Výsledky vyhledávání

  1. 1.
    0583120 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
    Lisnerová, Martina - Holzer, Astrid S. - Blabolil, Petr - Fiala, Ivan
    Evaluation and optimization of an eDNA metabarcoding assay for detection of freshwater myxozoan communities.
    Environmental DNA. Roč. 5, č. 2 (2023), s. 312-325. E-ISSN 2637-4943
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28399X; GA MZe(CZ) QK1920011
    Grant ostatní: AV ČR(CZ) MSM200961901
    Program: Program na podporu mezinárodní spolupráce začínajících výzkumných pracovníků
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: comparative diversity * environmental DNA * eutrophic * fish parasites * phylogeny * sediment
    Obor OECD: Ecology
    Způsob publikování: Open access
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/edn3.380
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351113
     
     
  2. 2.
    0576721 - MBÚ 2025 GB eng J - Článek v odborném periodiku
    Hakimzadeh, A. - Abdala Asbun, A. - Albanese, D. - Bernard, M. - Buchner, D. - Callahan, B. - Caporaso, J. G. - Curd, E. - Djemiel, C. - Brandstrom Durling, M. - Elbrecht, V. - Gold, Z. - Gweon, H. S. - Hajibabaei, M. - Hildebrand, F. - Mikryukov, V. - Normandeau, E. - Ozkurt, E. - M. Palmer, J. - Pascal, G. - Porter, T. M. - Straub, D. - Vasar, M. - Větrovský, Tomáš - Zafeiropoulos, H. - Anslan, S.
    A pile of pipelines: An overview of the bioinformatics software for metabarcoding data analyses.
    Molecular Ecology Resources. (2023). ISSN 1755-098X. E-ISSN 1755-0998
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17749S
    Institucionální podpora: RVO:61388971
    Klíčová slova: amplicon data analysis * bioinformatics * environmental DNA * metabarcoding * pipeline * review
    Obor OECD: Microbiology
    Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13847
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346151
     
     
  3. 3.
    0573913 - ÚVGZ 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Ferrin, M. - Penuelas, J. - Gargallo-Garriga, Albert - Iribarren, P.A. - Janssens, I. A. - Maranon Jimenez, S. - Murienne, J. - Richter, A. - Sigurdsson, B.D. - Peguero, G.
    Responses of soil hexapod communities to warming are mediated by microbial carbon and nitrogen in a subarctic grassland.
    European Journal of Soil Biology. Roč. 117, JUL-AUG (2023), č. článku 103513. ISSN 1164-5563. E-ISSN 1778-3615
    Výzkumná infrastruktura: CzeCOS IV - 90248
    Institucionální podpora: RVO:86652079
    Klíčová slova: Climate change * Environmental DNA * Metabarcoding * Microbial communities * Community composition * DOC * DON
    Obor OECD: Ecology
    Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1164556323000493?via%3Dihub
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0344292
    Název souboruStaženoVelikostKomentářVerzePřístup
    1-s2.0-S1164556323000493-main.pdf42.3 MBVydavatelský postprintpovolen
     
     
  4. 4.
    0572140 - BÚ 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
    Vasar, M. - Davison, J. - Moora, M. - Sepp, S. - Anslan, S. - Al-Quraishy, S. - Bahram, M. - Bueno, C. G. - Cantero, J. J. - Fabiano, E. C. - Decocq, G. - Drenkhan, T. - Fraser, L. - Oja, J. - Garibay-Orijel, R. - Hiiesalu, I. - Koorem, K. - Mucina, L. - Öpik, M. - Pölme, S. - Pärtel, M. - Phosri, C. - Semchenko, M. - Vahter, T. - Doležal, Jiří - Vasco-Palacios, A. M. - Tedersoo, L. - Zobel, M.
    Metabarcoding of soil environmental DNA to estimate plant diversity globally.
    Frontiers in Plant Science. Roč. 14, APR 18 2023 (2023), č. článku 1106617. ISSN 1664-462X. E-ISSN 1664-462X
    Institucionální podpora: RVO:67985939
    Klíčová slova: Metabarcoding * soil environmental DNA * plant diversity globally
    Obor OECD: Plant sciences, botany
    Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://doi.org/10.3389/fpls.2023.1106617
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346066
     
     
  5. 5.
    0559607 - BC 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
    Golpour, Amin Dehsari - Šmejkal, Marek - Čech, Martin - dos Santos, Romulo Acacio - Souza, Allan T. - Jůza, Tomáš - Martínez, Carlos - Bartoň, Daniel - Vašek, Mojmír - Draštík, Vladislav - Kolařík, Tomáš - Kočvara, Luboš - Říha, Milan - Peterka, Jiří - Blabolil, Petr
    Similarities and differences in fish community composition accessed by electrofishing, gill netting, seining, trawling, and water eDNA metabarcoding in temperate reservoirs.
    Frontiers in Ecology and Evolution. Roč. 10, Jul (2022), č. článku 913279. ISSN 2296-701X. E-ISSN 2296-701X
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: biomonitoring * environmental DNA * reservoir * sampling method * species detection
    Obor OECD: Ecology
    Impakt faktor: 3, rok: 2022
    Způsob publikování: Open access
    https://doi.org/10.3389/fevo.2022.913279
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340376
     
     
  6. 6.
    0552934 - BC 2022 RIV CZ cze J - Článek v odborném periodiku
    Blabolil, Petr
    Informace z DNA a eDNA zajímají celý svět.
    [DNA and eDNA information are interesting for the whole world.]
    Vodní hospodářství. Apr, č. 4 (2021), s. 24-26. ISSN 1211-0760
    Grant CEP: GA MZe(CZ) QK1920011
    Grant ostatní: AV ČR(CZ) StrategieAV21/21
    Program: StrategieAV
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: conference * noninvasive monitoring * environmental DNA
    Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
    Způsob publikování: Omezený přístup
    https://www.vodnihospodarstvi.cz/ArchivPDF/vh2021/vh_04-2021.pdf
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0328059
     
     
  7. 7.
    0552714 - BC 2022 RIV CZ cze Z - Poloprovoz, ověřená technologie, odrůda/plemeno
    Blabolil, Petr - Hänfling, B. - Harper, L.R. - Sellers, G. - Di Muri, C. - Griffiths, N.P. - Santos, Romulo Dos - Knežević-Jarić, Jelena - Jůza, Tomáš - Vašek, Mojmír - Čech, Martin - Muška, Milan - Fiala, Ivan - Lisnerová, Martina - Peterka, Jiří
    Vzorkování volné genetické informace (eDNA) z vody.
    [Sampling of free genetic information (eDNA) from water.]
    Interní kód: QK1920011-V16 ; 2021
    Technické parametry: Subjekt: Povodí Vltavy, státní podnik Holečkova 3178/8 Praha 5 150 00 IČO: 70889953 Datum uzavření smlouvy: V Praze dne 10. listopadu 2021
    Ekonomické parametry: Vyčíslení nákladů na zpracování vzorků závisí především na vybavenosti pracoviště. Vzhledem k vysoké citlivosti metody je nezbytné vyčlenit zvláštní místnosti pro jednotlivé kroky zpracování. Jednotlivé laboratoře musí být odděleny, čímž vzniká potřeba vybavení každé z nich. Na druhou stranu jsou používané přístroje běžným vybavením a jejich jednorázová pořizovací cena je v řádu tisíců až desetitisíců korun. Nejnákladnějším zařízením je sekvenátor, který většinou vlastní pouze specializované laboratoře, častěji je sekvenace objednávána formou služby. Rovněž bioinformatické zpracování vyžaduje výkonnou výpočetní techniku, což je ale stále dostupnější položka. Cena za zpracovaný vzorek se pohybuje od stokorun do jednotek tisíců. Vysoká citlivost této technologie odhalila přítomnost i velmi vzácných druhů ve studovaných vodních útvarech. Jejím začlenění do odlovného schématu dojde ke snížení lovného úsilí u tradičních technologií a tím i poklesu celkových nákladů na ichtyologické průzkumy.
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: noninvasive monitoring * species detection * environmental DNA
    Obor OECD: Ecology
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329674
     
     
  8. 8.
    0551524 - BC 2023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
    Ritterbusch, D. - Blabolil, Petr - Breine, J. - Erös, T. - Mehner, T. - Olin, M. - Peirson, G. - Volta, P. - Poikane, S.
    European fish-based assessment reveals high diversity of systems for determining ecological status of lakes.
    Science of the Total Environment. Roč. 802, Jan (2022), č. článku 149620. ISSN 0048-9697. E-ISSN 1879-1026
    Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_025/0007417
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: charr salvelinus-alpinus * eel anguilla-anguilla * fresh-water fishes * long-term data * environmental dna * species richness * biotic integrity * productivity gradient * relative abundances * greater-than-50 ha * Ecological indicators * Eutrophication * Sampling methods * Pressure-response
    Obor OECD: Ecology
    Impakt faktor: 9.8, rok: 2022
    Způsob publikování: Omezený přístup
    https://doi.org/10.1016/j.scitotenv.2021.149620
    Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340316
     
     
  9. 9.
    0549069 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
    Alama-Bermejo, Gema - Holzer, Astrid S.
    Review Advances and Discoveries in Myxozoan Genomics.
    Trends in Parasitology. Roč. 37, č. 6 (2021), s. 552-568. ISSN 1471-4922. E-ISSN 1471-5007
    Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-28399X
    Institucionální podpora: RVO:60077344
    Klíčová slova: proliferative kidney-disease * environmental dna * myxobolus-cerebralis * cnidarian parasite * diversity * protease * identification * fish * classification * buddenbrockia
    Obor OECD: Marine biology, freshwater biology, limnology
    Impakt faktor: 10.528, rok: 2021
    Způsob publikování: Omezený přístup
    https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1471492221000131?via%3Dihub
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0325095
     
     
  10. 10.
    0547934 - MBÚ 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
    Paskerova, G.G. - Miroliubova, T. S. - Valigurová, A. - Janouškovec, Jan - Kováčiková, M. - Diakin, A. - Sokolova, Y. Y. - V. Mikhailov, K. V. - Aleoshin, V.V. - Simdyanov, T. G.
    Evidence from the resurrected family Polyrhabdinidae Kamm, 1922 (Apicomplexa: Gregarinomorpha) supports the epimerite, an attachment organelle, as a major eugregarine innovation.
    PeerJ. Roč. 9, SEP 16 2021 (2021), č. článku e11912. ISSN 2167-8359. E-ISSN 2167-8359
    Institucionální podpora: RVO:61388971
    Klíčová slova: Eugregarinida * Intestinal parasites * Marine gregarines * Ultrastructure * SSU and LSU rDNA * Host-parasite relationships * Environmental DNA sequences * Phylogeny * Taxonomy
    Obor OECD: Microbiology
    Impakt faktor: 3.061, rok: 2021
    Způsob publikování: Open access
    https://peerj.com/articles/11912/#
    Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0324087
     
     

  Tyto stránky využívají soubory cookies, které usnadňují jejich prohlížení. Další informace o tom jak používáme cookies.