Výsledky vyhledávání
- 1.0582786 - ÚMG 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pallavi, R. - Gatti, E. - Durfort, T. - Stendardo, M. - Ravasio, R. - Leonardi, T. - Falvo, P. - Duso, B. A. - Punzi, S. - Xieraili, A. - Polazzi, A. - Verrelli, D. - Trastulli, D. - Ronzoni, S. - Frascolla, S. - Perticari, G. - Elgendy, Mohamed - Varasi, M. - Colombo, E. - Giorgio, M. - Lanfrancone, L. - Minucci, S. - Mazzarella, L. - Pelicci, P. G.
Caloric restriction leads to druggable LSD1-dependent cancer stem cells expansion.
Nature Communications. Roč. 15, č. 1 (2024), č. článku 828. E-ISSN 2041-1723
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: growth-factor-i * expression analysis * gene-expression * acute-leukemia * apoptosis * differentiation * activation * trail * alpha * proliferation
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41467-023-44348-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352875 - 2.0571021 - ÚOCHB 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Fallon, T. R. - Čalounová, Tereza - Mokrejš, Martin - Weng, J. K. - Pluskal, Tomáš
transXpress: a Snakemake pipeline for streamlined de novo transcriptome assembly and annotation.
BMC Bioinformatics. Roč. 24, č. 1 (2023), č. článku 133. ISSN 1471-2105. E-ISSN 1471-2105
Grant CEP: GA ČR(CZ) GM21-11563M
GRANT EU: European Commission(XE) 891397 - KavaTarget
Institucionální podpora: RVO:61388963
Klíčová slova: de novo transcriptome assembly * RNA-seq * non-model organisms * transcriptome annotation * differential expression analysis * reproducible software * high-performance computing
Obor OECD: Computer sciences, information science, bioinformathics (hardware development to be 2.2, social aspect to be 5.8)
Impakt faktor: 3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s12859-023-05254-8
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342339Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 10.1186s12859-023-05254-8.pdf 0 1.9 MB Vydavatelský postprint povolen - 3.0563322 - ÚEB 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Batcho, Agossa Anicet - Nwogwugwu, J. O. - Ali, M. - Jabbar, B. - Javaid, A. - Fellner, Martin
Identification and characterisation of blue light photoreceptor gene family and their expression in tomato (Solanum lycopersicum) under cold stress.
Functional Plant Biology. Roč. 49, č. 7 (2022), s. 647-658. ISSN 1445-4408. E-ISSN 1445-4416
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: abiotic stress tolerance * bioinformatics * blue light signaling * expression analysis * photoreceptor genes * photosynthesis * tomato * transcriptome data
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1071/FP21297
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0335311Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2022_Batcho_FUNCTIONAL PLANT BIOLOGY_647.pdf 8 1.4 MB Jiná povolen - 4.0553251 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Herman, E.K. - Greninger, A. - van der Giezen, M. - Ginger, M. L. - Ramirez-Macias, I. - Miller, H. - Morgan, M. - Tsaousis, A. - Velle, K. - Vargova, R. - Záhonová, Kristýna - Najle, S. - MacIntyre, G. - Muller, N. - Wittwer, M. - Zysset-Burri, D. - Eliáš, M. - Slamovits, C. - Weirauch, M. - Fritz-Laylin, L. - Marciano-Cabral, F. - Puzon, G. - Walsh, T. - Chiu, C. - Dacks, Joel Bryan
Genomics and transcriptomics yields a system-level view of the biology of the pathogen Naegleria fowleri.
BMC BIOLOGY. Roč. 19, č. 1 (2021), č. článku 142. E-ISSN 1741-7007
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: primary amebic meningoencephalitis * multiple sequence alignment * nonpathogenic naegleria * rieske oxygenase * tetrahymena-thermophila * cell-differentiation * expression analysis * gene-expression * messenger-rna * protein * Illumina * RNA-Seq * Genome sequence * Protease * Cytoskeleton * Metabolism * Lysosomal * Inter-strain diversity * Neuropathogenic
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.364, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://bmcbiol.biomedcentral.com/articles/10.1186/s12915-021-01078-1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328234 - 5.0547499 - ÚVGZ 2022 RIV IE eng J - Článek v odborném periodiku
Pandey, C. - Grosskinsky, D. K. - Westergaard, J. C. - Jorgensen, H. J. L. - Svensgaard, J. - Christensen, S. - Schulz, A. - Roitsch, Thomas
Identification of a bio-signature for barley resistance against Pyrenophora teres infection based on physiological, molecular and sensor-based phenotyping.
Plant Science. Roč. 313, DEC (2021), s. 1-11. ISSN 0168-9452. E-ISSN 1873-2259
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1415
Výzkumná infrastruktura: CzeCOS III - 90123
Institucionální podpora: RVO:86652079
Klíčová slova: source-sink relationships * carbohydrate-metabolism * hydrogen-peroxide * defense-mechanisms * leaf reflectance * gene-expression * theobroma-cacao * powdery mildew * stress * disease * Crop resistance * Enzyme activity signatures * Expression analysis * Multispectral imaging * Fungal DNA * PhenoLab * Pre-symptomatic * Bio-signatures
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.363, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0168945221002685?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0323714 - 6.0547151 - MBÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mangiola, S. - Thomas, E. A. - Modrák, Martin - Vehtari, A. - Papenfuss, A. T.
Probabilistic outlier identification for RNA sequencing generalized linear models.
NAR Genomics and Bioinformatics. Roč. 3, č. 1 (2021), č. článku lqab005. E-ISSN 2631-9268
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018131
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: differential expression analysis * bayesian-analysis * family
Obor OECD: Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/nargab/article/3/1/lqab005/6155871
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0323475 - 7.0545878 - ÚEB 2022 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Náprstková, Alena - Malínská, Kateřina - Záveská Drábková, Lenka - Billey, E. - Náprstková, Dagmar - Sýkorová, Eva - Bousquet-Antonelli, C. - Honys, David
Characterization of alba family expression and localization in arabidopsis thaliana generative organs.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 22, č. 4 (2021), č. článku 1652. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-07027S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000738; GA MŠMT(CZ) LM2018129
Institucionální podpora: RVO:61389030 ; RVO:68081707
Klíčová slova: alba * Arabidopsis thaliana * Confocal microscopy * Expression analysis * Flowering * Heat stress * pabp3 * Pollen development * Protein localization
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 6.208, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
http://doi.org/10.3390/ijms22041652
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0322504Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2021_Naprstkova_INTERNATIONAL JOURNAL OF MOLECULAR SCIENCES_1652.pdf 1 10.2 MB Jiná povolen - 8.0476381 - ÚEB 2018 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Cheng, X. - Floková, Kristýna - Bouwmeester, H. - Ruyter-Spira, C.
The Role of Endogenous Strigolactones and Their Interaction with ABA during the Infection Process of the Parasitic Weed Phelipanche ramosa in Tomato Plants.
Frontiers in Plant Science. Roč. 8, MAR 24 (2017), č. článku 392. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: suppression subtractive hybridization * hemiparasite rhinanthus-minor * putative defense genes * box protein max2 * abscisic-acid * striga-hermonthica * arabidopsis-thaliana * orobanche-aegyptiaca * medicago-truncatula * expression analysis * root parasitic plant * strigolactone * abscisic acid * post-attachment resistance * plant architecture
Obor OECD: Plant sciences, botany
Impakt faktor: 3.677, rok: 2017
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0272892Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2017_Cheng_FRONTIERS IN PLANT SCIENCE_392.pdf 1 4.4 MB Jiná povolen - 9.0429940 - ÚEB 2015 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Zhang, K. - Novák, Ondřej - Wei, Z. - Gou, M. - Zhang, X. - Yu, Y. - Yang, H. - Cai, Y. - Strnad, Miroslav - Liu, Ch.-J.
Arabidopsis ABCG14 protein controls the acropetal translocation of root-synthesized cytokinins.
Nature Communications. Roč. 5, FEB 2014 (2014). E-ISSN 2041-1723
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LO1204
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) ED0007/01/01
Program: ED
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: EQUILIBRATIVE NUCLEOSIDE TRANSPORTER * EXPRESSION ANALYSIS * MERISTEM ACTIVITY
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 11.470, rok: 2014
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0234904Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2014_Zhang_NATURE COMMUNICATIONS_4274.pdf 8 1.5 MB Jiná povolen - 10.0345213 - BFÚ 2011 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hradilová, Jana - Brzobohatý, Břetislav
Expression pattern of the AHP gene family from Arabidopsis thaliana and organ specific alternative splicing in the AHP5 gene.
Biologia Plantarum. Roč. 51, č. 2 (2007), s. 257-267. ISSN 0006-3134. E-ISSN 1573-8264
Grant ostatní: GA MŠk(CZ) LN00A081; GA AV ČR(CZ) IAA600040612
Program: LN; IA
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: Arabidopsis two component systems * gene expression analysis * real time RT-PCR
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 1.259, rok: 2007
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0186534