Výsledky vyhledávání
- 1.0586305 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Füssy, Z. - Stairs, C.W. - Leger, M.M. - Tachezy, J. - Čepička, I. - Roger, A.J. - Hampl, V.
Comparative analysis of mitochondrion- related organelles in anaerobic amoebozoans.
Microbial Genomics. Roč. 9, č. 11 (2023), č. článku 001143. ISSN 2057-5858. E-ISSN 2057-5858
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: glycine cleavage system * molecular evidence * reaction-mechanism * carrier family * l-threonine * protein * archamoebae * entamoeba * evolution * diversity * reductive evolution * mitochondrion-related organelles * anaerobiosis * comparative genomics
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/mgen/10.1099/mgen.0.001143
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353858 - 2.0580521 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Novák, L.V.F. - Treitli, S.C. - Pyrih, J. - Halakuc, P. - Pipaliya, S.V. - Vacek, V. - Brzon, O. - Soukal, P. - Eme, L. - Dacks, Joel Bryan - Karnkowska, A. - Eliáš, M. - Hampl, V.
Genomics of Preaxostyla Flagellates Illuminates the Path Towards the Loss of Mitochondria.
PLoS Genetics. Roč. 19, č. 12 (2023), č. článku e1011050. ISSN 1553-7404. E-ISSN 1553-7404
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: entamoeba-histolytica * golgi stacking * annotation * metabolism * reduction * evolution * proteins * sequence * dehydrogenase * localization
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.plos.org/plosgenetics/article?id=10.1371/journal.pgen.1011050
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349292 - 3.0567556 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fang, Y. K. - Vaitová, Zuzana - Hampl, V.
A mitochondrion-free eukaryote contains proteins capable of import into an exogenous mitochondrion-related organelle.
Open Biology. Roč. 13, č. 1 (2023), č. článku 220238. E-ISSN 2046-2441
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: mitochondrion-free eukaryote * hydrogenosome * protein import * evolution of protein targeting
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1098/rsob.220238
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338805 - 4.0567408 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Ebenezer, T. G. E. - Low, R. S. - O'Neill, E. C. - Huang, I. - DeSimone, A. - Farrow, S. C. - Field, R. - Ginger, M. L. - Guerrero, S.A. - Hammond, Michael John - Hampl, V. - Horst, G. - Ishikawa, T. - Karnkowska, A. - Linton, E.W. - Myler, P. J. - Nakazawa, M. - Cardol, P. - Sánchez-Thomas, R. - Saville, B.J. - Shah, M.R. - Simpson, A.G.B. - Sur, A. - Suzuki, K. - Tyler, K.M. - Zimba, P. V. - Hall, N. - Field, Mark Christian
Euglena International Network (EIN): Driving euglenoid biotechnology for the benefit of a challenged world.
Biology Open. Roč. 11, č. 11 (2022), č. článku NOV. ISSN 2046-6390. E-ISSN 2046-6390
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Biofuels * Bioremediation * Biotechnology * Euglena * Food supplements * Networks
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.biologists.com/bio/article/11/11/bio059561/284354/Euglena-International-Network-EIN-Driving
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338701 - 5.0555513 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Záhonová, Kristýna - Treitli, S.C. - Le, T. - Škodová-Sveráková, Ingrid - Hanousková, P. - Čepička, I. - Tachezy, J. - Hampl, V.
Anaerobic derivates of mitochondria and peroxisomes in the free-living amoeba Pelomyxa schiedti revealed by single-cell genomics.
BMC BIOLOGY. Roč. 20, č. 1 (2022), č. článku 56. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA19-19297S; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA MŠMT(CZ) EF18_046/0016045
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: protein import * rna-seq * alignment * evolution * mechanism * system * origin * dehydrogenases * organelles * eukaryote * Pelomyxa * Mitochondrion-related organelle * Hydrogenosome * Anaerobic peroxisome * Anaerobiosis * FeS cluster assembly * Single-cell genomics
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01247-w
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340550 - 6.0555493 - ÚMG 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Soukal, P. - Hrdá, Š. - Karnkowska, A. - Milanowski, R. - Szabová, J. - Hradilová, Miluše - Strnad, Hynek - Vlček, Čestmír - Čepička, I. - Hampl, V.
Heterotrophic euglenid Rhabdomonas costata resembles its phototrophic relatives in many aspects of molecular and cell biology.
Scientific Reports. Roč. 11, č. 1 (2021), č. článku 13070. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LQ1604
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: phylogenetic analysis * energy-metabolism * sequence * introns * genome * rna * alignment * proteins * gracilis * identification
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 4.997, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-021-92174-3
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330000 - 7.0540689 - BC 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tomečková, A. - Tomčala, Aleš - Oborník, Miroslav - Hampl, V.
The Lipid Composition of Euglena gracilis Middle Plastid Membrane Resembles That of Primary Plastid Envelopes.
Plant Physiology. Roč. 184, č. 4 (2020), s. 2052-2063. ISSN 0032-0889. E-ISSN 1532-2548
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: trap mass-spectrometry * chloroplast genome * complex chloroplasts * fatty-acid * protein * biosynthesis * evolution * phospholipids * synthase * light
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 8.340, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://academic.oup.com/plphys/article/184/4/2052/6119037
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318307 - 8.0538892 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vanclová-Novák, A.M.G. - Zoltner, M. - Kelly, S. - Soukal, P. - Záhonová, Kristýna - Füssy, Zoltán - Ebenezer, T.E. - Dobáková, Eva - Eliáš, M. - Lukeš, Julius - Field, Mark Christian - Hampl, V.
Metabolic quirks and the colourful history of the Euglena gracilis secondary plastid.
New Phytologist. Roč. 225, č. 4 (2020), s. 1578-1592. ISSN 0028-646X. E-ISSN 1469-8137
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1601; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: methylerythritol phosphate-pathway * chloroplast transit peptides * protein import * gene-transfer * targeted proteins * genome evolution * signal peptides * messenger-rnas * biosynthesis * complex * Euglena gracilis * lateral gene transfer * metabolic reconstruction * plastid * proteome * protein import * shopping bag hypothesis * SUF pathway
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 10.152, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://nph.onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/nph.16237
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316636 - 9.0537292 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Butenko, Anzhelika - Opperdoes, F. R. - Flegontova, Olga - Horák, Aleš - Hampl, V. - Keeling, P. J. - Gawryluk, R. M. R. - Tikhonenkov, D. V. - Flegontov, Pavel - Lukeš, Julius
Evolution of metabolic capabilities and molecular features of diplonemids, kinetoplastids, and euglenids.
BMC BIOLOGY. Roč. 18, č. 1 (2020), č. článku 23. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LL1601; GA ČR(CZ) GA18-15962S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: fatty-acid synthesis * d-glucosyl-hydroxymethyluracil * multiple sequence alignment * trypanosoma-brucei * dna-replication * functional-characterization * glutathione-reductase * rna-seq * trypanothione biosynthesis * saccharomyces-cerevisiae * Metabolism * Comparative genomics * Evolution * Kinetoplastea * Diplonemea * Euglenida * Kinetochores * Trypanothione
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 7.431, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-020-0754-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0315020 - 10.0537241 - BC 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Faktorová, Drahomíra - Nisbet, R.E.R. - Robledo, J.A.F. - Casacuberta, E. - Sudek, L. - Allen, A. E. - Ares, M. - Areste, C. - Balestreri, C. - Barbrook, A.C. - Beardslee, P. - Bender, S. - Booth, D.S. - Bowler, C. - Breglia, S.A. - Brownlee, C. - Burger, G. - Cerutti, H. - Cesaroni, R. - Chiurillo, M.A. - Clemente, T. - Coles, D.B. - Collier, J.L. - Cooney, E.C. - Coyne, K. - Docampo, R. - Dupont, C.L. - Edgcomb, V. - Einarsson, E. - Elustondo, P.A. - Federici, F. - Freire-Beneitez, V. - Freyria, N.J. - Fukuda, K. - Garcia, P.A. - Girguis, P.R. - Gomaa, F. - Hampl, V. - Kachale, Ambar - Kaur, Binnypreet - Keeling, P. J. - Vanclová-Novák, A.M.G. - Pyrih, J. - Lukeš, Julius … celkem 113 autorů
Genetic tool development in marine protists: emerging model organisms for experimental cell biology.
Nature Methods. Roč. 17, č. 5 (2020), s. 481-494. ISSN 1548-7091. E-ISSN 1548-7105
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Grant ostatní: Gordon and Betty Moore Foundation(US) GMBM4982.01
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: homologous recombination * transformation * genome
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 28.547, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41592-020-0796-x
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314982