Výsledky vyhledávání
- 1.0576660 - ÚMG 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Miklík, Dalibor - Grim, Jiří - Elleder, Daniel - Hejnar, Jiří
Unraveling the palindromic and nonpalindromic motifs of retroviral integration site sequences by statistical mixture models.
Genome Research. Roč. 33, č. 8 (2023), s. 1395-1408. ISSN 1088-9051. E-ISSN 1549-5469
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LX22NPO5103; GA ČR(CZ) GA19-23407S
Institucionální podpora: RVO:67985556 ; RVO:68378050
Klíčová slova: IMMUNODEFICIENCY-VIRUS TYPE-1 * HIV-1 INTEGRATION * HUMAN GENOME
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology; Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8) (UTIA-B)
Impakt faktor: 7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://genome.cshlp.org/content/33/8/1395
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346204Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup genome-miklík-23.pdf 0 7.2 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0544978 - ÚMG 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Wu, W. - Hill, S.E. - Nathan, W.J. - Paiano, J. - Callen, E. - Wang, D. - Shinoda, K. - van Wietmarschen, N. - Colon-Mercado, J.M. - Zong, D. - De Pace, R. - Shih, H.Y. - Coon, S. - Parsadanian, M. - Pavani, R. - Hanzlíková, Hana - Park, S. - Jung, S.K. - McHugh, P.J. - Canela, A. - Chen, C. - Casellas, R. - Caldecott, Keith - Ward, M.E. - Nussenzweig, A.
Neuronal enhancers are hotspots for DNA single-strand break repair.
Nature. Roč. 593, č. 7859 (2021), s. 440-444. ISSN 0028-0836. E-ISSN 1476-4687
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: pluripotent stem-cells * human genome * chromatin * binding * wide * gene * 5-hydroxymethylcytosine * differentiation * identification * annotation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 69.504, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.nature.com/articles/s41586-021-03468-5
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321766 - 3.0520645 - ÚMG 2020 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Šenigl, Filip - Maman, Y. - Dinesh, R. K. - Alinikula, J. - Seth, R. B. - Pecnová, Lubomíra - Omer, A. D. - Rao, S. S. P. - Weisz, D. - Buerstedde, J.-M. - Aiden, E. L. - Casellas, R. - Hejnar, Jiří - Schatz, D. G.
Topologically Associated Domains Delineate Susceptibility to Somatic Hypermutation.
Cell Reports. Roč. 29, č. 12 (2019), s. 3902-3915. ISSN 2211-1247. E-ISSN 2211-1247
Grant CEP: GA ČR GA15-24776S
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: center b-cells * super-enhancers * targets aid * molecular-mechanisms * human genome * dna * gene * translocations * transcription * integration
Obor OECD: Immunology
Impakt faktor: 8.109, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://www.cell.com/cell-reports/fulltext/S2211-1247(19)31521-9?_returnURL=https%3A%2F%2Flinkinghub.elsevier.com%2Fretrieve%2Fpii%2FS2211124719315219%3Fshowall%3Dtrue
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0305794Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Cell_Reports_F_Senigl_2019.pdf 1 4.6 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 4.0502516 - BFÚ 2019 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Das, R.N. - Chevret, E. - Desplat, V. - Rubio, S. - Mergny, Jean-Louis - Guillon, J.
Design, Synthesis and Biological Evaluation of New Substituted Diquinolinyl-Pyridine Ligands as Anticancer Agents by Targeting G-Quadruplex.
Molecules. Roč. 23, č. 1 (2018), č. článku 81. E-ISSN 1420-3049
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: promoter g-quadruplex * c-kit promoter * fluorescent-ligand * human genome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.060, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0294440 - 5.0498706 - BC 2019 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Husník, Filip - McCutcheon, J.P.
Functional horizontal gene transfer from bacteria to eukaryotes.
Nature Reviews. Microbiology. Roč. 16, č. 2 (2018), s. 67-79. ISSN 1740-1526. E-ISSN 1740-1534
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: NESTED MEALYBUG SYMBIOSIS * SAP-FEEDING INSECTS * HUMAN GENOME * MITOCHONDRIAL PROTEOME * PHYLOGENETIC ANALYSES * DROSOPHILA-ANANASSAE * HETERODERA-GLYCINES * BDELLOID ROTIFERS * PLASTID PROTEOME
Obor OECD: Developmental biology
Impakt faktor: 34.648, rok: 2018
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0290988 - 6.0497061 - ÚMG 2020 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Krchňáková, Eva - Thakur, Prasoon-Kumar - Krausová, Michaela - Bieberstein, Nicole - Haberman, N. - Muller-McNicoll, M. - Staněk, David
Splicing of long non-coding RNAs primarily depends on polypyrimidine tract and 5' splice-site sequences due to weak interactions with SR proteins.
Nucleic Acids Research. Roč. 47, č. 2 (2019), s. 911-928. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034; GA MŠMT LO1419; GA AV ČR L200521652
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Pre-messenger-rna * Alternative exon * Gene-expression * Human genome * Transcriptome
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.502, rok: 2019
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nar/article/47/2/911/5184724
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0289661Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Nucleic_Acids_Research_Z_Krchnakova_2019.pdf 4 2.4 MB Autorský preprint vyžádat - 7.0495802 - BFÚ 2019 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Lexa, M. - Šteflová, Pavlína - Martínek, T. - Vorlíčková, Michaela - Vyskot, Boris - Kejnovský, Eduard
Guanine quadruplexes are formed by specific regions of human transposable elements.
BMC Genomics. Roč. 15, NOV 27 2014 (2014), č. článku 1032. ISSN 1471-2164. E-ISSN 1471-2164
Grant CEP: GA ČR(CZ) GAP305/10/0930; GA ČR(CZ) GAP501/10/0102; GA ČR GPP501/10/P483; GA ČR GAP205/12/0466
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: dna secondary structures * human genome * somatic retrotransposition
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 3.986, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0288707 - 8.0487081 - ÚMG 2018 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šenigl, Filip - Miklík, Dalibor - Auxt, Miroslav - Hejnar, Jiří
Accumulation of long-term transcriptionally active integrated retroviral vectors in active promoters and enhancers.
Nucleic Acids Research. Roč. 45, č. 22 (2017), s. 12752-12765. ISSN 0305-1048. E-ISSN 1362-4962
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA14-34873S; GA MŠMT LO1419
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: human-immunodeficiency-virus * dna methylation * site selection * human genome * avian-sarcoma * morphological reversion * hiv-1 integration * mlv integration * gene-expression * leukosis virus
Obor OECD: Virology
Impakt faktor: 11.561, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0281763Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Nucleic_Acids_Research_F_Senigl_2017.pdf 2 1.2 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 9.0478866 - ÚEB 2018 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Ivaničová, Zuzana - Valárik, Miroslav - Pánková, K. - Trávníčková, M. - Doležel, Jaroslav - Šafář, Jan - Milec, Zbyněk
Heritable heading time variation in wheat lines with the same number of Ppd-B1 gene copies.
PLoS ONE. Roč. 12, č. 8 (2017), č. článku e0183745. ISSN 1932-6203. E-ISSN 1932-6203
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1204; GA ČR GBP501/12/G090
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: triticum-aestivum l. * dna methylation * copy number * flowering time * human genome * se gene * vernalization * earliness * barley * region
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 2.766, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0274908Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2017_Ivanicova_PLOS ONE_e0183745.pdf 0 2.2 MB Jiná povolen - 10.0473083 - ÚMG 2017 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Bieberstein, Nicole - Kozáková, Eva - Huranová, Martina - Thakur, P.K. - Krchňáková, Zuzana - Krausová, Michaela - Oesterreich, F.C. - Staněk, David
TALE-directed local modulation of H3K9 methylation shapes exon recognition.
Scientific Reports. Roč. 6, jaro (2016), č. článku 29961. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: histone h3 * human genome * efficient design * chromatin * methyltransferase * transcription * trimethylation * identification * recruitment * annotation
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.259, rok: 2016
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0270253Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Scientific_Reports_N_Bieberstein_2016.pdf 1 791.5 KB Vydavatelský postprint vyžádat