Výsledky vyhledávání
- 1.0579099 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kutil, Z. - Mikešová, J. - Zessin, M. - Meleshin, M. - Nováková, Z. - Alquicer, Glenda - Kozikowski, A. - Sippl, W. - Bařinka, C. - Schutkowski, M.
Continuous Activity Assay for HDAC11 Enabling Reevaluation of HDAC Inhibitors.
ACS Omega. Roč. 4, č. 22 (2019), s. 19895-19904. ISSN 2470-1343. E-ISSN 2470-1343
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: histone deacetylase inhibitors * sir2 family * posttranslational modifications * fluorescent-probe * peptide arrays * in-vitro * substrate-specificity * metabolic-regulation * fluorogenic probe * activity profiles
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 2.870, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acsomega.9b02808
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347965 - 2.0578275 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kotík, Michael - Kulik, Natalia - Valentová, Kateřina
Flavonoids as Aglycones in Retaining Glycosidase-Catalyzed Reactions: Prospects for Green Chemistry.
Journal of Agricultural and Food Chemistry. Roč. 71, č. 41 (2023), s. 14890-14910. ISSN 0021-8561. E-ISSN 1520-5118
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-00091S; GA ČR(CZ) GA23-04655S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: carnation dianthus-caryophyllus * hydrolyzing beta-glucosidase * active-site mutants * isoflavone-glycosides * substrate-specificity * crystal-structure * enzymatic deglycosylation * thermotoga-neapolitana * aspergillus-oryzae * ms/ms method * Glycoside hydrolase * Hydrolysis * Transglycosylation * Glycosyl donor * Glycosynthase * Glucosidase * Rutinosidase
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.7, rok: 2023
Způsob publikování: Open access
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jafc.3c04389
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347295 - 3.0563832 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Nekvasilová, Pavlína - Kulik, Natalia - Kotík, Michael - Petrásková, Lucie - Slámová, Kristýna - Křen, Vladimír - Bojarová, Pavla
Mutation Hotspot for Changing the Substrate Specificity of beta-N-Acetylhexosaminidase: A Library of GlcNAcases.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 20 (2022), č. článku 12456. ISSN 1422-0067. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-00262S; GA MŠMT(CZ) LTC20072; GA MŠMT(CZ) LTC19035
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: beta-N-acetylhexosaminidase * Talaromyces flavus * Pichia pastoris * site-saturation mutagenesis * site-directed mutagenesis * substrate specificity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/20/12456
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0335625 - 4.0558421 - MBÚ 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Dusekova, E. - Berta, M. - Sedlakova, D. - Řeha, D. - Dzurillova, V. - Shaposhnikova, Anastasiia - Fadaei, Fatemeh - Tomková, M. - Minofar, B. - Sedlák, E.
Specific anion effect on properties of HRV 3C protease.
Biophysical Chemistry. Roč. 287, AUG 2022 (2022), č. článku 106825. ISSN 0301-4622. E-ISSN 1873-4200
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: hofmeister series * thermal-stability * enzyme-activity * conformational flexibility * initial configurations * substrate-specificity * molecular-dynamics * nadh oxidase * activation * ions * Hofmeister effect * Enzyme activation * Cysteine protease
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0301462222000679?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0332425 - 5.0532967 - MBÚ 2021 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Rucká, Lenka - Kulik, Natalia - Novotný, Petr - Sedova, Anastasia - Petrásková, Lucie - Příhodová, Romana - Křístková, Barbora - Halada, Petr - Pátek, Miroslav - Martínková, Ludmila
Plant Nitrilase Homologues in Fungi: Phylogenetic and Functional Analysis with Focus on Nitrilases in Trametes versicolor and Agaricus bisporus.
Molecules. Roč. 25, č. 17 (2020), č. článku 3861. ISSN 1420-3049. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-00184S; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Výzkumná infrastruktura: CIISB - 90043
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: protein secondary structure * biochemical-characterization * structure prediction * gene cloning * algorithm * enzymes * plant nitrilase homologues * beta-cyano-L-alanine * arylaliphatic nitriles * fumaronitrile * substrate specificity * homology modeling * Trametes versicolor * Agaricus bisporus * plant-fungus interactions
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.412, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1420-3049/25/17/3861
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0311505 - 6.0524504 - BTÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ustinova, Kseniya - Nováková, Zora - Saito, M. - Meleshin, M. - Mikesova, Jana - Kutil, Zsofia - Baranová, Petra - Havlínová, Barbora - Schutkowski, M. - Matthias, P. - Bařinka, Cyril
The disordered N-terminus of HDAC6 is a microtubule-binding domain critical for efficient tubulin deacetylation.
Journal of Biological Chemistry. Roč. 295, č. 9 (2020), s. 2614-2628. ISSN 0021-9258. E-ISSN 1083-351X
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015062; GA ČR GA15-19640S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: structure-function * protein-protein interaction * substrate specificity
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.157, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://www.jbc.org/content/295/9/2614.full#ack-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0308861 - 7.0522037 - BTÚ 2020 GB eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Dohnálek, Jan - Ostergaard, L. - Lipovová, P. - Trundová, Mária - Fejfarová, Karla - Dušková, Jarmila - Švecová, Leona - Skálová, Tereza - Stránský, Jan - Koval, Tomáš
Substrate recognition by non-specific zinc-dependent 3 '-nucleases.
Acta Crystallographica Section A-Foundation and Advances. Oxford Blackwell, Roč. 73, MS019.P06 (2017), C453-C453. ISSN 2053-2733. E-ISSN 2053-2733
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001776; GA ČR GA15-05228S
Grant ostatní: OP VVV - ELIBIO(XE) CZ.02.1.01/0.0/0.0/15_003/0000447
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: S1-P1 nuclease * nucleic acid * substrate specificity
Obor OECD: Organic chemistry
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0306555 - 8.0483415 - ÚOCHB 2018 RIV US eng M - Část monografie knihy
Stříšovský, Kvido
Mechanism and Inhibition of Rhomboid Proteases.
Enzymology at the Membrane Interface: Intramembrane Proteases. Cambridge: Academic Press, 2017 - (Gelb, M.), s. 279-293. Methods in Enzymology, 584. ISBN 978-0-12-812213-6
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LK11206; GA MŠMT LO1302
GRANT EU: European Commission(XE) 304154 - Rhomboid substrates
Grant ostatní: EMBO(DE) 2329
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: rhomboid protease * mechanism * substrate specificity * inhibitor * disease
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0278742 - 9.0477270 - BÚ 2018 RIV DE eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Fránková, Markéta - Šumberová, Kateřina - Potužák, Jan - Vild, Ondřej
The role of plant substrate type in shaping the composition and diversity of epiphytic diatom assemblages in a eutrophic reservoir.
Fundamental and Applied Limnology. Stuttgart: E. Schweizerbart'sche Verlagsbuchhandlung oHG, 2017, Roč. 189, č. 2 (2017), s. 117-135. ISSN 1863-9135. E-ISSN 1863-9135.
[10th Central European Diatom Meeting (CE-DiatoM): Relationships between diatom composition and environmental conditions. Budapest (HU), 20.04.2016-23.04.2016]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LD14045
Grant ostatní: COST(XE) ES1201
Program: FP7
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: host plant * substrate specificity * fishpond
Obor OECD: Ecology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0277874 - 10.0469951 - ÚOCHB 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Stříšovský, Kvido
Rhomboid protease inhibitors: Emerging tools and future therapeutics.
Seminars in Cell & Developmental Biology. Roč. 60, Dec (2016), s. 52-62. ISSN 1084-9521. E-ISSN 1096-3634
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LK11206; GA MŠMT LO1302
GRANT EU: European Commission(XE) 304154 - Rhomboid substrates
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: rhomboid protease * inhibitor * disease * mechanism * substrate specificity
Kód oboru RIV: CE - Biochemie
Impakt faktor: 6.614, rok: 2016
http://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1084952116302592
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0268040Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0469951.pdf 4 2.3 MB Vydavatelský postprint povolen