Výsledky vyhledávání
- 1.0536199 - BFÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Broft, P. - Dzatko, S. - Krafčíková, Michaela - Wacker, A. - Haensel-Hertsch, R. - Dotsch, V. - Trantírek, L. - Schwalbe, H.
In-Cell NMR Spectroscopy of Functional Riboswitch Aptamers in Eukaryotic Cells.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 60, č. 2 (2021), s. 865-872. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: g-quadruplex structures * sensing riboswitch * ligand-binding * structural basis * rna * dna * proteins
Obor OECD: Analytical chemistry
Impakt faktor: 16.823, rok: 2021
Způsob publikování: Open access s časovým embargem
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/pdfdirect/10.1002/anie.202007184
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314006 - 2.0447671 - ÚOCHB 2016 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Haldar, Susanta - Kührová, P. - Banáš, P. - Spiwok, V. - Šponer, Jiří - Hobza, Pavel - Otyepka, M.
Insights into Stability and Folding of GNRA and UNCG Tetra loops Revealed by Microsecond Molecular Dynamics and Well-Tempered Metadynamics.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 11, č. 8 (2015), s. 3866-3877. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR GAP208/12/1878; GA ČR GBP208/12/G016
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) ED2.1.00/03.0058; GA MŠk(CZ) EE2.3.20.0058; GA MŠk(CZ) EE2.3.20.0155; GA MŠk(CZ) LO1305
Program: ED
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:68081707
Klíčová slova: free energy landscape * di-GMP riboswitch * RNA hairpins
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 5.301, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0249449 - 3.0389524 - BFÚ 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Banáš, Pavel - Sklenovský, P. - Wedekind, J.E. - Šponer, Jiří - Otyepka, Michal
Molecular Mechanism of preQ(1) Riboswitch Action: A Molecular Dynamics Study.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 116, č. 42 (2012), s. 12721-12734. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GD203/09/H046; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA ČR(CZ) GAP208/12/1878; GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GBP208/12/G016
Program: GB
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: HEPATITIS-DELTA VIRUS * PARTICLE MESH EWALD * SAM-II RIBOSWITCH
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika; BO - Biofyzika (BFU-R)
Impakt faktor: 3.607, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0218381 - 4.0373421 - BFÚ 2012 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Banáš, P. - Walter, N.G. - Šponer, Jiří - Otyepka, M.
Protonation states of the key active site residues and structural dynamics of the glmS riboswitch as revealed by molecular dynamics.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 114, č. 26 (2010), s. 8701-8712. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA MŠMT(CZ) GD203/09/H046
Klíčová slova: riboswitch * ribozyme * RNA structure * molecular dynamics simulations
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.603, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006883 - 5.0347709 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Banáš, P. - Walter, N.G. - Šponer, Jiří - Otyepka, M.
Protonation states of the key active site residues and structural dynamics of the glmS riboswitch as revealed by molecular dynamics.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 114, č. 26 (2010), s. 8701-8712. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06030; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA MŠMT(CZ) GD203/09/H046; GA AV ČR(CZ) IAA400040802; GA AV ČR(CZ) 1QS500040581
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LC512
Program: LC
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: riboswitch * ribozyme * RNA structure * molecular dynamics simulations
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 3.603, rok: 2010
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0006029