Počet záznamů: 1
Identification of a Novel Retrotransposon with Sex Chromosome-Specific Distribution in Silene latifolia
- 1.
SYSNO ASEP 0436625 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Identification of a Novel Retrotransposon with Sex Chromosome-Specific Distribution in Silene latifolia Tvůrce(i) Králová, Tereza (BFU-R)
Čegan, Radim (BFU-R) RID, ORCID
Kubát, Zdeněk (BFU-R) RID, ORCID
Vrána, Jan (UEB-Q) RID, ORCID
Vyskot, Boris (BFU-R) RID, ORCID
Vogel, Ivan (BFU-R)
Kejnovský, Eduard (BFU-R) RID, ORCID
Hobza, Roman (BFU-R) RID, ORCIDCelkový počet autorů 8 Zdroj.dok. Cytogenetic and Genome Research. - : Karger - ISSN 1424-8581
Roč. 143, 1-3 (2014), s. 87-95Poč.str. 9 s. Forma vydání Tištěná - P Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CH - Švýcarsko Klíč. slova Microdissection ; Sex chromosomes ; Silene latifolia (white campion) Vědní obor RIV BO - Biofyzika Vědní obor RIV – spolupráce Ústav experimentální botaniky - Botanika CEP LM2010005 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GAP501/10/0102 GA ČR - Grantová agentura ČR GAP501/12/2220 GA ČR - Grantová agentura ČR GAP305/10/0930 GA ČR - Grantová agentura ČR GA522/09/0083 GA ČR - Grantová agentura ČR LO1204 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy Institucionální podpora BFU-R - RVO:68081707 UT WOS 000342614100009 DOI 10.1159/000362142 Anotace Silene latifolia is a dioecious plant species with chromosomal sex determination. Although the evolution of sex chromosomes in S. latifolia has been the subject of numerous studies, a global view of X chromosome structure in this species is still missing. Here, we combine X chromosome microdissection and BAC library screening to isolate new X chromosome-linked sequences. Out of 8 identified BAC clones, only BAC 86M14 showed an X-preferential signal after FISH experiments. Further analysis revealed the existence of the Athila retroelement which is enriched in the X chromosome and nearly absent in the Y chromosome. Based on previous data, the Athila retroelement belongs to the CL3 group of most repetitive sequences in the S. latifolia genome. Structural, transcriptomics and phylogenetic analyses revealed that Athila CL3 represents an old clade in the Athila lineage. We propose a mechanism responsible for Athila CL3 distribution in the S. latifolia genome. (C) 2014 S. Karger AG, Basel Pracoviště Biofyzikální ústav Kontakt Jana Poláková, polakova@ibp.cz, Tel.: 541 517 244 Rok sběru 2015
Počet záznamů: 1