Výsledky vyhledávání
- 1.0586098 - MBÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pyszko, P. - Šigutová, H. - Kolařík, Miroslav - Kostovčík, Martin - Ševčík, J. - Šigut, Martin - Višňovská, Denisa - Drozd, P.
Mycobiomes of two distinct clades of ambrosia gall midges (Diptera: Cecidomyiidae) are species-specific in larvae but similar in nutritive mycelia.
Microbiology Spectrum. Roč. 12, č. 1 (2024), č. článku e0283023. ISSN 2165-0497. E-ISSN 2165-0497
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA23-07026S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: botryosphaeria-dothidea * aureobasidium-pullulans * phylogenetic analysis * oral secretions * stem galls * fungus * insect * identification * bacteria * leaf * ambrosia gall midge * Cecidomyiidae * fungiculture * Asphondylia * Lasioptera * larval mycobiome * metabarcoding * nutritive mycelium * phytomycetophagy
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://journals.asm.org/doi/10.1128/spectrum.02830-23
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353662 - 2.0585872 - MBÚ 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Odriozola Larranga, Inaki - Martinović, Tijana - Mašínová, Tereza - Bahnmann, Barbara Doreen - Machač, Antonín - Sedlák, P. - Tomšovský, M. - Baldrian, Petr
The spatial patterns of community composition, their environmental drivers and their spatial scale dependence vary markedly between fungal ecological guilds.
Global Ecology and Biogeography. Roč. 33, č. 1 (2024), s. 173-188. ISSN 1466-822X. E-ISSN 1466-8238
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17749S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: dispersal * distance decay * environmental filtering * fungal biogeography * metabarcoding * soil biodiversity * spatial community turnover
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 6.4, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/epdf/10.1111/geb.13772
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353521 - 3.0585698 - ÚBO 2025 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Mason, Bethan - Červená, Barbora - Frias, L. - Goossens, B. - Hasegawa, H. - Keuk, K. - Langgeng, A. - Majewski, K. - Matsumoto, T. - Matsuura, K. - Mendonça, R. - Okamoto, M. - Peter, S. - Petrželková, Klára Judita - Sipangkui, S. - Xu, Z. - Pafčo, Barbora - MacIntosh, A. J. J.
Novel insight into the genetic diversity of strongylid nematodes infecting South-East and East Asian primates.
Parasitology. (2024). ISSN 0031-1820. E-ISSN 1469-8161
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-16475S
Institucionální podpora: RVO:68081766
Klíčová slova: helminth * metabarcoding * non-human primate * orangutan * strongylida
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.cambridge.org/core/journals/parasitology/article/novel-insight-into-the-genetic-diversity-of-strongylid-nematodes-infecting-southeast-and-east-asian-primates/6E558FAEE8235CBF58AADD94259DF38B
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353399 - 4.0583773 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Choma, M. - Bače, R. - Čapek, P. - Kaňa, Jiří - Kaštovská, E. - Tahovská, K. - Kopáček, Jiří
Surviving trees are key elements in the fate of ectomycorrhizal community after severe bark-beetle forest disturbance.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 99, č. 8 (2023), č. článku fiad082. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA ČR GA22-05421S
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: mountain spruce forest * ips-typographus * ectomycorrhizal fungi * forest disturbance * natural regeneration * DNA metabarcoding
Obor OECD: Soil science
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1093/femsec/fiad082
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0351773 - 5.0580385 - MBÚ 2024 RIV CH eng M - Část monografie knihy
Baldrian, Petr - Kohout, Petr - Větrovský, Tomáš
Global Fungal Diversity Estimated from High-Throughput Sequencing.
Evolution of Fungi and Fungal-Like Organisms. Cham: Springer Nature, 2023 - (Pöggele, S.; James, T.), s. 227-238. The Mycota. ISBN 978-3-031-29198-2
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17749S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: Fungal diversity * High-throughput sequencing * Metabarcoding * Biogeography * Fungal ecology
Obor OECD: Microbiology
https://link.springer.com/chapter/10.1007/978-3-031-29199-9_10
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349162 - 6.0579021 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Vacher, C. - Francioni, C. - Michel, M. - Fort, Tania - D'Arcier, J. F. - Chancerel, E. - Delmotte, F. - Delmas, C. E. L.
Fungal Metabarcoding Data for Two Grapevine Varieties (Regent and Vitis vinifera'Cabernet-Sauvignon') Inoculated with Powdery Mildew (Erysiphe necator) Under Drought Conditions.
Phytobiomes Journal. Roč. 6, č. 4 (2022), s. 358-367. E-ISSN 2471-2906
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: phyllosphere * disease * drought stress * Erysiphe necator * fungal communities * grapevine * metabarcoding * plant microbiome * powdery mildew * Vitis vinifera
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://apsjournals.apsnet.org/doi/10.1094/PBIOMES-06-22-0037-A
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347927 - 7.0578266 - MBÚ 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Veselská, Tereza - Švec, Karel - Kostovčík, Martin - Peral-Aranega, E. - García Fraile, Paula - Křížková, Barbora - Havlíček, Václav - Saati-Santamaria, Zaki - Kolařík, Miroslav
Proportions of taxa belonging to the gut core microbiome change throughout the life cycle and season of the bark beetle Ips typographus.
FEMS Microbiology Ecology. Roč. 99, č. 8 (2023), č. článku fiad072. ISSN 0168-6496. E-ISSN 1574-6941
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA19-09072S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: dendroctonus-ponderosae coleoptera * picea-abies * bacterial communities * vectored fungi * diversity * spruce * plant * phytopathogenicity * visualization * verbenone * bark beetles * core microbiome * DNA and RNA metabarcoding * gut fungal and bacterial community * Ips typographus * seasonality
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 4.2, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://academic.oup.com/femsec/article/99/8/fiad072/7209148?login=true
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0347289 - 8.0576721 - MBÚ 2025 GB eng J - Článek v odborném periodiku
Hakimzadeh, A. - Abdala Asbun, A. - Albanese, D. - Bernard, M. - Buchner, D. - Callahan, B. - Caporaso, J. G. - Curd, E. - Djemiel, C. - Brandstrom Durling, M. - Elbrecht, V. - Gold, Z. - Gweon, H. S. - Hajibabaei, M. - Hildebrand, F. - Mikryukov, V. - Normandeau, E. - Ozkurt, E. - M. Palmer, J. - Pascal, G. - Porter, T. M. - Straub, D. - Vasar, M. - Větrovský, Tomáš - Zafeiropoulos, H. - Anslan, S.
A pile of pipelines: An overview of the bioinformatics software for metabarcoding data analyses.
Molecular Ecology Resources. (2023). ISSN 1755-098X. E-ISSN 1755-0998
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-17749S
Institucionální podpora: RVO:61388971
Klíčová slova: amplicon data analysis * bioinformatics * environmental DNA * metabarcoding * pipeline * review
Obor OECD: Microbiology
Impakt faktor: 7.7, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/1755-0998.13847
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0346151 - 9.0575161 - BC 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Flegontova, Olga - Lukeš, Julius - Horák, Aleš
Intragenomic diversity of the V9 hypervariable domain in eukaryotes has little effect on metabarcoding.
iScience. Roč. 26, č. 8 (2023), č. článku 107291. E-ISSN 2589-0042
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-26209S; GA ČR(CZ) GX23-06479X
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: Intragenomic * eukaryotic * metabarcoding
Obor OECD: Zoology
Impakt faktor: 5.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2589004223013688?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0345275 - 10.0575076 - BC 2024 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Schauer, B. - Thorn, Simon - Blaschke, M. - Kudernatsch, T.
Conversion of pure spruce to mixed spruce beech stands: Effects on alpha and beta diversity of multiple taxonomic groups.
Forest Ecology and Management. Roč. 545, OCT 01 (2023), č. článku 121297. ISSN 0378-1127. E-ISSN 1872-7042
Institucionální podpora: RVO:60077344
Klíčová slova: beech * spruce * metabarcoding
Obor OECD: Ecology
Impakt faktor: 3.7, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0378112723005315/pdfft?md5=1634ec6780fe73bda2e5d21506768a0d&pid=1-s2.0-S0378112723005315-main.pdf
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0349858