Počet záznamů: 1
Regulatory dynamics of gene expression in the developing male gametophyte of Arabidopsis
- 1.
SYSNO ASEP 0575767 Druh ASEP J - Článek v odborném periodiku Zařazení RIV J - Článek v odborném periodiku Poddruh J Článek ve WOS Název Regulatory dynamics of gene expression in the developing male gametophyte of Arabidopsis Tvůrce(i) Klodová, Božena (UEB-Q) ORCID
Potěšil, D. (CZ)
Steinbachová, Lenka (UEB-Q) ORCID, RID
Michailidis, Christos (UEB-Q) ORCID
Lindner, A.C. (DE)
Hackenberg, D. (GB)
Becker, J. D. (PT)
Zdráhal, Z. (CZ)
Twell, D. (GB)
Honys, David (UEB-Q) RID, ORCIDCelkový počet autorů 10 Zdroj.dok. Plant Reproduction. - : Springer - ISSN 2194-7953
Roč. 36, č. 3 (2023), s. 213-241Poč.str. 29 s. Jazyk dok. eng - angličtina Země vyd. DE - Německo Klíč. slova Arabidopsis ; Male gametophyte ; RNA-seq ; Proteome Obor OECD Plant sciences, botany CEP LTC18034 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy EF16_019/0000738 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LTAUSA18115 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LTC20028 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy LTC20050 GA MŠMT - Ministerstvo školství, mládeže a tělovýchovy GA21-15856S GA ČR - Grantová agentura ČR GA19-01723S GA ČR - Grantová agentura ČR Způsob publikování Open access Institucionální podpora UEB-Q - RVO:61389030 UT WOS 000871865600001 EID SCOPUS 85161836853 DOI 10.1007/s00497-023-00471-w Anotace Sexual reproduction in angiosperms requires the production and delivery of two male gametes by a three-celled haploid male gametophyte. This demands synchronized gene expression in a short developmental window to ensure double fertilization and seed set. While transcriptomic changes in developing pollen are known for Arabidopsis, no studies have integrated RNA and proteomic data in this model. Further, the role of alternative splicing has not been fully addressed, yet post-transcriptional and post-translational regulation may have a key role in gene expression dynamics during microgametogenesis. We have refined and substantially updated global transcriptomic and proteomic changes in developing pollen for two Arabidopsis accessions. Despite the superiority of RNA-seq over microarray-based platforms, we demonstrate high reproducibility and comparability. We identify thousands of long non-coding RNAs as potential regulators of pollen development, hundreds of changes in alternative splicing and provide insight into mRNA translation rate and storage in developing pollen. Our analysis delivers an integrated perspective of gene expression dynamics in developing Arabidopsis pollen and a foundation for studying the role of alternative splicing in this model. Pracoviště Ústav experimentální botaniky Kontakt David Klier, knihovna@ueb.cas.cz, Tel.: 220 390 469 Rok sběru 2024 Elektronická adresa https://doi.org/10.1007/s00497-023-00471-w
Počet záznamů: 1