.0127001 - BFU-R 20033084 US eng A - Abstrakt
Šponer, Jiří - Mokdad, A. - Šponer, Judit E. - Špačková, Naďa - Leszczynski, J. - Leontis, N. B.
Unique tertiary and neighbor interactions determine conservation patterns of cis Watson-Crick A/G base pairs: the role of nonplanar guanine amino group.
Journal of Biomolecular Structure & Dynamics. Taylor & Francis. Roč. 20, č. 6 (2003), s. 945. ISSN 0739-1102.
[Albany 2003: Conversation 13. 17.06.2003-21.06.2003, Albany]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: Watson-Crick A/G base pairs * guanine amino group
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025226 - 6.0126911 - BFU-R 20023213 US eng A - Abstrakt
Csaszar, K. - Špačková, Naďa - Šponer, Jiří - Leontis, N. B.
Molecular dynamics simulations of RNA motifs.
Abstracts of papers - American Chemical Society. Roč. 223, - (2002), s. 154. ISSN 0065-7727.
[Annual Meeting of the American Chemistry Society /223./. 07.04.2002-11.04.2002, Orlando]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: molecular dynamics * RNA * hydration
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025138 - 7.0126909 - BFU-R 20023211 CZ eng A - Abstrakt
Fadrná, E. - Špačková, Naďa - Šponer, Jiří - Koča, J.
DNA quadruplexes with lateral loops ů molecular modelling study of conformational behavior.
Chemometrics VI: Abstracts Book. Brno: Masarykova univerzita, 2002. s. 17. ISBN 80-210-2918-8.
[Chemometrics /4./: International Chemometric Conference. 01.09.2002-05.09.2002, Brno]
Grant CEP: GA MŠMT LN00A016
Klíčová slova: MD simulations * quadruplex * lateral loop
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025136 - 8.0126908 - BFU-R 20023210 CZ eng A - Abstrakt
Réblová, K. - Špačková, Naďa - Štefl, R. - Csaszar, K. - Koča, J. - Leontis, B. N. - Šponer, Jiří
Molecular dynamics of the 5S rRNA loop E.
Chemometrics VI: Abstracts Book. Brno: Masarykova univerzita, 2002. s. 18. ISBN 80-210-2918-8.
[Chemometrics /4./: International Chemometric Conference. 01.09.2002-05.09.2002, Brno]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: MD simulations * ribosomal RNA * loop E
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025135 - 9.0126906 - BFU-R 20023208 US eng A - Abstrakt
Šponer, Jiří - Šponer, Judit E. - Mokdad, A. - Špačková, Naďa - Leontis, N. B. - Leszczynski, J.
Unique molecular interactions and conservation patterns of cis Watson-Crick G.A base pairs in RNA and DNA.
11th CCTCC Proceedings. Jackson: Jackson State University, 2002. s. 154-155.
[Conference on Current Trends in Computational Chemistry /11./. 01.11.2002-02.11.2002, Jackson]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: RNA * DNA * G.A basepair
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0025133 - 10.0126770 - BFU-R 20023069 CZ cze A - Abstrakt
Špačková, Naďa
Studium neobvyklých forem nukleových kyselin metodou molekulové dynamiky.
[Molecular dynamics studies of unusual nucleic acids forms.]
Chemické listy. Česká společnost chemická. Roč. 96, č. 6 (2002), s. 426. ISSN 0009-2770. E-ISSN 1213-7103.
[Sjezd chemických společností /54./. 30.06.2002-04.07.2002, Brno]
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: molecular dynamics * explicit solvent * G-quadruplex
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0024998