Výsledky vyhledávání
- 1.0544265 - ÚGN 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Bradák, B. - Csonka, D. - Novothny, A. - Szeberényi, J. - Medveďová, A. - Roštínský, Pavel - Fehér, K. - Barta, G. - Végh, T. - Kiss, K. - Megyeri, M.
Late Pleistocene paleosol formation in a dynamic aggradational microenvironment - A case study from the Malá nad Hronom loess succession (Slovakia).
Catena. Roč. 199, April 2021 (2021), č. článku 105087. ISSN 0341-8162. E-ISSN 1872-6887
Institucionální podpora: RVO:68145535
Klíčová slova: sedimentation * pedogenesis * paleogeomorphology * multiproxy * heatmap * principal component analysis
Obor OECD: Physical geography
Impakt faktor: 6.367, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0341816220306378?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0321299Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup UGN_0544265.pdf 0 8.2 MB Vydavatelský postprint povolen - 2.0523463 - ÚMG 2020 RIV CZ cze Z - Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda/plemeno
Kolář, Michal
Protokol o ověření technologie zpracování sekvenačních dat za účelem vizualizace - Extended Cross-Population heatmap.
[Protocol on verification of sequencing data processing technology for visualization - Extended Cross-Population heatmap.]
Interní kód: TG01010066-V3-6 ; 2019
Technické parametry: EXPheatmap je softwarová knihovna programovacího jazyka Python 3, která umožňuje zpracovat (nejenom) genomická populační data poskytnutá ve standardní formě tak, aby došlo k vizualizaci výsledků komplexních mezipopulačních vztahů. Hlavní důraz je zde kladen na přehlednou prezentaci dat, která jsou typicky vysoce mnohorozměrná. Knihovna zahrnuje i funkce použitelné na předzpracování dat a statistické posouzení dat (výpočet a transformace p hodnot). Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu sekvenačních dat.
Ekonomické parametry: Výsledek je využíván zejména řešitelem dotace na jehož pracovišti dosahují díky využití výsledku reálné úspory zhruba 10.000,- Kč až 100.000,- Kč ročně podle intenzity práce s výsledkem v konkrétní laboratoři řešitele.
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TG01010066
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Cross-Population * heatmap * visualization
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307818 - 3.0503200 - ÚMG 2019 RIV CZ cze L4 - Software
Ehler, Edvard - Pačes, Jan
EXPheatmap softwarový nástroj.
[Extended Cross-Population heatmap EXPheatmap.]
Interní kód: 2019EXP ; 2019
Technické parametry: EXPheatmap je kombinace nových algoritmů a připravených postupů, která je vytvořena za účelem zpracování sekvenačních dat prostřednictvím analytické platformy. Je připraven jako knihovna v jazyce Python (v. 3.6). S použitím této knihovny je možné zpracovávat data poskytnutá ve standardní formě tak, aby došlo k vizualizaci výsledků komplexních sekvenačních procesů, které z dat ve standardní formě dosud vizualizovatelné nejsou. Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu sekvenačních dat. Licence bude poskytována formou GNU General Public License. kontakt: edvard.ehler@img.cas.cz.
Ekonomické parametry: Použitím těchto nástrojů je možné zpracovávat data poskytnutá ve standardní formě tak, aby došlo k vizualizaci výsledků komplexních mezipopulačních charakteristik, které z dat ve standardní formě dosud vizualizovatelné nejsou. Tyto funkcionality výrazně zjednodušší uživatelům analýzu sekvenačních dat, populačních genetických dat, a jakýchkoliv dalších souborů vzorků, které obsahují definované podskupiny a vztahy mezi těmito podskupinami (např. vzdálenosti).
Grant CEP: GA TA ČR(CZ) TG01010066
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: visualization * cross-population parameters * heatmap * genomics
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
http://genomat.img.cas.cz/
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0295024 - 4.0441263 - ÚMG 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Škuta, Ctibor - Bartůněk, Petr - Svozil, Daniel
InCHlib - interactive cluster heatmap for web applications.
Journal of Cheminformatics. Roč. 6, č. 44 (2014). ISSN 1758-2946. E-ISSN 1758-2946
Grant CEP: GA MŠMT LO1220
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Data clustering * Cluster heatmap * Scientific visualization * Web integration * Client-side scripting * JavaScript library * Big data * Exploration
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 4.547, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0244328Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0441263.pdf 12 1.5 MB Vydavatelský postprint vyžádat