Výsledky vyhledávání
- 1.0576127 - ÚOCHB 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Biriukov, Denys - Javanainen, Matti
Efficient Simulations of Solvent Asymmetry Across Lipid Membranes Using Flat-Bottom Restraints.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 19, č. 18 (2023), s. 6332-6341. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: linear constraint solver * particle mesh Ewald * molecular dynamics
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.3c00614
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345727Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1021acs.jctc.3c00614.pdf 0 4.7 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0561693 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Nguyen, Man Thi Hong - Biriukov, Denys - Tempra, Carmelo - Baxová, Katarína - Martinez-Seara, Hector - Evci, Huseyin - Singh, Vandana - Šachl, Radek - Hof, Martin - Jungwirth, Pavel - Javanainen, Matti - Vazdar, Mario
Ionic Strength and Solution Composition Dictate the Adsorption of Cell-Penetrating Peptides onto Phosphatidylcholine Membranes.
Langmuir. Roč. 38, č. 37 (2022), s. 11284-11295. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-26854X
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: linear constraint solver * particle mesh Ewald * molecular dynamics
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 3.9, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.langmuir.2c01435
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334213Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0561693.pdf 3 14.4 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 3.0557550 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kontkanen, O. V. - Biriukov, Denys - Futera, Z.
Reorganization free energy of copper proteins in solution, in vacuum, and on metal surfaces.
Journal of Chemical Physics. Roč. 156, č. 17 (2022), č. článku 175101. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: Pseudomonas aeruginosa azurin * biological electron transfer * linear constraint solver
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1063/5.0085141
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331515 - 4.0556419 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Tempra, Carmelo - Ollila, O. H. S. - Javanainen, Matti
Accurate Simulations of Lipid Monolayers Require a Water Model with Correct Surface Tension.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 18, č. 3 (2022), s. 1862-1869. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: molecular dynamics simulations * linear constraint solver * polarizable force field
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1021/acs.jctc.1c00951
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330640 - 5.0537051 - ÚOCHB 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Javanainen, Matti - Hua, W. - Ticháček, Ondřej - Delcroix, Pauline - Cwiklik, Lukasz - Allen, H. C.
Structural Effects of Cation Binding to DPPC Monolayers.
Langmuir. Roč. 36, č. 50 (2020), s. 15258-15269. ISSN 0743-7463
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-26854X; GA ČR(CZ) GA17-06792S
Institucionální podpora: RVO:61388963 ; RVO:61388955
Klíčová slova: interfacial water organization * linear constraint solver * chloride ion
Obor OECD: Physical chemistry; Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 3.882, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1021/acs.langmuir.0c02555
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0314802Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0537051.pdf 0 5.3 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 6.0441534 - ÚI 2015 RIV CH eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Chotard, A. - Holeňa, Martin
A Generalized Markov-Chain Modelling Approach to (1,lambda)-ES Linear Optimization.
Parallel Problem Solving from Nature - PPSN XIII. Cham: Springer, 2014 - (Bartz-Beielstein, T.; Branke, J.; Filipič, B.; Smith, J.), s. 902-911. Lecture Notes in Computer Science, 8672. ISBN 978-3-319-10761-5. ISSN 0302-9743.
[PPSN 2014. International Conference on Parallel Problem Solving from Nature /13./. Ljubljana (SI), 13.09.2014-17.09.2014]
Grant CEP: GA ČR GA13-17187S
Institucionální podpora: RVO:67985807
Klíčová slova: evolution strategies * continuous optimization * linear optimization * linear constraint * linear function * Markov chain models * Archimedean copulas
Kód oboru RIV: IN - Informatika
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0244526Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup a0441534.pdf 1 267.5 KB Vydavatelský postprint vyžádat