Výsledky vyhledávání
- 1.0584422 - BFÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Figueiredo, J. - Mergny, Jean-Louis - Cruz, C.
G-quadruplex ligands in cancer therapy: Progress, challenges, and clinical perspectives.
Life Sciences. Roč. 340, MAR 1 2024 (2024), č. článku 122481. ISSN 0024-3205. E-ISSN 1879-0631
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * structure-based design * growth in-vitro * quindoline derivatives * cell-proliferation * pancreatic-cancer * dna structures * inhibitor
Obor OECD: Pharmacology and pharmacy
Impakt faktor: 6.1, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0024320524000705?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353658 - 2.0574511 - BFÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Stadlbauer, Petr - Mlýnský, Vojtech - Krepl, Miroslav - Šponer, Jiří
Complexity of Guanine Quadruplex Unfolding Pathways Revealed by Atomistic Pulling Simulations.
Journal of Chemical Information and Modeling. Roč. 63, č. 15 (2023), s. 4716-4731. ISSN 1549-9596. E-ISSN 1549-960X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-23718S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: TELOMERIC G-QUADRUPLEX * DNA G-QUADRUPLEXES * MOLECULAR-DYNAMICS
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jcim.3c00171
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0350040 - 3.0540713 - BFÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Jiří - Islam, B. - Stadlbauer, Petr - Haider, S.
Molecular dynamics simulations of G-quadruplexes: The basic principles and their application to folding and ligand binding.
Annual Reports in Medicinal Chemistry. Roč. 54, č. 2020 (2020), s. 197-241. ISSN 0065-7743
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * free-energy calculations * amber force-field * quantum-chemical computations * replica-exchange
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 1.059, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0065774320300154?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318331 - 4.0520332 - BFÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Palacký, Jan - Mojzes, P. - Kejnovská, Iva - Vorlíčková, Michaela
Does Raman spectroscopy recognize different G-quadruplex arrangements?
Journal of Raman Spectroscopy. -, NOV 2019 (2019). ISSN 0377-0486. E-ISSN 1097-4555
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR GA17-12075S; GA ČR(CZ) GA19-17063S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * k+ solution * dna quadruplex * structure polymorphism * circular-dichroism
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.000, rok: 2019
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/full/10.1002/jrs.5772
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305019 - 5.0518355 - BFÚ 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Stadlbauer, Petr - Kührová, P. - Vicherek, L. - Banáš, Pavel - Otyepka, Michal - Trantírek, Lukáš - Šponer, Jiří
Parallel G-triplexes and G-hairpins as potential transitory ensembles in the folding of parallel-stranded DNA G-Quadruplexes.
Nucleic Acids Research. Roč. 47, č. 14 (2019), s. 7276-7293. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-13721S; GA ČR GA17-12075S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * amber force-field * monovalent ion parameters * single-molecule fret * particle mesh ewald * nucleic-acids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.502, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article-pdf/47/14/7276/29185953/gkz610.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303512 - 6.0506685 - BFÚ 2020 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Cheng, M. - Zhou, J. - Jia, G. - Ai, X. - Mergny, Jean-Louis - Li, C.
Relations between the loop transposition of DNA G-quadruplex and the catalytic function of DNAzyme.
Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. Roč. 1861, č. 8 (2017), s. 1913-1920. ISSN 0304-4165. E-ISSN 1872-8006
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * peroxidase-mimicking dnazyme * intramolecular g-quadruplex * g-rich oligonucleotide
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.679, rok: 2017
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S030441651730168X?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0297883 - 7.0502419 - BFÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Havrila, Marek - Stadlbauer, Petr - Kührová, P. - Banáš, P. - Mergny, Jean-Louis - Otyepka, Michal - Šponer, Jiří
Structural dynamics of propeller loop: towards folding of RNA G-quadruplex.
Nucleic Acids Research. Roč. 46, č. 17 (2018), s. 8754-8771. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA16-13721S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * monovalent ion parameters * particle mesh ewald * molecular-dynamics
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.147, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0294352 - 8.0501856 - BFÚ 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Cheng, P. - Cheng, Y. - Hao, J. - Jia, G. - Zhou, J. - Mergny, Jean-Louis - Li, C.
Loop permutation affects the topology and stability of G-quadruplexes.
Nucleic Acids Research. Roč. 46, č. 18 (2018), s. 9264-9275. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * dna g-quadruplex * single-base loops * k+ solution
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.147, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0293833 - 9.0492423 - BFÚ 2019 RIV FR eng J - Článek v odborném periodiku
O'Hagan, M.P. - Mergny, Jean-Louis - Waller, Z.A.E.
G-quadruplexes in Prague: A Bohemian Rhapsody.
Biochimie. Roč. 147, APR 2018 (2018), s. 170-180. ISSN 0300-9084. E-ISSN 1638-6183
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna g-quadruplex * telomeric g-quadruplex * i-motif structures * nucleic-acids
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.362, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0285972 - 10.0486065 - BFÚ 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Cragnolini, T. - Chakraborty, D. - Šponer, Jiří - Derreumaux, P. - Pasquali, S. - Wales, D.J.
Multifunctional energy landscape for a DNA G-quadruplex: An evolved molecular switch.
Journal of Chemical Physics. Roč. 147, č. 15 (2017), č. článku 152715. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA16-13721S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * gb1 hairpin peptide
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.843, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0280952