Výsledky vyhledávání
- 1.0555058 - BFÚ 2023 RIV CH eng J - Článek v odborném periodiku
Bartas, M. - Slychko, K. - Brázda, Václav - Cerveny, J. - Beaudoin, C. - Blundell, T. L. - Pečinka, Petr
Searching for New Z-DNA/Z-RNA Binding Proteins Based on Structural Similarity to Experimentally Validated Z alpha Domain.
International Journal of Molecular Sciences. Roč. 23, č. 2 (2022), č. článku 768. E-ISSN 1422-0067
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-21903S
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: editing enzyme adar1 * z-beta domain * handed z-dna * non-b dna * crystal-structure
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 5.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.mdpi.com/1422-0067/23/2/768
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340266 - 2.0379848 - BFÚ 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Banáš, P. - Mládek, Arnošt - Otyepka, M. - Zgarbová, M. - Jurečka, P. - Svozil, Daniel - Lankaš, Filip - Šponer, Jiří
Can we accurately describe the structure of adenine tracts in B-DNA? Reference quantum-chemical computations reveal overstabilization of stacking by molecular mechanics.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 8, č. 7 (2012), s. 2448-2460. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GD203/09/H046; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA ČR(CZ) GAP208/11/1822; GA ČR(CZ) GAP208/12/1878; GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Grant ostatní: GA ČR(CZ) GAP208/10/1742; GA ČR(CZ) GPP301/11/P558
Program: GA; GP
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040702; CEZ:AV0Z40550506
Klíčová slova: refinement of empirical force fields * DNA * Z-DNA backbone
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.389, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0215385 - 3.0379846 - BFÚ 2013 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Krepl, Miroslav - Zgarbová, M. - Stadlbauer, Petr - Otyepka, M. - Banáš, P. - Koča, J. - Cheatham III, T.E. - Jurečka, P. - Šponer, Jiří
Reference simulations of noncanonical nucleic acids with different chí variants of the AMBER force field: Quadruplex DNA, quadruplex RNA, and Z-DNA.
Journal of Chemical Theory and Computation. Roč. 8, č. 7 (2012), s. 2506-2520. ISSN 1549-9618. E-ISSN 1549-9626
Grant CEP: GA ČR(CZ) GD203/09/H046; GA ČR(CZ) GA203/09/1476; GA ČR(CZ) GAP208/11/1822; GA ČR(CZ) GBP305/12/G034
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: refinement of empirical force fields * DNA * Z-DNA backbone
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 5.389, rok: 2012
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0215383 - 4.0356600 - BFÚ 2011 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Renčiuk, Daniel - Kypr, Jaroslav - Vorlíčková, Michaela
CGG repeats associated with fragile X chromosome form left-handed Z-DNA structure.
Biopolymers. Roč. 95, č. 3 (2011), s. 174-181. ISSN 0006-3525. E-ISSN 1097-0282
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA202/07/0094; GA AV ČR(CZ) IAA100040701
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50040507; CEZ:AV0Z50040702
Klíčová slova: fragile X chromosome syndrome * Z-DNA * trinucleotide repeats
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 2.870, rok: 2011
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0195084 - 5.0126463 - BFU-R 20013023 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Kejnovská, Iva - Tůmová, Marcela - Vorlíčková, Michaela
(CGA)4: parallel, anti-parallel, right-handed and left-handed homoduplexes of a trinucleotide repeat DNA.
Biochimica et Biophysica Acta-General Subjects. Roč. 1527, 1-2 (2001), s. 73-80. ISSN 0304-4165. E-ISSN 1872-8006
Grant CEP: GA ČR GA204/98/1027; GA ČR GA204/01/0561
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5004920
Klíčová slova: DNA conformational polymorphism * circular dichroism * Z-DNA
Kód oboru RIV: BO - Biofyzika
Impakt faktor: 1.849, rok: 2000
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0024692 - 6.0125580 - BFU-R 950092 RIV SIGLE US eng J - Článek v odborném periodiku
Vorlíčková, Michaela
Conformational Transitions of Alternating Purine-Pyrimidine DNAs in Perchlorate Ethanol Solutions.
Biophysical Journal. Roč. 69, - (1995), s. 2033-2043. ISSN 0006-3495. E-ISSN 1542-0086
Grant CEP: GA ČR GA204/95/1270
Klíčová slova: confomational transitions of DNA * microsatelite DNA sequences * Z-DNA * CD-spectroscopy
Impakt faktor: 4.325, rok: 1995
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0023833 - 7.0109161 - UEB-Q 20043084 RIV IT eng J - Článek v odborném periodiku
Černá, Adriana - Cuadrado, A. - Jouve, N. - de la Espina, S. M. D. - De la Torre, C.
Z-DNA, a new in situ marker for transcription.
[Z-DNA, a new in situ marker for transcription.]
European Journal of Histochemistry. Roč. 48, č. 1 (2004), s. 49-55. ISSN 1121-760X. E-ISSN 2038-8306
Grant CEP: GA AV ČR IBS5038351
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z5038910
Klíčová slova: Allium cepa * Z-DNA immunodetection * in situ run-on transcription
Kód oboru RIV: EB - Genetika a molekulární biologie
Impakt faktor: 0.845, rok: 2004
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0016271