Výsledky vyhledávání
- 1.0572510 - ÚFE DATA Vědecká data 2023
Průša, Jiří - Cifra, Michal
Raw data for the paper Molecular dynamics simulation trajectories dataset of a kinesin on tubulin heterodimers in electric field A2103.
Popis: Molecular dynamics simulations trajectories of kinesin motor domain on microtubule in an intense electric field. Four different electric field directions, and four different field strengths were explored. The data can serve further to researchers in the field of bionanotechnology, bioelectromagnetics and biophysics.
Klíčová slova: Molecular dynamics * Electric field * Microtubule * Kinesin * Proteins
Obor OECD: Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)
DOI: https://doi.org/10.57680/asep.0572510
Handle: https://hdl.handle.net/11104/0343217
Vkladatel: admin
Datum publikování: 5.6.2023
Publikace ASEP:
Electro-detachment of kinesin motor domain from microtubule in silico
Licence: BY-NC
Název souboru Staženo Velikost Komentář Přístup X75-p1.zip Přehled souborů 18 35.6 GB povolen X30-p4.zip Přehled souborů 11 28 GB povolen Xrev100.zip Přehled souborů 11 18.7 GB povolen Z100.zip Přehled souborů 15 17 GB povolen Zrev100.zip Přehled souborů 12 25.7 GB povolen X100.zip Přehled souborů 12 40.6 GB povolen X75-p2.zip Přehled souborů 13 27.7 GB povolen X50-p2.zip Přehled souborů 12 34.9 GB povolen X50-p1.zip Přehled souborů 12 45.5 GB povolen NF.zip Přehled souborů 12 18.6 GB povolen BigBox-X100.xtc 12 4.4 GB povolen X30-p3.zip Přehled souborů 12 32.6 GB povolen X30-p2.zip Přehled souborů 12 43.3 GB povolen X30-p1.zip Přehled souborů 12 39.2 GB povolen system.tpr 10 18.6 MB povolen BigBox-system.tpr 13 26.6 MB povolen Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-06873X
Institucionální podpora: RVO:67985882 - 2.0570212 - BTÚ 2024 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Genova, M. - Gryčová, Lenka - Puttrich, Verena - Magiera, M. M. - Lánský, Zdeněk - Janke, C. - Braun, Marcus
Tubulin polyglutamylation differentially regulates microtubule-interacting proteins.
EMBO Journal. Roč. 42, č. 5 (2023). ISSN 0261-4189. E-ISSN 1460-2075
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-27477X; GA ČR(CZ) GA22-11753S; GA MŠMT(CZ) LM2015043; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: katanin * kinesin-1 * microtubule-associated Tau * microtubules * polyglutamylation * tubulin posttranslational modifications
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 11.4, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.embopress.org/doi/full/10.15252/embj.2022112101
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342621 - 3.0569530 - BTÚ 2024 RIV US eng M - Část monografie knihy
Puttrich, Verena - Rohlena, Jakub - Braun, Marcus - Lánský, Zdeněk
In Vitro Reconstitution of Molecular Motor-Driven Mitochondrial Transport.
Axonal Transport. New York: Springer Protocols, 2022 - (Vagnoni, A.), s. 533-546. ISBN 978-1-0716-1992-6
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: Adaptor proteins * Interference reflection microscopy * Kinesin-1 * Mitochondria * Molecular motors * Motility assay * TIRF microscopy * trak
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
https://link.springer.com/protocol/10.1007/978-1-0716-1990-2_28
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0342658 - 4.0567065 - ÚFE 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Havelka, Daniel - Zhernov, I. - Teplan, M. - Lánský, Z. - Chafai, Djamel Eddine - Cifra, Michal
Lab-on-chip microscope platform for electro-manipulation of a dense microtubules network.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 2462. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Grant CEP: GA ČR GA18-23597S
Institucionální podpora: RVO:67985882
Klíčová slova: kinesin motors * tubulin * migration * alignment * cells
Obor OECD: Electrical and electronic engineering
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-022-06255-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0338327 - 5.0564452 - FGÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Havelka, D. - Zhernov, Ilia - Teplan, M. - Lánský, Zdeněk - Chafai, Djamel Eddine - Cifra, M.
Lab-on-chip microscope platform for electro-manipulation of a dense microtubules network.
Scientific Reports. Roč. 12, č. 1 (2022), č. článku 2462. ISSN 2045-2322. E-ISSN 2045-2322
Institucionální podpora: RVO:67985823 ; RVO:86652036
Klíčová slova: kinesin motors * tubulin * migration * alignment * cells
Obor OECD: Neurosciences (including psychophysiology
Impakt faktor: 4.6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1038/s41598-022-06255-y
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0336114 - 6.0563713 - BTÚ 2023 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Siahaan, Valerie - Tan, R. - Humhalova, T. - Libusová, L. - Lacey, S.E. - Tan, T. - Dacy, M. - Ori-McKenney, K.M. - McKenney, R. J. - Braun, Marcus - Lánský, Zdeněk
Microtubule lattice spacing governs cohesive envelope formation of tau family proteins.
Nature Chemical Biology. Roč. 18, č. 11 (2022), s. 1224-1235. ISSN 1552-4450. E-ISSN 1552-4469
Grant CEP: GA ČR(CZ) GX19-27477X; GA ČR(CZ) GA20-04068S
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: DYNEIN-DYNACTIN * KINESIN * TUBULIN * TRAFFICKING
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 14.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.nature.com/articles/s41589-022-01096-2
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0335730 - 7.0561336 - BC 2023 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Benz, Corinna - Müller, N. - Kaltenbrunner, Sabine - Váchová, Hana - Vancová, Marie - Lukeš, Julius - Varga, Vladimír - Hashimi, Hassan
Kinetoplastid-specific X2-family kinesins interact with a kinesin-like pleckstrin homology domain protein that localizes to the trypanosomal microtubule quartet.
Molecular Microbiology. Roč. 118, č. 3 (2022), s. 155-174. ISSN 0950-382X. E-ISSN 1365-2958
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000759; GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) LL1601; GA ČR(CZ) GA20-23513S; GA ČR(CZ) GA21-09283S
Institucionální podpora: RVO:60077344 ; RVO:68378050
Klíčová slova: cytoskeleton * kinesin * microtubule quartet * microtubules * morphogenesis * Trypanosoma
Obor OECD: Microbiology; Biochemistry and molecular biology (UMG-J)
Impakt faktor: 3.6, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1111/mmi.14958
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0334793 - 8.0559189 - BTÚ 2023 RIV GB eng O - Ostatní výsledky
Sabo, Jan - Lánský, Zdeněk
Molecular motors: Turning kinesin-1 into a microtubule destroyer.
2022. Current Biology. Cell Press. Roč. 32, č. 11 (2022), R518-+. ISSN 0960-9822. E-ISSN 1879-0445
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: REPAIR * Kinesin-1 * microtubule-associated
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0960982222007151?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340734 - 9.0556796 - BFÚ 2023 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Kašpárková, Jana - Kostrhunová, Hana - Novohradský, Vojtěch - Temnov, V. - Borisova, N. - Podrugina, T. - Marková, Lenka - Štarha, Pavel - Nazarov, A. - Brabec, Viktor
Novel cis-Pt(II) Complexes with Alkylpyrazole Ligands: Synthesis, Characterization, and Unusual Mode of Anticancer Action.
Bioinorganic Chemistry and Applications. Roč. 2022, MAR 2 2022 (2022), č. článku 1717200. ISSN 1565-3633. E-ISSN 1687-479X
Grant CEP: GA ČR(CZ) GC20-14082J
Institucionální podpora: RVO:68081707
Klíčová slova: small-molecule inhibitor * coordination-compounds * mitotic kinesin * agents * cisplatin * drugs * dna
Obor OECD: Biochemistry and molecular biology
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://www.hindawi.com/journals/bca/2022/1717200/
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0340440 - 10.0541407 - BTÚ 2021 RIV GB eng J - Článek v odborném periodiku
Monzon, G. A. - Scharrel, L. - DSouza, A. - Henrichs, Verena - Santen, L. - Diez, S.
Stable tug-of-war between kinesin-1 and cytoplasmic dynein upon different ATP and roadblock concentrations.
Journal of Cell Science. Roč. 133, č. 22 (2020), č. článku jcs249938. ISSN 0021-9533. E-ISSN 1477-9137
Institucionální podpora: RVO:86652036
Klíčová slova: Kinesin * Dynein * ATP concentration * Roadblocks
Obor OECD: Cell biology
Impakt faktor: 5.285, rok: 2020
Způsob publikování: Open access
https://jcs.biologists.org/content/133/22/jcs249938
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0318967