Výsledky vyhledávání
- 1.0583171 - ÚJF 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Jakubský, Vít - Zelaya, Kevin
Reflectionless pseudospin-1 Dirac systems via Darboux transformation and flat band solutions.
Physica Scripta. Roč. 99, č. 3 (2024), č. článku 035220. ISSN 0031-8949. E-ISSN 1402-4896
Grant CEP: GA MŠMT EF18_053/0017163
Institucionální podpora: RVO:61389005
Klíčová slova: lieb lattice * pseudospin-1 systems * flat band * Darboux transformations * SUSY QM * Reflectionless Dirac systems
Obor OECD: Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)
Impakt faktor: 2.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1088/1402-4896/ad224a
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351167 - 2.0579787 - MBÚ 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Cupellini, L. - Qian, P. - Nguyen-Phan, T. C. - Gardiner, Alastair T. - Cogdell, R. J.
Quantum chemical elucidation of a sevenfold symmetric bacterial antenna complex.
Photosynthesis Research. Roč. 156, June 8 (2022), s. 75-87. ISSN 0166-8595. E-ISSN 1573-5079
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: light-harvesting complex * bacteriochlorophyll energy-transfer * lh2 complexes * rhodopseudomonas-acidophila * optical-spectra * purple bacteria * spectroscopy * excitation * state * qm/mm * Light-harvesting * Pigment-protein complex * Quantum chemistry * Molecular dynamics * qm * mm * Excitons
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://link.springer.com/article/10.1007/s11120-022-00925-8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0348582 - 3.0570899 - FZÚ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Movahedi, E. - Razmazma, H. - Rezvani, A.R. - Nowroozi, A. - Ebrahimi, A. - Eigner, Václav - Dušek, Michal - Arjmand, F.
A novel Cu(II)-based DNA-intercalating agent: Structural and biological insights using biophysical and in silico techniques.
Spectrochimica Acta Part A-Molecular and Biomolecular Spectroscopy. Roč. 293, May (2023), č. článku 122438. ISSN 1386-1425. E-ISSN 1873-3557
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-10504S; GA MŠMT LM2018110
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: Copper(II) complex * DNA binding profile * cytotoxicity * DFT * QM/MM * molecular docking simulations
Obor OECD: Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.)
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.saa.2023.122438
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342230 - 4.0564414 - FZÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lowe, B. - Hellerstedt, J. - Matěj, Adam - Mutombo, Pingo - Kumar, D. - Ondráček, Martin - Jelínek, Pavel - Schiffrin, A.
Selective activation of aromatic C−H bonds catalyzed by single gold atoms at room temperature.
Journal of the American Chemical Society. Roč. 144, č. 46 (2022), s. 21389-21397. ISSN 0002-7863. E-ISSN 1520-5126
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-13692X
Grant ostatní: AV ČR(CZ) AP1601
Program: Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: nc-AFM * on surface chemistry * QM/MM * DFT
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 15, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/jacs.2c10154
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336086 - 5.0560515 - MBÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Galvez-Rodriguez, A. - Ferino-Perez, A. - Rodriguez-Riera, Z. - Guerra, I.R. - Řeha, David - Minofar, Babak - Jauregui-Haza, U. J.
Explaining the interaction of mangiferin with MMP-9 and NF- k beta: a computational study.
Journal of Molecular Modeling. Roč. 28, č. 9 (2022), č. článku 266. ISSN 1610-2940. E-ISSN 0948-5023
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Anti-cancer activity * Mangiferin * Natural bond analysis * Molecular docking * qm * mm
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 2.2, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://link.springer.com/article/10.1007/s00894-022-05260-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0333473 - 6.0558665 - MBÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Surpeta, B. - Grulich, Michal - Palyzová, Andrea - Marešová, Helena - Brezovský, J.
Common Dynamic Determinants Govern Quorum Quenching Activity in N-Terminal Serine Hydrolases.
ACS Catalysis. Roč. 12, č. 11 (2022), s. 6359-6374. ISSN 2155-5435. E-ISSN 2155-5435
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: penicillin-g acylase * homoserine-lactone-acylase * antibiotic-resistance * molecular-dynamics * substrate-binding * qm/mm calculations * specificity * health * site * perspectives * quorum quenching * N-terminal serine hydrolase * acyl-homoserine lactone acylase * penicillin G acylase * qm * mm * molecular dynamics * reaction mechanism
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 12.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acscatal.2c00569
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0332427 - 7.0555998 - MBÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Kiss, M. - Timari, I. - Barna, T. - Mészáros, Zuzana - Slámová, Kristýna - Bojarová, Pavla - Křen, Vladimír - Hayes, J. - Somsák, L.
2-Acetamido-2-deoxy-d-glucono-1,5-lactone Sulfonylhydrazones: Synthesis and Evaluation as Inhibitors of Human OGA and HexB Enzymes.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 3 (2022), č. článku 1037. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-01948L; EC(CZ) CA18132
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: molecular-orbital methods * o-glcnac * glycosylidene carbenes * force-field * protein * substrate * link * hOGA * hHexB * inhibitor * glyconolactone sulfonylhydrazone * Prime refinement * qm * MM optimization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/3/1037
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330366 - 8.0553612 - ÚJF 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hussin, V. - Marquette, I. - Zelaya, Kevin
Third-order ladder operators, generalized Okamoto and exceptional orthogonal polynomials.
Journal of Physics A-Mathematical and Theoretical. Roč. 55, č. 4 (2022), č. článku 045205. ISSN 1751-8113. E-ISSN 1751-8121
Grant CEP: GA MŠMT EF18_053/0017163
Institucionální podpora: RVO:61389005
Klíčová slova: higher-order shape invariance * fourth Painleve transcendent * orthogonal polynomials * SUSY QM * generalized Okamoto polynomials * exactly solvable quantum models
Obor OECD: Pure mathematics
Impakt faktor: 2.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1088/1751-8121/ac43cc
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328368 - 9.0541887 - BFÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Zhang, Z. - Vogele, J. - Mráziková, Klaudia - Kruse, Holger - Cang, X. - Woehnert, J. - Krepl, Miroslav - Šponer, Jiří
Phosphorothioate Substitutions in RNA Structure Studied by Molecular Dynamics Simulations, QM/MM Calculations, and NMR Experiments.
Journal of Physical Chemistry B. Roč. 125, č. 3 (2021), s. 825-840. ISSN 1520-6106. E-ISSN 1520-5207
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-16554S; GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: RNA Structure * Molecular Dynamics Simulations * QM/MM Calculations * NMR Experiments
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.466, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jpcb.0c10192
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319383 - 10.0541319 - ÚOCHB 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vavřina, Zdeněk - Gutten, Ondrej - Smola, Miroslav - Zavřel, Martin - Tehrani, Zahra Aliakbar - Charvát, Vilém - Kožíšek, Milan - Bouřa, Evžen - Birkuš, Gabriel - Rulíšek, Lubomír
Protein-Ligand Interactions in the STING Binding Site Probed by Rationally Designed Single-Point Mutations: Experiment and Theory.
Biochemistry. Roč. 60, č. 8 (2021), s. 607-620. ISSN 0006-2960
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA20-08772S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000729
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: ligand-binding * STING protein * structural biology * QM/MM calculations
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.321, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.biochem.0c00949
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318895