Výsledky vyhledávání
- 1.0571825 - ÚFCH JH 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Iorio, A. - Timr, Štěpán - Chiodo, L. - Derreumaux, P. - Sterpone, F.
Evolution of large Aβ16–22 aggregates at atomic details and potential of mean force associated to peptide unbinding and fragmentation events.
Proteins-Structure, Function and Bioinformatics. Roč. 91, č. 8 (2023), s. 1152-1162. ISSN 0887-3585. E-ISSN 1097-0134
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: amyloid * free energy * molecular dynamics * proto-fibrils
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.9, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342729Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0571825.pdf 0 3.4 MB Vydavatelský postprint vyžádat - 2.0567234 - ÚOCHB 2024 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Barman, D. - Lo, Rabindranath - Maiti, D. K. - Manna, D. - Ghosh, T.
Mechanistic Exploration of Umpolung Guided Stetter-Aldol Reaction and Its Dependence on the Choice of Imine.
ChemistrySelect. Roč. 8, č. 1 (2023), č. článku e202204558. ISSN 2365-6549. E-ISSN 2365-6549
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: umpolung * Breslow intermediate * free energy profile * density functional theory * isoquinoline
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 2.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1002/slct.202204558
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338512 - 3.0564990 - ÚFCH JH 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Patel, C. N. - Jani, S. P. - Prasanth Kumar, S. - Modi, Krunal M. - Kumar, Y.
Computational investigation of natural compounds as potential main protease (Msuppro/sup) inhibitors for SARS-CoV-2 virus.
Computers in Biology Medicine. Roč. 151, DEC 2022 (2022), č. článku 106318. ISSN 0010-4825. E-ISSN 1879-0534
Institucionální podpora: RVO:61388955
Klíčová slova: Binding free energy * DFT calculation * Dynamics simulation * Main proteases (M ) pro * Omicron
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336561Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0564990.pdf 0 3.2 MB open access Vydavatelský postprint povolen - 4.0561720 - ÚT 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Varillas, Javier - Rondoni, L.
Work and Thermal Fluctuations in Crystal Indentation under Deterministic and Stochastic Thermostats: The Role of System-Bath Coupling.
Entropy. Roč. 24, č. 9 (2022), č. článku 1309. E-ISSN 1099-4300
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF15_003/0000493
Institucionální podpora: RVO:61388998
Klíčová slova: ensembles * stochastic thermodynamics * work * free energy * mesoscopic systems * absolute irreversibility * non-equilibrium
Obor OECD: Particles and field physics
Impakt faktor: 2.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://mdpi-res.com/d_attachment/entropy/entropy-24-01309/article_deploy/entropy-24-01309-v4.pdf?version=1663750176
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334775 - 5.0557831 - ÚOCHB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Biriukov, Denys - Wang, H.-W. - Rampal, N. - Tempra, Carmelo - Kula, Patrik - Neuefeind, J. C. - Stack, A. G. - Předota, M.
The “good,“ the “bad,“ and the “hidden“ in neutron scattering and molecular dynamics of ionic aqueous solutions.
Journal of Chemical Physics. Roč. 156, č. 19 (2022), č. článku 194505. ISSN 0021-9606. E-ISSN 1089-7690
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: solvation structure * free energy * simulations
Obor OECD: Physical chemistry
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1063/5.0093643
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0331710 - 6.0557417 - BFÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Mlýnský, Vojtech - Janecek, M. - Kührová, Petra - Frohlking, T. - Otyepka, M. - Bussi, G. - Banáš, Pavel - Šponer, Jiří
Toward Convergence in Folding Simulations of RNA Tetraloops : Comparison of Enhanced Sampling Techniques and Effects of Force Field Modifications br.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 18, č. 4 (2022), s. 2642-2656. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477; GA ČR(CZ) GA20-16554S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: free-energy landscape * molecular-dynamics * replica-exchange * tertiary interactions * parameters * hairpins
Obor OECD: Organic chemistry
Impakt faktor: 5.5, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jctc.1c01222
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0339585 - 7.0555692 - ÚFP 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Kozlík, J. - Preisler, D. - Stráský, J. - Veselý, J. - Veverková, A. - Chráska, Tomáš - Janeček, M.
Phase transformations in a heterogeneous Ti-xNb-7Zr-0.8O alloy prepared by a field-assisted sintering technique.
Materials and Design. Roč. 198, January (2021), č. článku 109308. ISSN 0264-1275. E-ISSN 1873-4197
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-11275S
Institucionální podpora: RVO:61389021
Klíčová slova: Field assisted sintering technique (FAST) * Gibbs free energy * Heterogeneity * Phase transitions * Titanium alloys
Obor OECD: Materials engineering
Impakt faktor: 9.417, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0264127520308443?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0330156 - 8.0554012 - MÚ 2022 RIV DE eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Kalousek, Martin - Mitra, S. - Schlömerkemper, A.
Existence of weak solutions to a diffuse interface model involving magnetic fluids.
Proceedings in Applied Mathematics and Mechanics. Volume 21, Issue 1. Weinheim: Wiley, 2021 - (Kaliske, M.), č. článku e202100205. E-ISSN 1617-7061.
[92nd Annual Meeting of the International Association of Applied Mathematics and Mechanics (GAMM). Kassel (DE), 15.03.2021-19.03.2021]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-04243S
Institucionální podpora: RVO:67985840
Klíčová slova: magnetic fluid * free energy density
Obor OECD: Pure mathematics
https://doi.org/10.1002/pamm.202100205
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328658Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup Kalousek2.pdf 2 199.5 KB Vydavatelský postprint povolen - 9.0552265 - FZÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Rychetský, Ivan - Schranz, W. - Tröster, A.
Symmetry and polarity of antiphase boundaries in PbZrO3.
Physical Review B. Roč. 104, č. 22 (2021), č. článku 224107. ISSN 2469-9950. E-ISSN 2469-9969
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000760
Grant ostatní: OP VVV - SOLID21(XE) CZ.02.1.01/0.0/0.0/16_019/0000760
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: antiphase boundaries * polarity * Landau-Ginzburg free energy * layer groups
Obor OECD: Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.)
Impakt faktor: 3.908, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1103/PhysRevB.104.224107
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0327403 - 10.0540713 - BFÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Šponer, Jiří - Islam, B. - Stadlbauer, Petr - Haider, S.
Molecular dynamics simulations of G-quadruplexes: The basic principles and their application to folding and ligand binding.
Annual Reports in Medicinal Chemistry. Roč. 54, č. 2020 (2020), s. 197-241. ISSN 0065-7743
Grant CEP: GA MŠMT EF15_003/0000477
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: telomeric g-quadruplex * free-energy calculations * amber force-field * quantum-chemical computations * replica-exchange
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 1.059, rok: 2020
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0065774320300154?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318331