Výsledky vyhledávání
- 1.0583694 - ÚMG 2025 GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kvapilová, K. - Misenko, P. - Radvanszky, J. - Brzon, O. - Budis, J. - Gazdarica, J. - Pos, O. - Korabecna, M. - Kašný, M. - Szemes, T. - Kvapil, P. - Pačes, Jan - Kozmik, Zbyněk
Validated WGS and WES protocols proved saliva-derived gDNA as an equivalent to blood-derived gDNA for clinical and population genomic analyses.
BMC Genomics. Roč. 25, č. 1 (2024), č. článku 187. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Genomics variant analysis * Saliva-derived gDNA * Whole genome sequencing * Whole exome sequencing * Validation guideline
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-024-10080-0
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352871 - 2.0580269 - MBÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jeřábková, M. - Šmrhová, T. - Lopez-Echartea, E. - Dresler, J. - Šuman, J. - Kapinusová, G. - Cajthaml, Tomáš - Škrob, Zdena - Kyclt, R. - Fagerman, J. - Strejček, M. - Uhlík, O.
Silvimonas soli sp. nov., a new member of Chromobacteriaceae isolated from soil in Norrbyskär island, Sweden
.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Roč. 73, č. 9 (2023), č. článku 006048. ISSN 1466-5026. E-ISSN 1466-5034
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023055
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: 16S rRNA gene analysis * Chromobacteriaceae * Norrbyskär * novel species * Silvimonas * soil bacteria and whole genome sequencing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.006048
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349020 - 3.0575164 - BC 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Albanaz, A.T.S. - Carrington, M. - Frolov, A. - Ganyukova, A.I. - Gerasimov, E. S. - Kostygov, A.Y. - Lukeš, Julius - Malysheva, M. N. - Votýpka, Jan - Zakharova, A. - Záhonová, Kristýna - Zimmer, S.L. - Yurchenko, V. - Butenko, Anzhelika
Shining the spotlight on the neglected: new high-quality genome assemblies as a gateway to understanding the evolution of Trypanosomatidae.
BMC Genomics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 471. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA ČR(CZ) GA22-14356S; GA ČR(CZ) GA23-07695S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Trypanosomatids * Genome assembly * Whole-genome sequencing * Monoxenous * Dixenous * Parasite * Protist
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12864-023-09591-z
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345274 - 4.0566945 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Maritan, E. - Gallo, M. - Šrůtková, Dagmar - Jelínková, Anna - Benada, Oldřich - Kofroňová, Olga - Silva-Soares, N. F. - Hudcovic, Tomáš - Gifford, I. - Barrick, J. E. - Schwarzer, Martin - Martino, M. E.
Gut microbe Lactiplantibacillus plantarum undergoes different evolutionary trajectories between insects and mammals.
BMC BIOLOGY. Roč. 20, č. 1 (2022), č. článku 290. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-19640M
Grant ostatní: EMBO European Molecular Biology Organization(CZ) 4139 EMBO
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Drosophila melanogaster * Experimental evolution * Gut microbiota evolution * Host–microbe symbiosis * Lactiplantibacillus plantarum * Mouse * Whole genome sequencing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-022-01477-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338210 - 5.0566474 - MBÚ 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vodickova, P. - Šuman, J. - Benešová, E. - Strejček, M. - Neumann-Schaal, M. - Cajthaml, Tomáš - Rídl, Jakub - Pajer, P. - Ulbrich, P. - Uhlík, O. - Lipovová, P.
Arthrobacter polaris sp. nov., a new cold-adapted member of the family Micrococcaceae isolated from Antarctic fellfield soil.
International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. Roč. 72, č. 10 (2022), č. článku 005541. ISSN 1466-5026. E-ISSN 1466-5034
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:68378050
Klíčová slova: Antarctica * Arthrobacter * cold-adapted microorganisms * Micrococcaceae * whole-genome sequencing
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (UMG-J)
Impakt faktor: 2.8, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/ijsem/10.1099/ijsem.0.005541
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0337797 - 6.0557084 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Sedláček, I. - Holochová, P. - Busse, H. - Koublová, V. - Králová, S. - Švec, P. - Sobotka, Roman - Staňková, E. - Pilný, Jan - Šedo, O. - Smolíková, J. - Sedlář, K.
Characterisation of Waterborne Psychrophilic Massilia Isolates with Violacein Production and Description of Massilia antarctica sp. nov.
Microorganisms. Roč. 10, č. 4 (2022), č. článku 704. E-ISSN 2076-2607
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127; CzechPolar2 - 90078
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: emended description * lipid-composition * bacteria * genome * database * soil * gene * classification * degradation * restriction * Massilia * violacein * psychrophilic * description * whole-genome sequencing * Antarctica
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2076-2607/10/4/704
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331255 - 7.0555017 - ÚMG 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Lopez-Echartea, E. - Šuman, J. - Šmrhová, T. - Rídl, Jakub - Pajer, P. - Strejček, M. - Uhlík, O.
Genomic analysis of dibenzofuran-degrading Pseudomonas veronii strain Pvy reveals its biodegradative versatility.
G3-Genes, Genomes, Genetics. Roč. 11, č. 2 (2021), č. článku jkaa030. ISSN 2160-1836. E-ISSN 2160-1836
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Výzkumná infrastruktura: ELIXIR-CZ - 90047
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Pseudomonas veronii strain Pvy * biodegradation * dioxygenase * dibenzofuran * whole-genome sequencing * nanopore technology * denitrification * organic phosphate mineralization * heavy-metal tolerance
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.542, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/g3journal/article/11/2/jkaa030/6029021?login=false
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329634 - 8.0518831 - BC 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Butenko, Anzhelika - Kostygov, A.Y. - Sádlová, J. - Kleschenko, Y. - Bečvář, T. - Podešvová, L. - Macedo, D. H. - Zihala, D. - Lukeš, Julius - Bates, P.A. - Volf, P. - Opperdoes, F. R. - Yurchenko, V.
Comparative genomics of Leishmania (Mundinia).
BMC Genomics. Roč. 20, č. 1 (2019), č. článku 726. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: phosphatidylinositol 3-phosphate recognition * cutaneous leishmaniasis * insect trypanosomatids * heme-biosynthesis * lipophosphoglycan * alignment * gene * annotation * metabolism * enriettii * Whole genome sequencing * Leishmania (Mundinia) enriettii * L. (M.) macropodum * L. (M.) martiniquensis
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.594, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://bmcgenomics.biomedcentral.com/track/pdf/10.1186/s12864-019-6126-y
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0304023 - 9.0507228 - MBÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vimberg, Vladimír - Zieglerová, Leona - Závora, J. - Šemberová, L. - Prášilová, Jana - Adámková, V. - Balíková Novotná, Gabriela
Draft genome sequences of three clinical isolates of teicoplanin-resistant Staphylococcus epidermidis from patients without prior exposure to glycopeptide antibiotics.
Journal of Global Antimicrobial Resistance. Roč. 16, MAR 2019 (2019), s. 251-253. ISSN 2213-7165. E-ISSN 2213-7173
Grant CEP: GA MZd(CZ) NV15-28807A
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Staphylococcus epidermidis * Teicoplanin resistance * Whole-genome sequencing
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.706, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2213716519300451?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0298261 - 10.0376133 - ÚEM 2012 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
Brdička, Radim
Kam směřuje molekulárně-genetická analýza?
[Where is the molecular genetic analysis heading?]
Klinická biochemie a metabolismus. Roč. 19, č. 3 (2011), s. 143-148. ISSN 1210-7921
Grant CEP: GA MZd NS9804
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50390512
Klíčová slova: new generation sequencing * whole genome sequencing * analytical interpretation
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0208620