Výsledky vyhledávání
- 1.0564237 - MBÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Luis Pacheco-Garcia, J. - Loginov, Dmitry Sergej - Naganathan, A. N. - Vaňková, Pavla - Cano-Munoz, M. - Man, Petr - Pey, Angel L.
Loss of stability and unfolding cooperativity in hPGK1 upon gradual structural perturbation of its N-terminal domain hydrophobic core.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 17200. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
GRANT EU: European Commission(XE) 731077 - EU_FT-ICR_MS
Výzkumná infrastruktura: CIISB II - 90127
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:86652036
Klíčová slova: muscle 3-phosphoglycerate kinase * phosphoglycerate kinase * phosphoglycerate kinase * protein stability * kinetic stability * molecular-basis * denaturation * conformation * flexibility * modulation * ensembles
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41598-022-22088-1
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0335944 - 2.0547429 - MBÚ 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Shaposhnikova, Anastasiia - Kutý, M. - Chaloupková, R. - Damborský, J. - Smatanová, I.K. - Minofar, Babak - Prudnikova, T.
Stabilization of Haloalkane Dehalogenase Structure by Interfacial Interaction with Ionic Liquids.
Crystals. Roč. 11, č. 9 (2021), č. článku 1052. ISSN 2073-4352. E-ISSN 2073-4352
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015047
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140; RECETOX RI - 90121
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: haloalkane dehalogenase (HLD) * ionic liquids (ILs) * molecular dynamics (MD) simulations * protein stability * 2-hydroxyethylammonium acetate ([ETA][ACC]) * 1-butyl-3-methylimidazolium methyl sulfate ([EMIM][CHS])
Obor OECD: Biophysics
Impakt faktor: 2.670, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/2073-4352/11/9/1052
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0323664 - 3.0487130 - BTÚ 2018 RIV eng U - Uspořádání akce
Charnavets, Tatsiana
Prometheus nanoDSF and MicroScale Thermophoresis user training.
[Vestec, 19.10.2017-19.10.2017, (W-CST 17/0)]
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: proteins * thermophoresis * protein stability
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0281793 - 4.0456295 - BFÚ 2016 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Vargová, Veronika - Gimenez, R.E. - Černocká, Hana - Trujillo, D.C. - Tulli, F. - Zanini, V.I.P. - Paleček, Emil - Borsarelli, C.D. - Ostatná, Veronika … celkem 10 autorů
Label-free electrochemical detection of singlet oxygen protein damage.
Electrochimica acta. Roč. 187, JAN 2016 (2016), s. 662-669. ISSN 0013-4686. E-ISSN 1873-3859
Grant CEP: GA ČR GA13-00956S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: singlet oxygen protein damage * surface-attached protein stability * mercury and carbon electrodes
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.798, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0256852 - 5.0447601 - BFÚ 2016 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Černocká, Hana - Ostatná, Veronika - Paleček, Emil
Protein structural transition at negatively charged electrode surfaces. Effects of temperature and current density.
Electrochimica acta. Roč. 174, AUG 2015 (2015), s. 356-360. ISSN 0013-4686. E-ISSN 1873-3859
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP301/11/2055; GA ČR(CZ) GA15-15479S; GA ČR(CZ) GA13-00956S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: Bovine serum albumin * sensing of surface-attached protein stability * protein structural transition at Hg
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 4.803, rok: 2015
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0249408 - 6.0425304 - ÚVGZ 2014 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Koudeláková, T. - Chaloupková, R. - Březovský, J. - Prokop, Z. - Šebestová, E. - Hesseler, M. - Khabiri, Morteza - Plevaka, M. - Kulik, D. - Kutá-Smatanová, Ivana - Řezáčová, Pavlína - Ettrich, Rüdiger - Bornscheuer, U.T. - Damborský, J.
Engineering Enzyme Stability and Resistance to an Organic Cosolvent by Modification of Residues in the Access Tunnel.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 52, č. 7 (2013), s. 1959-1963. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LC06010
Institucionální podpora: RVO:67179843 ; RVO:68378050
Klíčová slova: directed evolution * enzyme catalysis * enzymes * protein engineering * protein stability
Kód oboru RIV: CE - Biochemie; EB - Genetika a molekulární biologie (UMG-J)
Impakt faktor: 11.336, rok: 2013
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0231180Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0425304.pdf 3 1.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 7.0395189 - ÚOCHB 2014 CZ eng A - Abstrakt
Fačkovec, Boris - Vondrášek, Jiří
Balance of interactions contributing to stability of globular proteins.
Prague Protein Spring Meeting 2012. Praha: Ústav organické chemie a biochemie AV ČR, v. v. i, 2012. s. 56-56. ISBN 978-80-86241-47-0.
[Prague Protein Spring Meeting 2012. 03.05.2012-06.05.2012, Praha]
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: globular proteins * interaction energy * protein stability
Kód oboru RIV: CC - Organická chemie
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0223287 - 8.0389578 - ÚOCHB 2013 RIV HR eng M - Část monografie knihy
Fačkovec, Boris - Vondrášek, Jiří
Decomposition of Intramolecular Interactions Between Amino-Acids in Globular Proteins - A Consequence for Structural Classes of Proteins and Methods of Their Classification.
Systems and Computational Biology - Molecular and Cellular Experimental Systems. Rijeka: InTech, 2011 - (Yang, N.), s. 69-82. ISBN 978-953-307-280-7
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: proteins * amino acids * structural classes * protein architecture * protein stability
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
http://www.intechopen.com/books/systems-and-computational-biology-molecular-and-cellular-experimental-systems/decomposition-of-intramolecular-interactions-between-amino-acids-in-globular-proteins-a-consequence-
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0218506 - 9.0327972 - ÚOCHB 2010 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Berka, Karel - Hobza, Pavel - Vondrášek, Jiří
Analysis of Energy Stabilization inside the Hydrophobic Core of Rubredoxin.
ChemPhysChem. Roč. 10, č. 3 (2009), s. 543-548. ISSN 1439-4235. E-ISSN 1439-7641
Grant CEP: GA ČR GA203/05/0009; GA ČR GA203/06/1727; GA ČR(CZ) GD203/05/H001; GA AV ČR IAA400550510; GA MŠMT LC512
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: hydrophobic core * protein stability * SAPT method
Kód oboru RIV: CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
Impakt faktor: 3.453, rok: 2009
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0174393