Výsledky vyhledávání
- 1.0559607 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Golpour, Amin Dehsari - Šmejkal, Marek - Čech, Martin - dos Santos, Romulo Acacio - Souza, Allan T. - Jůza, Tomáš - Martínez, Carlos - Bartoň, Daniel - Vašek, Mojmír - Draštík, Vladislav - Kolařík, Tomáš - Kočvara, Luboš - Říha, Milan - Peterka, Jiří - Blabolil, Petr
Similarities and differences in fish community composition accessed by electrofishing, gill netting, seining, trawling, and water eDNA metabarcoding in temperate reservoirs.
Frontiers in Ecology and Evolution. Roč. 10, Jul (2022), č. článku 913279. ISSN 2296-701X. E-ISSN 2296-701X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: biomonitoring * environmental DNA * reservoir * sampling method * species detection
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fevo.2022.913279
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340376 - 2.0552714 - BC 2022 RIV CZ cze Z - Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda/plemeno
Blabolil, Petr - Hänfling, B. - Harper, L.R. - Sellers, G. - Di Muri, C. - Griffiths, N.P. - Santos, Romulo Dos - Knežević-Jarić, Jelena - Jůza, Tomáš - Vašek, Mojmír - Čech, Martin - Muška, Milan - Fiala, Ivan - Lisnerová, Martina - Peterka, Jiří
Vzorkování volné genetické informace (eDNA) z vody.
[Sampling of free genetic information (eDNA) from water.]
Interní kód: QK1920011-V16 ; 2021
Technické parametry: Subjekt: Povodí Vltavy, státní podnik Holečkova 3178/8 Praha 5 150 00 IČO: 70889953 Datum uzavření smlouvy: V Praze dne 10. listopadu 2021
Ekonomické parametry: Vyčíslení nákladů na zpracování vzorků závisí především na vybavenosti pracoviště. Vzhledem k vysoké citlivosti metody je nezbytné vyčlenit zvláštní místnosti pro jednotlivé kroky zpracování. Jednotlivé laboratoře musí být odděleny, čímž vzniká potřeba vybavení každé z nich. Na druhou stranu jsou používané přístroje běžným vybavením a jejich jednorázová pořizovací cena je v řádu tisíců až desetitisíců korun. Nejnákladnějším zařízením je sekvenátor, který většinou vlastní pouze specializované laboratoře, častěji je sekvenace objednávána formou služby. Rovněž bioinformatické zpracování vyžaduje výkonnou výpočetní techniku, což je ale stále dostupnější položka. Cena za zpracovaný vzorek se pohybuje od stokorun do jednotek tisíců. Vysoká citlivost této technologie odhalila přítomnost i velmi vzácných druhů ve studovaných vodních útvarech. Jejím začlenění do odlovného schématu dojde ke snížení lovného úsilí u tradičních technologií a tím i poklesu celkových nákladů na ichtyologické průzkumy.
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: noninvasive monitoring * species detection * environmental DNA
Obor OECD: Ecology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329674 - 3.0552693 - BC 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Blabolil, Petr - Harper, A. - Říčanová, Š. - Sellers, G. - Di Muri, C. - Jůza, Tomáš - Vašek, Mojmír - Sajdlová, Zuzana - Rychtecký, Pavel - Znachor, Petr - Hejzlar, Josef - Peterka, Jiří - Hänfling, B.
Environmental DNA metabarcoding uncovers environmental correlates of fish communities in spatially heterogeneous freshwater habitats.
Ecological Indicators. Roč. 126, July (2021), č. článku 107698. ISSN 1470-160X. E-ISSN 1872-7034
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417; GA MZe(CZ) QK1920011
Grant ostatní: AV ČR(CZ) StrategieAV21/21; AV ČR(CZ) MSM200961901
Program: StrategieAV; Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Community ecology * eDNA * Environmental parameters * Lentic * Reservoir * Species detection
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 6.263, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.ecolind.2021.107698
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0327820