Výsledky vyhledávání
- 1.0586626 - ÚEB 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Pavlů, Šimon - Nikumbh, S. - Kováčik, Martin - An, T. - Lenhard, B. - Šimková, Hana - Navrátilová, Pavla
Core promoterome of barley embryo.
Computational and Structural Biotechnology Journal. Roč. 23, DEC (2024), s. 264-277. ISSN 2001-0370. E-ISSN 2001-0370
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA21-18794S; GA MŠMT(CZ) EF16_019/0000827
Výzkumná infrastruktura: e-INFRA CZ - 90140
Institucionální podpora: RVO:61389030
Klíčová slova: Cap Analysis of Gene Expression * Core promoter * Hordeum vulgare * Initiator * Morex * TOR-signaling * Transcription regulation
Obor OECD: Genetics and heredity (medical genetics to be 3)
Impakt faktor: 6, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://doi.org/10.1016/j.csbj.2023.12.003
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0354071Název souboru Staženo Velikost Komentář Verze Přístup 2024_Pavlu_Computational and Structural Biotechnology Journal_264.pdf 1 12.7 MB Jiná povolen - 2.0586149 - ÚJF 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Danielisová, A. - Maiorano, M. P. - Chlachula, D. - Frenez, D. - Maini, E. - Daněček, D. - Trubač, J. - David-Cuny, H. - Garba, Roman
The first investigation of an Iron Age shell midden in Oman: The Nafūn complex.
Journal of Archaeological Science: Reports. Roč. 55, MAY (2024), č. článku 104501. ISSN 2352-409X
Grant CEP: GA MŠMT EF16_019/0000728
Institucionální podpora: RVO:61389005
Klíčová slova: Shell midden * Sultanate of Oman * Iron Age * Radiocarbon chronology * Long-distance contacts * Geochemistry
Obor OECD: Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)
Impakt faktor: 1.6, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1016/j.jasrep.2024.104501
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353739 - 3.0585884 - FZÚ 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Pérez-Callejo, G. - Gawne, T. - Preston, T.R. - Hollebon, P. - Humphries, O.S. - Chung, H.-K. - Dakovski, G.L. - Krzywinski, J. - Minitti, M.P. - Burian, Tomáš - Chalupský, Jaromír - Hájková, Věra - Juha, Libor - Vozda, Vojtěch - Zastrau, U. - Vinko, S. M. - Rose, S. J. - Wark, J. S.
Dielectronic satellite emission from a solid-density Mg plasma: Relationship to models of ionization potential depression.
Physical Review E. Roč. 109, č. 4 (2024), č. článku 045204. ISSN 2470-0045. E-ISSN 2470-0053
Grant CEP: GA MŠMT(CZ) LM2023068; GA ČR(CZ) GA20-08452S
Institucionální podpora: RVO:68378271
Klíčová slova: solid-density Mg plasma * x-ray free-electron laser * K-shell emission * Bragg crystal spectroscopy
Obor OECD: Fluids and plasma physics (including surface physics)
Impakt faktor: 2.4, rok: 2022
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353526 - 4.0585709 - FZÚ 2025 RIV DE eng J - Článek v odborném periodiku
Zuzak, R. - Kumar, Manish - Stoica, O. - Soler Polo, Diego Manuel - Brabec, Jiří - Pernal, K. - Veis, Libor - Blieck, R. - Echavarren, A. M. - Jelínek, Pavel - Godlewski, S.
On-surface synthesis and determination of the open-shell singlet ground state of tridecacene.
Angewandte Chemie - International Edition. Roč. 63, č. 9 (2024), č. článku e202317091. ISSN 1433-7851. E-ISSN 1521-3773
Grant CEP: GA MŠMT LM2023051; GA ČR(CZ) GA23-05486S
Institucionální podpora: RVO:68378271 ; RVO:61388955
Klíčová slova: diradicals * higher acenes * inelastic excitation * many-body calculations * open-shell compounds
Obor OECD: Condensed matter physics (including formerly solid state physics, supercond.); Physical chemistry (UFCH-W)
Impakt faktor: 16.6, rok: 2022
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0353414 - 5.0585014 - ÚJF 2025 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Burrows, M. - Launey, K. D. - Mercenne, A. - Baker, R. B. - Sargsyan, G. H. - Dytrych, Tomáš - Langr, D.
Ab initio translationally invariant nucleon-nucleus optical potentials.
Physical Review C. Roč. 109, č. 1 (2024), č. článku 014616. ISSN 2469-9985. E-ISSN 2469-9993
Grant CEP: GA ČR(CZ) GA22-14497S
Institucionální podpora: RVO:61389005
Klíčová slova: ab initio symmetry-adapted no-core shell model * Green's function * optical potentials
Obor OECD: Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)
Impakt faktor: 3.1, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://doi.org/10.1103/PhysRevC.109.014616
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352784 - 6.0584789 - ÚFE DATA Vědecká data 2024
Pandey, Saurabh K. - Cifra, Michal
Raw data of the molecular dynamics simulation trajectories and normal mode analyses of tubulin heterodimer A2205.
Popis: This dataset contains data from molecular dynamics (MD) simulations and normal mode analysis (NMA) performed on tubulin protein.
MD_parameters-structure.zip: Tubulin_dimer_model.pdb containing tubulin structure, .mdp files containing parameters for MD simulation and MD.xtc file containing the trajectory of 500ns long MD simulation.
NMA_parameters-structures.zip: .mdp files containing parameter files for NMA and five structure files as an example of each type of system containing protein with different water layers as .pdb files.
NMA was performed on five types of systems, containing different water shells around protein: protein with - no water, 3Å, 5Å, 8Å, and 10Å of water. One hundred calculations were performed for each type of system above. Results obtained and analyzed in NMA calculations are provided here: frequency and eigenvectors for first one thousand eigenmodes for each NMA calculation.
frequency_files.zip: contains five folders named as frequency_0A, frequency_3A, frequency_5A, frequency_8A, and frequency_10A for systems with no water, 3Å, 5Å, 8Å, and 10Å water layer around protein. Each of these folders contain one hundred .xvg files with frequencies of normal modes.
eigenvec-files_0A.zip: one hundred .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with only protein (i.e. no water).
eigenvec-files_3A.zip: one hundred .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 3Å water layer around protein.
eigenvec-files_5A|_p1.zip: fifty .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 5Å water layer around protein.
eigenvec-files_5A|_p2.zip: fifty .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 5Å water layer around protein.
eigenvec-files_8A|_p1.zip: fifty .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 8Å water layer around protein.
eigenvec-files_8A|_p2.zip: fifty .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 8Å water layer around protein.
eigenvec-files_10A|_p1.zip: fifty .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 10Å water layer around protein.
eigenvec-files_10A|_p2.zip: fifty .trr files containing first one thousands eigenmodes obtained from NMA for systems with 10Å water layer around protein.
Klíčová slova: normal mode analysis * tubulin * subTHz * hydration shell
Obor OECD: Atomic, molecular and chemical physics (physics of atoms and molecules including collision, interaction with radiation, magnetic resonances, Mössbauer effect)
DOI: https://doi.org/10.57680/asep.0584789
Handle: https://hdl.handle.net/11104/0352684
Vkladatel: admin
Datum publikování: 4.4.2024
Licence: CC BY-NC-SA 4.0 - Uveďte původ + Neužívejte komerčně + Zachovejte licenci Mezinárodní licence
Název souboru Staženo Velikost Komentář Přístup MD_parameters-structure.zip Přehled souborů 8 44.5 GB povolen eigenvec-files_10A_p2.zip Přehled souborů 6 47.2 GB povolen eigenvec-files_10A_p1.zip Přehled souborů 7 43.2 GB povolen eigenvec-files_8A_p2.zip Přehled souborů 6 41.6 GB povolen eigenvec-files_8A_p1.zip Přehled souborů 9 38.2 GB povolen eigenvec-files_3A.zip Přehled souborů 6 48.8 GB povolen eigenvec-files_0A.zip Přehled souborů 7 31.2 GB povolen eigenvec-files_5A_p1.zip Přehled souborů 7 27.9 GB povolen eigenvec-files_5A_p2.zip Přehled souborů 6 34.1 GB povolen NMA_parameters-structures.zip Přehled souborů 6 2.2 MB povolen frequency_files.zip Přehled souborů 14 6.3 MB povolen Grant CEP: GA ČR(CZ) GX20-06873X; GA MŠMT(CZ) LM90254
Institucionální podpora: RVO:67985882 - 7.0584365 - ARÚ 2025 RIV NL eng J - Článek v odborném periodiku
Danielisová, Alžběta - Maiorano, M. P. - Chlachula, Dominik - Frenez, D. - Maini, E. - Daněček, David - Trubač, J. - David-Cuny, H. - Garba, Roman
The first investigation of an Iron Age shell midden in Oman: The Nafūn complex.
Journal of Archaeological Science: Reports. Roč. 55, May (2024), č. článku 104501. ISSN 2352-409X
Grant ostatní: AV ČR(CZ) AP2203
Program: Akademická prémie - Praemium Academiae
Institucionální podpora: RVO:67985912 ; RVO:68081758
Klíčová slova: shell midden * Sultanate of Oman * Iron Age * radiocarbon chronology * long-distance contacts * geochemistry
Obor OECD: Archaeology; Archaeology (ARUB-Q)
Impakt faktor: 1.6, rok: 2022
Způsob publikování: Omezený přístup
https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S2352409X24001299?via%3Dihub
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352286 - 8.0584353 - ÚFE 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Bartoň, Ivo - Franczyk, M. - Peterka, Pavel - Aubrecht, Jan - Vařák, Petr - Kamrádek, Michal - Podrazký, Ondřej - Kasztelanic, R. - Buczynski, R. - Kašík, Ivan
Optimization of erbium and ytterbium concentration in nanostructured core fiber for dual-wavelength fiber lasers.
Proceedings of SPIE - The International Society for Optical Engineering. Vol. 12573. Bellingham: SPIE, 2023 - (Kalli, K.; Mendez, A.; Peterka, P.), 1257311. ISBN 978-151066266-7. ISSN 0277-786X. E-ISSN 1996-756X.
[The International Society for Optical Engineering-Specialty Optical Fibres 2023. Praha (CZ), 24.04.2023-27.04.2023]
Grant CEP: GA ČR(CZ) GF21-45431L
Institucionální podpora: RVO:67985882
Klíčová slova: Dual wavelength * Fiber laser * Nanostructured core
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12573/1257311/Optimization-of-erbium-and-ytterbium-concentration-in-nanostructured-core-fiber/10.1117/12.2666703.short#_=_
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352275 - 9.0584352 - ÚFE 2024 RIV US eng C - Konferenční příspěvek (zahraniční konf.)
Jasim, Ali - Borodkin, Andrei - Grábner, Martin - Podrazký, Ondřej - Honzátko, Pavel
Adjusting the Transmission Bands of the Negative Curvature Hollow-core Fibers.
Proceedings of SPIE - The International Society for Optical Engineering. Vol. 12568. Bellingham: SPIE, 2023 - (Kuzmiak, V.; Stefaniuk, T.; Staliunas, K.), č. článku 125730Y. ISBN 978-151066256-8. ISSN 0277-786X. E-ISSN 1996-756X.
[The International Society for Optical Engineering-Specialty Optical Fibres 2023. Praha (CZ), 24.04.2023-27.04.2023]
Institucionální podpora: RVO:67985882
Klíčová slova: Antiresonant negative curvature hollow-core fibers * CO2 laser * Heat treatment * Hollow-core fibers * Optical fiber drawing * Transmission bands
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/12573/125730Y/Adjusting-the-transmission-bands-of-the-negative-curvature-hollow-core/10.1117/12.2665709.short
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352274 - 10.0584155 - ÚFP 2024 RIV US eng J - Článek v odborném periodiku
Niewiem, W. - Polák, K. - Dušek, M. - Mergelkuhl, D. - Gayde, J.Ch. - Wieser, A. - Šulc, Miroslav
Variation of structured laser beam pattern and optimization for an alignment reference line creation.
Optics Express. Roč. 31, č. 26 (2023), s. 43307-43322. ISSN 1094-4087
Institucionální podpora: RVO:61389021
Klíčová slova: structured laser beam * alignment * inner core
Obor OECD: Optics (including laser optics and quantum optics)
Impakt faktor: 3.8, rok: 2022
Způsob publikování: Open access
https://opg.optica.org/oe/fulltext.cfm?uri=oe-31-26-43307&id=544211
Trvalý link: https://hdl.handle.net/11104/0352143