Výsledky vyhledávání
- 1.0583544 - BC 2024 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bogdan, D. F. - Baricz, A. I. - Chiciudean, I. - Bulzu, Paul-Adrian - Cristea, A. - Nastase-Bucur, R. - Levei, E. A. - Cadar, O. - Sitar, C. - Banciu, H.L. - Moldovan, O. T.
Diversity, distribution and organic substrates preferences of microbial communities of a low anthropic activity cave in North-Western Romania.
Frontiers in Microbiology. Roč. 14, Feb (2023), č. článku 962452. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-23718Y
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: level physiological profiles * altamira cave * bacterial * classification * environments * growth * carbon * microbial communities * cave ecosystems * amplicon sequencing * karst cave * community-level physiological profiles
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.962452
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351558 - 2.0582098 - BÚ 2025 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Pushkareva, E. - Elster, Josef - Kudoh, S. - Imura, S. - Becker, B.
Microbial community composition of terrestrial habitats in East Antarctica with a focus on microphototrophs.
Frontiers in Microbiology. Roč. 14, JAN 5 2024 (2024), č. článku 1323148. ISSN 1664-302X. E-ISSN 1664-302X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF22-08680L
Institucionální podpora: RVO:67985939
Klíčová slova: East Antarctica * terrestrial environment * amplicon sequencing
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 5.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.3389/fmicb.2023.1323148
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353432 - 3.0563738 - MBÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Dudáš, Martin - Pjevac, P. - Kotianová, Michala - Gančarčíková, Kateřina - Rozmoš, Martin - Hršelová, Hana - Bukovská, Petra - Jansa, Jan
Arbuscular Mycorrhiza and Nitrification: Disentangling Processes and Players by Using Synthetic Nitrification Inhibitors.
Applied and Environmental Microbiology. Roč. 88, č. 20 (2022), č. článku e0136922. ISSN 0099-2240. E-ISSN 1098-5336
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA18-04892S; GA ČR(CZ) GA21-07275S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: ammonia-oxidizing bacteria * ammonia-oxidizing archaea * amplicon sequencing * arbuscular mycorrhiza * isotopic (N-15) labeling and tracing * quantitative real-time PCR * Rhizophagus irregularis * synthetic nitrification inhibitor
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/aem.01369-22
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0335805 - 4.0554926 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Říhová, J. - Batani, G. - Rodriguez-Ruano, S. M. - Martinů, Jana - Vácha, F. - Nováková, Eva - Hypša, Václav
A new symbiotic lineage related to Neisseria and Snodgrassella arises from the dynamic and diverse microbiomes in sucking lice.
Molecular Ecology. Roč. 30, č. 9 (2021), s. 2178-2196. ISSN 0962-1083. E-ISSN 1365-294X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: amplicon sequencing * genome evolution * lice * microbiome * symbiosis
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 6.622, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://rupress.org/jem/article/218/9/e20211348/212515/A-dark-side-to-NS1-antibodies-A-dark-side-to-NS1
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329543 - 5.0552456 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Okazaki, Y. - Fujinaga, S. - Salcher, Michaela M. - Callieri, C. - Tanaka, A. - Kohzu, A. - Oyagi, H. - Tamaki, H. - Nakano, S.
Microdiversity and phylogeographic diversification of bacterioplankton in pelagic freshwater systems revealed through long-read amplicon sequencing.
Microbiome. Roč. 9, č. 1 (2021), č. článku 24. ISSN 2049-2618. E-ISSN 2049-2618
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-23469S; GA ČR(CZ) GX20-12496X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Freshwater bacterioplankton * Long-read amplicon sequencing * Microdiversity * PacBio * Phylogeography * Ribosomal internal transcribed spacers
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 16.837, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1186/s40168-020-00974-y
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0327581 - 6.0548461 - MBÚ 2022 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kolesár Fecskeová, Lívia - Piwosz, Kasia - Šantić, D. - Šestanović, S. - Tomas, A. V. - Hanusová, Martina - Šolić, M. - Koblížek, Michal
Lineage-Specific Growth Curves Document Large Differences in Response of Individual Groups of Marine Bacteria to the Top-Down and Bottom-Up Controls.
mSystems. Roč. 6, č. 5 (2021), č. článku e00934-21. ISSN 2379-5077. E-ISSN 2379-5077
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: aerobic anoxygenic phototrophs * amplicon sequencing * bacterioplankton * grazing * growth curves * growth rate * manipulation experiment * phosphorus limitation * top-down control
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.328, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/mSystems.00934-21
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0324485 - 7.0545233 - BC 2022 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Alteio, L.V. - Séneca, J. - Canarini, A. - Angel, Roey - Jansa, Jan - Guseva, K. - Kaiser, Ch. - Richter, A. - Schmidt, H.
A critical perspective on interpreting amplicon sequencing data in soil ecological research.
Soil Biology and Biochemistry. Roč. 160, September (2021), č. článku 108357. ISSN 0038-0717
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ19-24309Y; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001782; GA ČR(CZ) GA21-07275S
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:61388971
Klíčová slova: amplicon sequencing * compositional data * soil complexity * soil metabarcoding * soil microbial diversity * soil microorganisms
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (MBU-M)
Impakt faktor: 8.546, rok: 2021
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0038071721002303?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0323682 - 8.0542325 - MBÚ 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Starke, Robert - Siles, J. A. - Fernandes, Maysa Lima Parente - Schallert, K. - Benndorf, D. - Plaza, C. - Jehmlich, N. - Delgado-Baquerizo, M. - Bastida, F.
The structure and function of soil archaea across biomes.
Journal of Proteomics. Roč. 237, APR 15 (2021), č. článku 104147. ISSN 1874-3919. E-ISSN 1876-7737
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ20-02022Y
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Soil * 16S rRNA gene amplicon sequencing * Metaproteomics * Archaea * Climate * Vegetation
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.855, rok: 2021
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1874391921000464
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0319758 - 9.0531454 - MBÚ 2021 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Piwosz, Kasia - Shabarova, Tatiana - Pernthaler, J. - Posch, T. - Šimek, Karel - Porcal, Petr - Salcher, Michaela M.
Bacterial and Eukaryotic Small-Subunit Amplicon Data Do Not Provide a Quantitative Picture of Microbial Communities, but They Are Reliable in the Context of Ecological Interpretations.
mSphere. Roč. 5, č. 2 (2020), č. článku e00052-20. ISSN 2379-5042. E-ISSN 2379-5042
Grant CEP: GA ČR(CZ) GJ18-14095Y; GA ČR(CZ) GJ20-23718Y; GA ČR(CZ) GA13-00243S; GA ČR(CZ) GA19-00113S; GA ČR(CZ) GA19-23469S
Institucionální podpora: RVO:61388971 ; RVO:60077344
Klíčová slova: CARD-FISH * amplicon sequencing * bacterial communities
Obor OECD: Microbiology; Microbiology (BC-A)
Impakt faktor: 4.389, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://msphere.asm.org/content/5/2/e00052-20
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0310116 - 10.0518966 - BC 2020 RIV US eng M - Část monografie knihy
Angel, Roey
Experimental setup and data analysis considerations for DNA- and RNA-SIP experiments in the Omics Era.
Stable Isotope Probing: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology. New York: Humana Press, 2019 - (Dumont, M.; Hernández García, M.), s. 1-15. ISBN 978-1-4939-9720-6
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2015075; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001782
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: amplicon sequencing * DNA-SIP * network analysis * omics * RNA-SIP
Obor OECD: Microbiology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0303982