Výsledky vyhledávání
- 1.0576660 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Miklík, Dalibor - Grim, Jiří - Elleder, Daniel - Hejnar, Jiří
Unraveling the palindromic and nonpalindromic motifs of retroviral integration site sequences by statistical mixture models.
Genome Research. Roč. 33, č. 8 (2023), s. 1395-1408. ISSN 1088-9051. E-ISSN 1549-5469
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA19-23407S
Institucionální podpora: RVO:67985556 ; RVO:68378050
Klíčová slova: IMMUNODEFICIENCY-VIRUS TYPE-1 * HIV-1 INTEGRATION * HUMAN GENOME
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8) (UTIA-B)
Impakt faktor: 7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://genome.cshlp.org/content/33/8/1395
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346204Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup genome-miklík-23.pdf 1 7.2 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0576287 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Valášek, Leoš Shivaya - Kučerová, Michaela - Zeman, Jakub - Beznosková, Petra
Cysteine tRNA acts as a stop codon readthrough-inducing tRNA in the human HEK293T cell line.
RNA. Roč. 29, č. 9 (2023), s. 1379-1387. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-00579S; GA ČR(CZ) GF23-08669L
Grant ostatní: AV ČR(CZ) Premium Academiae of the Academy of Sciences of the Czech Republic
Program: Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: cysteine tRNA * near-cognate tRNA * readthrough-inducing tRNA * translation * stop codon readthrough
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rnajournal.cshlp.org/content/29/9/1379
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345856 - 3.0574517 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Voegele, J. - Duchardt-Ferner, E. - Kruse, Holger - Zhang, Zhengyue - Šponer, Jiří - Krepl, Miroslav - Woehnert, J.
Structural and dynamic effects of pseudouridine modifications on noncanonical interactions in RNA.
RNA. Roč. 29, č. 6 (2023), s. 790-807. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-05639S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: pseudouridine * RNA structure * U-turn * U base pair * nmr * MD simulations
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rnajournal.cshlp.org/content/29/6/790
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350076 - 4.0572346 - ARÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Fernandes, D. M. - Sirak, K. A. - Cheronet, O. - Novak, M. - Brück, F. - Zelger, E. - Llanos-Lizcano, A. - Wagner, A. - Zettl, A. - Mandl, K. - Duffet Carlson, K. S. - Oberreiter, V. - Özdoğan, K. T. - Sawyer, S. - La Pastina, F. - Borgia, E. - Coppa, A. - Dobeš, Miroslav - Velemínský, P. - Reich, D. - Bell, L. S. - Pinhasi, R.
Density separation of petrous bone powders for optimized ancient DNA yields.
Genome Research. Roč. 33, č. 4 (2023), s. 622-631. ISSN 1088-9051. E-ISSN 1549-5469
Institucionální podpora: RVO:67985912
Klíčová slova: ancient DNA * DNA extraction * density separation
Obor OECD: Archaeology
Impakt faktor: 7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access s časovým embargem
https://genome.cshlp.org/content/33/4/622
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0343081 - 5.0565102 - BC 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cavallin, I. - Bartosovic, M. - Skalický, Tomáš - Rengaraj, P. - Demko, M. - Schmidt-Dengler, M.C. - Drino, A. - Helm, M. - Vanacova, S.
HITS-CLIP analysis of human ALKBH8 reveals interactions with fully processed substrate tRNAs and with specific noncoding RNAs.
RNA. Roč. 28, č. 12 (2022), s. 1568-1581. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: alkbh8 * Trm9 * wobble uridine modification * mcm(5)U * mcm(5)s(2)U * hits-clip
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rnajournal.cshlp.org/content/28/12/1568
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338513 - 6.0564481 - ÚBO 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Žák, Jakub - Dyková, I. - Blažek, Radim - Reichard, Martin
Good practices for histological analysis of the annual killifish Nothobranchius furzeri (Nothobranchiidae).
Cold Spring Harbor protocols. Roč. 2022, č. 11 (2022), s. 574-583. ISSN 1940-3402. E-ISSN 1559-6095
Institucionální podpora: RVO:68081766
Klíčová slova: Animals * Eosine Yellowish-(YS) * Fundulidae * Microtomy * Paraffin * Staining and Labeling
Obor OECD: Zoology
Způsob publikování: Omezený přístup
http://cshprotocols.cshlp.org/content/2022/11/pdb.prot107739.long
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336140 - 7.0564480 US BCA
Cold Spring Harbor protocols.
Cold Spring Harbor Laboratory Press. ISSN 1940-3402. E-ISSN 1559-6095 - 8.0538704 - BC 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mehta, V. - Moshiri, H. - Srikanth, A. - Kala, S. - Lukeš, Julius - Salavati, R.
Sulfonated inhibitors of the RNA editing ligases validate the essential role of the MRP1/2 proteins in kinetoplastid RNA editing.
RNA. Roč. 26, č. 7 (2020), s. 827-835. ISSN 1355-8382. E-ISSN 1469-9001
Grant CEP: GA ČR GA204/09/1667
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: trypanosoma-brucei * guide-rna * binding proteins * u-deletion * early step * in-vitro * complex * mitochondria * gbp21 * matchmaking * trypanosome * RNA editing * mrp1/2 * inhibitor * RNA-binding protein * RNA editing initiation
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 4.942, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://rnajournal.cshlp.org/content/26/7/827
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0316448 - 9.0521508 - ÚMG 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mihola, Ondřej - Pratto, F. - Brick, K. - Linhartová, Eliška - Kobets, Tetyana - Flachs, Petr - Baker, C.L. - Sedláček, Radislav - Paigen, K. - Petkov, P.M. - Camerini-Otero, R.D. - Trachtulec, Zdeněk
Histone methyltransferase PRDM9 is not essential for meiosis in male mice.
Genome Research. Roč. 29, č. 7 (2019), s. 1078-1086. ISSN 1088-9051. E-ISSN 1549-5469
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-20728S; GA ČR(CZ) GA16-06548S; GA MŠMT(CZ) LM2015040; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT LO1419; GA MŠMT ED2.1.00/19.0395
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: double-strand breaks * recombination hotspots * localization * infertility * speciation * asynapsis * musculus * strains * drive * gene
Obor OECD: Reproductive biology (medical aspects to be 3)
Impakt faktor: 11.093, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://genome.cshlp.org/content/29/7/1078
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0306110Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Genome_Research_O_Mihola_2019.pdf 3 8.7 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 10.0501657 - BFÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Guiblet, W.M. - Cremona, M.A. - Cechova, M. - Harris, R.S. - Kejnovská, Iva - Kejnovský, Eduard - Eckert, K. - Chiaromonte, F. - Makova, K.D.
Long-read sequencing technology indicates genome-wide effects of non-B DNA on polymerization speed and error rate.
Genome Research. Roč. 28, č. 12 (2018), s. 1767-1778. ISSN 1088-9051. E-ISSN 1549-5469
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00258S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: g-quadruplexes * trinucleotide repeats * in-vitro
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 9.944, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0293650