Výsledky vyhledávání
- 1.0554635 - ÚMG 2022 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Hoboth, Peter - Šebesta, O. - Sztacho, Martin - Castano, Enrique - Hozák, Pavel
Dual-color dSTORM imaging and ThunderSTORM image reconstruction and analysis to study the spatial organization of the nuclear phosphatidylinositol phosphates.
MethodsX. Roč. 8, May (2021), č. článku 101372. E-ISSN 2215-0161
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2018129; GA MŠMT(CZ) EF16_013/0001775; GA ČR GA19-05608S; GA ČR(CZ) GA18-19714S; GA MŠMT LTC19048; GA MŠMT LTC20024; GA MŠMT(CZ) ED1.1.00/02.0109
Výzkumná infrastruktura: Czech-BioImaging II - 90129
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Immunofluorescence * Wide-field microscopy * Super-resolution microscopy * ImageJ * Nearest neighbor distance * Cell nucleus * Nuclear architecture * Nuclear speckles * son * RNA polymerase II * Fibrillarin
Obor OECD: Cell biology
Způsob publikování: Open access
https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2215016121001655?via%3Dihub
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0329333 - 2.0523231 - ÚMG 2020 RIV CZ eng M - Část monografie knihy
Čapek, Martin - Efenberková, Michaela - Novotný, Ivan - Horváth, Ondřej
The wavelet-based denoising of images in Fiji/ImageJ, with example applications in structured illumination microscopy.
Advances in Disease Models. Praha: OPTIO CZ, 2019 - (Bartůněk, P.), s. 133-142. ISBN 978-80-88011-06-4
Grant CEP: GA MŠMT LO1419
Institucionální podpora: RVO:68378050
Klíčová slova: Wavelet_Denoise * Fiji/ImageJ * illumination microscopy
Obor OECD: Cell biology
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307606 - 3.0522714 - FGÚ 2020 RIV CZ eng L4 - Software
Janáček, Jiří
Biomat.
Interní kód: BM_2020_1.0.1 ; 2019
Technické parametry: Pluginy v Biomat jsou nástroje pro detekci a analýzu kapilárního řečiště a převodního systému v srdci
Ekonomické parametry: Jedná se o volně dostupný software
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LTC17023
Institucionální podpora: RVO:67985823
Klíčová slova: tensor images * ImageJ * fiber networks * Lipschitz envelope * heat equation * Crank-Nicolson method
Obor OECD: Anatomy and morphology (plant science to be 1.6)
https://imagej.net/Biomat
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0307162 - 4.0439671 - ÚTIA 2015 CZ eng V - Výzkumná zpráva
Schier, Jan - Kovář, Bohumil - Kuneš, Michal
GenEx Software library for object detection in genetical analysis evaluation: User manual.
Praha: ÚTIA AV ČR, 2014. 24 s. Technical Report.
Grant CEP: GA TA ČR TA01010931
Institucionální podpora: RVO:67985556
Klíčová slova: image processing * ImageJ * Fluorescence microscopy * Segmentation * Particle analysis
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
http://library.utia.cas.cz/separaty/2014/ZOI/schier-0439671.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0243118Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0439671.pdf 0 706.3 KB Jiná povolen - 5.0438902 - ÚTIA 2015 RIV BE eng O - Ostatní výsledky
Schier, Jan
ImageJ plugin for the Snell segmentation method.
2014
Grant CEP: GA TA ČR TA01010931
Institucionální podpora: RVO:67985556
Klíčová slova: Image Processing * Image Segmentation * ImageJ plugin
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0243123 - 6.0438901 - ÚTIA 2015 RIV CZ eng A - Abstrakt
Schier, Jan - Kovář, Bohumil - Kuneš, Michal - Honec, P. - Číp, P. - Zemčík, P. - Dubská, M. - Kočárek, E. - Tesner, P.
An inexpensive system for quantitative analysis of mosaic form of Turner/Klinefelter syndrome.
18th International Microscopy Congress Proceedings. Prague: Czechoslovak Microscopy Society, 2014 - (Hozák, P.). ISBN 978-80-260-6721-4.
[18th International Microscopy Congress. 07.09.2014-12.09.2014, Prague]
Grant CEP: GA TA ČR TA01010931
Klíčová slova: Fluorescence microscopy * Image Processing * Cytology * ImageJ
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
http://library.utia.cas.cz/separaty/2014/ZOI/schier-0438901.pdf
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0243116Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 0438901.pdf 0 48.3 KB Autorský postprint povolen - 7.0438032 - ÚTIA 2015 RIV CZ eng L4 - Software
Schier, Jan - Kovář, Bohumil - Kuneš, M.
GenEx Software library for object detection in genetical analysis evaluation.
Interní kód: ZOI-soft-0438032 ; 2014
Technické parametry: This package contains GenEx software library for analysis of FISH microscopy image.
Ekonomické parametry: The purpose of this library is to detect round cell nuclei in the DAPI channel and fluorescence signals contained therein and to evaluate their shape and intensity parameters.
Grant CEP: GA TA ČR TA01010931
Institucionální podpora: RVO:67985556
Klíčová slova: image processing * microscopy * segmentation * object detection * object parameters * Java * ImageJ
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
http://zoi.utia.cas.cz/node/805
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0242025 - 8.0308660 - FGÚ 2008 RIV CZ eng L - Prototyp, funkční vzorek
Pilný, Vladimír - Janáček, Jiří
Anisotropic Diffusion 2D - ImageJ plugin for anisotropic diffusion filtering of 8-bit, 16-bit and RGB images.
[Anizotropní difúze 2D - modul programu ImageJ pro filtraci obrazu pomocí anizotropní difúze.]
Interní kód: AnisotropicDiffusion2D ; 2008
Technické parametry: JAVA – ImageJ plugin module
Ekonomické parametry: Open source
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA100110502
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50110509
Klíčová slova: image processing * ImageJ
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0161070 - 9.0308656 - FGÚ 2008 RIV CZ eng L - Prototyp, funkční vzorek
Štencel, Mikuláš - Janáček, Jiří
Lipschitz - ImageJ plugin for Lipschitz cover filtering of 8-bit, 16-bit and RGB images.
[Lipschitz - modul programu ImageJ pro filtraci obrazu pomocí Lipschitzovy obálky.]
Interní kód: Lipschitz ; 2008
Technické parametry: JAVA – ImageJ plugin module
Ekonomické parametry: Open source
Grant CEP: GA AV ČR(CZ) IAA100110502; GA ČR GD204/05/H023; GA AV ČR(CZ) IAA500200510
Výzkumný záměr: CEZ:AV0Z50110509
Klíčová slova: image processing * ImageJ
Kód oboru RIV: JC - Počítačový hardware a software
Trvalý link: http://hdl.handle.net/11104/0161067