Počet záznamů: 1
Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography–Hydrogen/Deuterium Exchange–Mass Spectrometry (HILIC-HDX-MS) for Untargeted Metabolomics
- 1.
SYSNO ASEP 0583841 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Hydrophilic Interaction Liquid Chromatography–Hydrogen/Deuterium Exchange–Mass Spectrometry (HILIC-HDX-MS) for Untargeted Metabolomics Tvůrce(i) Čajka, Tomáš (FGU-C) RID, ORCID, SAI
Hricko, Jiří (FGU-C)
Rakušanová, Stanislava (FGU-C) ORCID
Brejchová, Kristýna (FGU-C) ORCID, RID, SAI
Nováková, Michaela (FGU-C)
Rudl Kulhavá, Lucie (FGU-C) ORCID, RID
Holá, Veronika (FGU-C)
Paučová, Michaela (FGU-C)
Fiehn, O. (US)
Kuda, Ondřej (FGU-C) RID, ORCID, SAIČíslo článku 2899 Zdroj.dok. International Journal of Molecular Sciences. - : MDPI - ISSN 1661-6596
Roč. 25, č. 5 (2024)Poč.str. 16 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. CH - Švýcarsko Klíč. slova metabolomics ; liquid chromatography ; mass spectrometry ; hydrogen/deuterium exchange ; unknown identification Obor OECD Analytical chemistry CEP LX22NPO5104 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GA20-21114S GA ČR - Grantová agentura ČR GA21-00477S GA ČR - Grantová agentura ČR Výzkumná infrastruktura e-INFRA CZ II - 90254 - CESNET, zájmové sdružení právnických osob Způsob publikování Open access Institucionální podpora FGU-C - RVO:67985823 UT WOS 001182795100001 EID SCOPUS 85187683610 DOI 10.3390/ijms25052899 Anotace Liquid chromatography with mass spectrometry (LC-MS)-based metabolomics detects thousands of molecular features (retention time–m/z pairs) in biological samples per analysis, yet the metabolite annotation rate remains low, with 90% of signals classified as unknowns. To enhance the metabolite annotation rates, researchers employ tandem mass spectral libraries and challenging in silico fragmentation software. Hydrogen/deuterium exchange mass spectrometry (HDX-MS) may offer an additional layer of structural information in untargeted metabolomics, especially for identifying specific unidentified metabolites that are revealed to be statistically significant. Here, we investigate the potential of hydrophilic interaction liquid chromatography (HILIC)-HDX-MS in untargeted metabolomics. Specifically, we evaluate the effectiveness of two approaches using hypothetical targets: the post-column addition of deuterium oxide (D2O) and the on-column HILIC-HDX-MS method. To illustrate the practical application of HILIC-HDX-MS, we apply this methodology using the in silico fragmentation software MS-FINDER to an unknown compound detected in various biological samples, including plasma, serum, tissues, and feces during HILIC-MS profiling, subsequently identified as N1-acetylspermidine. Pracoviště Fyziologický ústav Kontakt Lucie Trajhanová, lucie.trajhanova@fgu.cas.cz, Tel.: 241 062 400 Rok sběru 2025 Elektronická adresa https://www.mdpi.com/1422-0067/25/5/2899
Počet záznamů: 1