Výsledky vyhledávání
- 1.0435514 - ÚOCHB 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kohagen, Miriam - Lepšík, Martin - Jungwirth, Pavel
Calcium binding to calmodulin by molecular dynamics with effective polarization.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 5, č. 22 (2014), s. 3964-3969. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA ČR GBP208/12/G016; GA MŠMT LH12001
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: EF-hand motif * free energy calculations * charge scaling * calcium-binding protein * umbrella sampling
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 7.458, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0239676 - 2.0430619 - ÚOCHB 2015 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pluhařová, Eva - Baer, M. D. - Mundy, C. J. - Schmidt, B. - Jungwirth, Pavel
Aqueous Cation-Amide Binding: Free Energies and IR Spectral Signatures by Ab Initio Molecular Dynamics.
Journal of Physical Chemistry Letters. Roč. 5, č. 13 (2014), s. 2235-2240. ISSN 1948-7185
Grant CEP: GA MŠMT LH12001
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: sodium * calcium * N -methylacetamide * peptide bond * umbrella sampling
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 7.458, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0235575 - 3.0331241 - BFÚ 2010 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Curuksu, J. - Šponer, Jiří - Zacharias, M.
Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations.
[Flexibilita kink turn motivu 38 studovaná molekulově dynamickými simulacemi.]
Biophysical Journal. Roč. 97, č. 7 (2009), s. 2004-2013. ISSN 0006-3495. E-ISSN 1542-0086
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA400040802
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GA203/09/1476
Program: GA
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: umbrella-sampling * molecular dynamics * A-minor interaction
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.390, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0176812